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Name : Msm_0234 (Msm_0234) Accession : YP_001272807.1 Strain : Methanobrevibacter smithii ATCC 35061 Genome accession: NC_009515 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ammonium transporter Function : - COG functional category : P : Inorganic ion transport and metabolism COG ID : COG0004 EC number : - Position : 221755 - 222972 bp Length : 1218 bp Strand : - Note : COG0004 DNA sequence : ATGGATATATTTAGCGCAGGTGATACAGCTTGGGTTCTTGTTTGTAGTCTTTTAGTACTTTTAATGAGTATTCCGGCTGT TGCATTCTTTTATGGTGGTTTAAGTAAACGTAAAAATGTTTTAAATACTATGTTTTTAACCTTTATTGCATTTTCAATTG TAAGTGTTATTTGGGTTATTTTCGGTTATCAATTTGCCTTTGGAACTCCGTTACTGGGAGGATTTATAGGAAGCCCTTCT AATTTCTTCTTAAGTGGAATCGGACTTGATGATTTAAGCGGAACTATTCCAACACTATTGTTTGTTATGTTCCAACTTGC ATTTGCAGGTCTAACAGCAGCATTGATTTCTGGTGGTGTTGTTGGAAGAATGAAAACAAAAGCTTGGGTAATTTTTATCC CGATTTGGGCTTGTCTTGTCTATATCCCTATTGCTCACTGGGTATGGGGTGGAGGATGGTTAATGAATATGGGAGCACTT GATTTCGCAGGTGGTACTGTTGTACACATTAACTCAGGGGTTTCTGCATTAGCTATCGCACTTGTATTAGGTAAAAGAAA AGACATTTCATTATTACCACATAACTTAGGATATGCAGTATTAGGTGCAGCACTTCTATGGTTCGGATGGATGGGATTCA ACGGAGGATCCGGTTTAGGTGCAAATGGTCTTGCAGCAAATGCAATTATTGTTTCAAATGTTGCAGCTGCAGCAGCTTTA ATTGTCTGGACTATATTAGATACAATTGTTGTTGGTAAACCAACTGTTCTTGGTGCAATCTCTGGAGGAATTGCTGGTTT AGTAGCTATTACTCCTGCAGCAGGATTTGTTGATGTTCCTGGAGCATTAGTAATTGGTGCAGTAGCTCCTTTAGTATCTT ACTTTGCAATTTATTACTTAAAAGCAAAACTCGGTTACGACGATGCATTAGACGTATTCGGTATACACGGTATGTCTGGT ATATGGGGAGCAATCGCTACTGGTATCTTTGCAGCACCATATATTAATGAAGCAGCAGGATTATTATATGGAAACCCATA TCAAGTTGTAATACAAATAATAAGTGTAGTAGCTACTATTGTTTATGCATTTGTAATAAGCTATGTATTAGCTAAAGTAC TTGACAAAGCTATGGGCGGTATCAGAGTAGAAGATGAAGCTGAAGTTGTAGGATTAGATACAAAACTTCACGAAGAATCT GCATACAATTTTAACTAG Protein sequence : MDIFSAGDTAWVLVCSLLVLLMSIPAVAFFYGGLSKRKNVLNTMFLTFIAFSIVSVIWVIFGYQFAFGTPLLGGFIGSPS NFFLSGIGLDDLSGTIPTLLFVMFQLAFAGLTAALISGGVVGRMKTKAWVIFIPIWACLVYIPIAHWVWGGGWLMNMGAL DFAGGTVVHINSGVSALAIALVLGKRKDISLLPHNLGYAVLGAALLWFGWMGFNGGSGLGANGLAANAIIVSNVAAAAAL IVWTILDTIVVGKPTVLGAISGGIAGLVAITPAAGFVDVPGALVIGAVAPLVSYFAIYYLKAKLGYDDALDVFGIHGMSG IWGAIATGIFAAPYINEAAGLLYGNPYQVVIQIISVVATIVYAFVISYVLAKVLDKAMGGIRVEDEAEVVGLDTKLHEES AYNFN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| BJAB0868_00291 | YP_008211617.1 | Ammonia permease | Not tested | AbaR26 | Protein | 8e-67 | 50 |
| BJAB07104_00287 | YP_008207752.1 | Ammonia permease | Not tested | AbaR25 | Protein | 8e-67 | 50 |
