Gene Information

Name : Lreu_0671 (Lreu_0671)
Accession : YP_001271273.1
Strain : Lactobacillus reuteri DSM 20016
Genome accession: NC_009513
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : HK97 family phage portal protein
Function : -
COG functional category : S : Function unknown
COG ID : COG4695
EC number : -
Position : 737645 - 738763 bp
Length : 1119 bp
Strand : +
Note : TIGRFAM: phage portal protein, HK97 family; PFAM: phage portal protein

DNA sequence :
ATGGGCCTATTTAGTAAGAGAACAACGACTACAAGCGCACAAGATCCATTTCTAGAGGCTCTAGTAAGTCTTTCCAGTAA
TGATCCTAATGCTTATGTTAGTGCTTCGGCTTTACGTAATAGTGATATATTTGCTGCAATTAGTTCTATCGCTGGTGATC
TTGCCAGTAATCCGATTAAGTCTAGTTCTAGCCTATATAACAAGATGATTAATGATCATCCTAACGAGTTAATGGACGGC
AGAAGTTTCAAGTACGCCCTAGCGGTTGAAATGCTATTAAATGGTAATGCGTTTGCCGAAATTGATTTAAGTTCACACAC
GCTAAATTTTATTCCTAACAATAAATTAACTGTCCAGCAAGATGATGTAACGCAAAAGCTGACTTACACATACAGCCCAG
ATGGACGTATTAAGCGAGTAATTGCCTCTTCTAACATCTTACATTTTAAGTATTTTACCCGTGATGGTTTAGTCGGACTA
TCGCCACTGTATGCGCTAAAAGATGAAATGAAGATACAGGCGGCTGGAAACAGGTTAATGACTGGATTCTTTAATAATGG
AATTCATGGCACAACAGTTGTCCAAGTCCACCAAGCTGATCTTAGTTCGGATGGTAAAGAGAATATTAGAAAACAATTTG
ATGAGGCAACTACCGGTAATAATTCACTTAACACAATTGTTACTGATGATGGTATGGACGTTAAAAGCCTACCACTTAAT
ACAGACGTGTTAAAGCTAGTAAATTCTAATGACTGGAATACCCGTCAAATTGCGAAAGCGTTCGGACTACCACCCGAGCG
TTTAGGTGTAGAAAACGAGCATAGCAACCAACAACAAAGTAACGTTCAGTATTTACAAGGTACTTTACAGCACTATGAAG
ATTGCTTTACTTCTGAATTGAACTACAAGCTAGGGCAAGATTTTAGCTTTGATAATAGCAAGCTATTAAGCCTTGACCCG
TCCGCTCAACAGCAGATGGCAGTTGATGGTTATGTTAACGGTATCTACACACGCAATGAAGCCCGAGCCTTACTTAATTT
AGTGCCAGTAACTAATGGAGATAATTTTATTGAAAAAGAAGGAGGAGTTACAGCCAATGGAGAAACGACTAACAACTAA

Protein sequence :
MGLFSKRTTTTSAQDPFLEALVSLSSNDPNAYVSASALRNSDIFAAISSIAGDLASNPIKSSSSLYNKMINDHPNELMDG
RSFKYALAVEMLLNGNAFAEIDLSSHTLNFIPNNKLTVQQDDVTQKLTYTYSPDGRIKRVIASSNILHFKYFTRDGLVGL
SPLYALKDEMKIQAAGNRLMTGFFNNGIHGTTVVQVHQADLSSDGKENIRKQFDEATTGNNSLNTIVTDDGMDVKSLPLN
TDVLKLVNSNDWNTRQIAKAFGLPPERLGVENEHSNQQQSNVQYLQGTLQHYEDCFTSELNYKLGQDFSFDNSKLLSLDP
SAQQQMAVDGYVNGIYTRNEARALLNLVPVTNGDNFIEKEGGVTANGETTNN

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
HMPREF0351_12128 YP_006376734.1 bacteriophage portal protein Not tested Not named Protein 2e-76 49