Gene Information

Name : potB (CBO0562)
Accession : YP_001253105.1
Strain : Clostridium botulinum ATCC 3502
Genome accession: NC_009495
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : spermidine/putrescine ABC transporter permease
Function : -
COG functional category : E : Amino acid transport and metabolism
COG ID : COG1176
EC number : -
Position : 661308 - 662267 bp
Length : 960 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGTGGGGGAAATTTAGCAGTGCTTTTTCAAATATTTTTAAAAAGCAATTGCATAATAAAAATACAGATATTAGCTTAGA
AAGCAAAGAAGGAATAAGAGGTAAACTAAAAAAATCTACCCCTATATTTAAAACAGTGGGGCCCGTTGCCCTATGGCTCA
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CCTTTTACACTAAAAAATTATAAAAGACTCATAGATCCTATGTACGGACAAATTTTAATTAAAACTTTAATGATTTCTAT
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ATTATAGCAGGATGTATGCTAGTATTTATACCAACCTTAGGTTATTTCTTTATATCTGACTTAATGGGTGGAAGTAAAAC
TATGTTAATTTCAAATCTAATTAAAAACCAATTTTTAACCTCTAGAGATTGGCCCTTTGGTTCGGCTATAGCAGTAATAT
TAATTATTTTAATGCTTATAGCTATAAGTTTCTATTTTAAAGGAAATAAACCAAAGAAGGGAATAAAGGAGGTTAACTAA

Protein sequence :
MWGKFSSAFSNIFKKQLHNKNTDISLESKEGIRGKLKKSTPIFKTVGPVALWLITFFIVPLLLVLVVSFLSRGEYGDVTL
PFTLKNYKRLIDPMYGQILIKTLMISISTTLGCLIIGYPFAYFIGRSDKKYRGLLLLLVILPFWTNSLVRTYAWIILLKT
EGVINTYLMRFGLIHSPMQMLYTDSAVFIGMLYIMLPFMVLPIYTSIEKLDMSYIEAANDLGASPYKTFKEITLPLTLPG
IIAGCMLVFIPTLGYFFISDLMGGSKTMLISNLIKNQFLTSRDWPFGSAIAVILIILMLIAISFYFKGNKPKKGIKEVN

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
potB BAA36746.1 - Not tested LIM Protein 1e-60 51