Name : nagE (CBO2839) Accession : YP_001255338.1 Strain : Clostridium botulinum ATCC 3502 Genome accession: NC_009495 Putative virulence/resistance : Unknown Product : PTS system, N-acetylglucosamine-specific, IIBC component Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG1263 EC number : 2.7.1.69 Position : 3012881 - 3014323 bp Length : 1443 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGCAAAAAACAGTAAATTTTTATCAAAAATTCAAAGGCTAGGAAAATCTCTTATGACTCCTATTGCTGTATTACCAGC AGCTGCTTTACTACTTAGGTTAGGTCAGCCCGATATCTGGAGTTGGGCTGGTTCTTTACCAAGTGGTATTCCTTGGATGT CTTCAGCAGGTTCCGCAATTTTTGATAACTTATCCCTTATTTTTGCTATAGGCATAGCTGTAGGATTGGCAGAGGAAAAT AATGGCGTTGCTGCGATTTCTGCTACTGTTGGCTACCTTGTGCTAACAAATGTTTCTTTAAAATTTGATGATACAATTAA TATGGGAGTTTTATCAGGTATAATTGTAGGTATATTATCTGCATCACTTTATAATAAATATAAAAATATTAAACTTCCAG ATTATCTAGGTTTCTTTGGAGGGAAACGTTTTGTTCCAATTATAACTTCTTTATACTCTTTAATTTTAGGTATTATATCA GGATTTGTATGGCCTCCAATTCAAAATGTTATAAATAATTTTGGTAACGCAGTTGCAGGAGCCGGTGCCATCGGAGCATT TTTCTTTGGATTATTTAATAGATTGTTGATTCCAACTGGATTACACCATATTATGAACACAATATTTTGGTTCCAATTTG GTACATTTAAAAATCCAGCAGGTAAAATTGCTAATGGAGATTTAAATAGATTTTTCGCTGGAGATCCTACTGCAGGAACT TATATGACTGGTTTTTTTGTAATAATGATGTTTGCTCTTCCTGCAGCCTGTTTTGCTATGGTCAAAGCTGCTAGGGAAGA AAATAAAAAAGCAGTTTCAGGTATGCTTTTAGGTTTAGCATTTACTGCATTCCTTACAGGAGTTACTGAACCAATAGAAT TTACTTTTATGTTTATTTCTCCTGTTCTTTATGCAATACATGCTTTGTTAACTGGTATAGCCCTAGCCCTTACATCAGGC TTAGGAATAAAATGTGGATTTGGATTTTCTGCAAGTCTTATAGATTATGGTCTTAATTTTGGTATATCAACTAAACCACT ATTTATAATTCCCATAGGTTTAATATTTGCAGCAATATACTACTTTTTATTCTTATTCTTTATAAAAAAATTCAATTTAC CTACACCAGGAAGGGAATTAGATTCAGAAGTTAATACAAATATCAATGTTGATACGCCTAAAAAAAGTGGACACTCTAAA TTAGAAGATAAAGCTAAAGGAATACTAAACGCTATCGGTAATTCTGAAAATATTGATTCTATAGATGCTTGTGTAACTAG AATAAGACTTGTTGTTTTTGATGGAAGCAAAATAAATGAAGCTAAACTTAAAGAATTAGGCGCTAATGGAATTATGAAGC TTGATGATAAAAATTTCCAAATAGTGGTTGGTACTATAGCTGACCCTTTAGTATCTCAAATGAAACTATTAATGAAAAAA TAA Protein sequence : MAKNSKFLSKIQRLGKSLMTPIAVLPAAALLLRLGQPDIWSWAGSLPSGIPWMSSAGSAIFDNLSLIFAIGIAVGLAEEN NGVAAISATVGYLVLTNVSLKFDDTINMGVLSGIIVGILSASLYNKYKNIKLPDYLGFFGGKRFVPIITSLYSLILGIIS GFVWPPIQNVINNFGNAVAGAGAIGAFFFGLFNRLLIPTGLHHIMNTIFWFQFGTFKNPAGKIANGDLNRFFAGDPTAGT YMTGFFVIMMFALPAACFAMVKAAREENKKAVSGMLLGLAFTAFLTGVTEPIEFTFMFISPVLYAIHALLTGIALALTSG LGIKCGFGFSASLIDYGLNFGISTKPLFIIPIGLIFAAIYYFLFLFFIKKFNLPTPGRELDSEVNTNINVDTPKKSGHSK LEDKAKGILNAIGNSENIDSIDACVTRIRLVVFDGSKINEAKLKELGANGIMKLDDKNFQIVVGTIADPLVSQMKLLMKK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
ef0067 | AAM75272.1 | EF0067 | Not tested | Not named | Protein | 2e-55 | 41 |