Gene Information

Name : CBO1409 (CBO1409)
Accession : YP_001253926.1
Strain : Clostridium botulinum ATCC 3502
Genome accession: NC_009495
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : C4-dicarboxylate transporter
Function : -
COG functional category : S : Function unknown
COG ID : COG1288
EC number : -
Position : 1535500 - 1537035 bp
Length : 1536 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGGGGGGGATTGTTGTGACAAAAAAGAAAAAGAAAATAAGCTTTCCGACAGCTTTTACGGTATTGTTTATTGTATTAAT
TATTGCAGCTATACTTACTTATGTAGTTCCAGCTGGATCTTATTCAAAATTAAGTTATGATAACGATAGTAAAGTTTTTG
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GGTTAAAAAAGATCCAAGCAAATCTATAATATATGAACAAAGGAAAGAAATACAAGAGAAGTTTTTAAAAGATTATAGTA
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TGGGGTGTAGCTTATAAAAAATGGTGGTTTACTGAGATGACAGCTCTGTTCCTTGTTGTAGGGATTATTTTAGGTGTAAT
CTCACGAATGGGAGAAAAGAATTTTGTAGATAAGTTTGTAGCTGGTTCAGCTGATTTGGTAGGAGTTGCATTAGTAATTG
GAGTTGCAAGATCTATTAATCTTGTTATGGAAAATGGAATGATTTCTGATACAATTTTGTATCATTCTTCAAATATGATA
TCAGGGATGAATTCTAGTGTATTTATAATATTTATGTTAATTGTATTTATAGGACTTGGATTTTTTATACCATCATCTTC
AGGACTTGCAGTGCTTTCAATGCCTATTATGGCACCTCTAGCAGACAGTGTAGGATTGCCAAGAGAGACTATAGTAAATG
CTTATATGTTTGGCCAGGGATTAATTTCATTCATAACTCCAACAGGGCTTATATTAGCTACATTAGCTATGGTAGATGTT
ACTTATGATAAATGGATTAAATTTATAATGCCACTTATGGGATATATAGCAGCCTTATCAGCTATAATGTTATTAATACA
AAGCTTTGTTGCTTAG

Protein sequence :
MGGIVVTKKKKKISFPTAFTVLFIVLIIAAILTYVVPAGSYSKLSYDNDSKVFVVTKPDESTNELPATQKTLDKLKIKVS
VEKFKDGSINKPVAIPDTYEQVEQKPQGFFEVIEAPIKGVYDTIDIIMFVLILGGVIGVVNSSGAFDAGIAKLSVATKGK
EYLLIVIITTLIALGGTTFGLAEETIALYPILVPVFIAAGYDALVCIAALYMGSSIGTMFATVNPFSVVIASNTSGISIA
SGFIFRIVGLILAVAITIVYIVKYGVKVKKDPSKSIIYEQRKEIQEKFLKDYSKDDVTLKFSLGRKLMLIIFALTFVVMI
WGVAYKKWWFTEMTALFLVVGIILGVISRMGEKNFVDKFVAGSADLVGVALVIGVARSINLVMENGMISDTILYHSSNMI
SGMNSSVFIIFMLIVFIGLGFFIPSSSGLAVLSMPIMAPLADSVGLPRETIVNAYMFGQGLISFITPTGLILATLAMVDV
TYDKWIKFIMPLMGYIAALSAIMLLIQSFVA

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SAV1171 NP_371695.1 hypothetical protein Not tested vSa¥ã Protein 1e-93 46
SA1014 NP_374287.1 hypothetical protein Not tested vSa¥ã Protein 1e-93 46
SAKOR_01092 YP_008491280.1 Arginine/ornithine antiporter Not tested vSa¥ã Protein 1e-93 46
MW1052 NP_645869.1 hypothetical protein Not tested vSa¥ã Protein 9e-94 46
SACOL1183 YP_186046.1 hypothetical protein Not tested vSa¥ã Protein 1e-93 46
SAUSA300_1064 YP_493762.1 TRAP family protein Not tested vSa¥ã Protein 1e-93 46