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Name : coxA (OTBS_1800) Accession : YP_001249069.1 Strain : Orientia tsutsugamushi Boryong Genome accession: NC_009488 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c oxidase polypeptide I Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG0843 EC number : 1.9.3.1 Position : 1739411 - 1740997 bp Length : 1587 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAGCAGCAAACATAGTGATACTCCTCACGGATGGCGCAGATGGTTATTATCAACTAACCATAAAGATATAGGCAGTAT GTATTTAATATTTGCCATTTTAGCAGGACTAATTGGAGGATTGTTCTCATTTGTTTTTAGATTGCAATTAGCAGTACCTG GAAGCAATTTTTTAGGAGGTAATTTTCAGCTTTTTAATGTATTAATTACAGCTCATGCTATAATAATGGTATTCTTTATG ATTATGCCAGCTCTATTTGGTGGTTTTGGAAATTGGTTCGTACCATTAATGATTGGAGCTCCAGATGTTGCTTTTCCAAG ATTAAATAATATTAGCTTTTGGCTATTAGTACCTGCTTTTATTTTGCTTATTGCATCAGTTTTTGTTGATGAAGGAGCTG GTACTGGCTGGACTCTATATCCTCCTTTAAGTAGTAGTTTAAGCCATCCAGGAGCTGCTGTTGACATGGTAATTTTTAGC TTACATTTAGTTGGCCTATCTTCTATCCTTGGATCAATGAACCTTATAGTAACAATTTTTAATATGAGAGCCCCAGGCAT GGGATTATTACAAATCCCATTGTTTGTATGGTCAATACTAATTACTGCATTTCTATTAATTATAGTAATTCCAGTTCTAG GAGGAGCTATTACCATGCTATTAATGGATCGTAACTTCAGTACTTCATTTTTTGTTCCGTCAGGTGGTGGAGATCCAGTC TTATTTCAGCACTTATTTTGGTTTTTTGGTCACCCTGAAGTATATATAGTTATTTTGCCAGGATTTGGAGTTATTAGCCA TGTTATATCAACTTTTTCTAAAAAGCCAATATTTGGCTATTTAGGTATGGTAGGAGCAATGATTGCCATTGGAGTAATCG GAACATTAGTATGGGCTCACCACATGTTTACGGTTGGATTATCACCGCAAGCCTTAATATTTTTTACTGCCGGGTCAATG ATTATAGCTTTGCCAACTGGAATCAAAATCTTCAGCTGGCTAGCAACTATGTGGGGCGGATCAATTGAATTTAAGACTCC AATGCTATTTAGCATAGGATTTATTATATTATTTACTATTGGTGGAGTAACTGGAGTAGTATTAGCTAACTCATCAATTG ATAGAGTATTACATGATACATATTATGTAGTTGCTCACTTTCATTATACAATGTCCTTGGGAGCATTGTTTTCAGCATTT GCTGGATTTTATTACTGGATCGGAAAAATATCAGGTCGACAATATCCAGAAATACTCGGAAAAATTCACTTTTGGATAAC TTTTATCGGAGTTAATCTTACTTTTTTTCCTCAACATTTTTTAGGACTTGCTGGTATGCCAAGAAGAATTCCAGATTATC CTGATGCTTTTGCTGGCTGGAATATGGTATCATCCATAGGTTCTACAATTTCAATAATCGCTGCATTCTTTTTTATCTAC ATAGCAATCTACACAATATTCTATGGTAAAAAATGCCCAGCTAATCCATGGGGACAAGGAGCTACAACTCTAGAATGGAG CTTAGAATCCCCTCCACCTTATCATTGCTTTCAAGAACCACCAAAAATGGAGAATGTCGATCACTAA Protein sequence : MSSKHSDTPHGWRRWLLSTNHKDIGSMYLIFAILAGLIGGLFSFVFRLQLAVPGSNFLGGNFQLFNVLITAHAIIMVFFM IMPALFGGFGNWFVPLMIGAPDVAFPRLNNISFWLLVPAFILLIASVFVDEGAGTGWTLYPPLSSSLSHPGAAVDMVIFS LHLVGLSSILGSMNLIVTIFNMRAPGMGLLQIPLFVWSILITAFLLIIVIPVLGGAITMLLMDRNFSTSFFVPSGGGDPV LFQHLFWFFGHPEVYIVILPGFGVISHVISTFSKKPIFGYLGMVGAMIAIGVIGTLVWAHHMFTVGLSPQALIFFTAGSM IIALPTGIKIFSWLATMWGGSIEFKTPMLFSIGFIILFTIGGVTGVVLANSSIDRVLHDTYYVVAHFHYTMSLGALFSAF AGFYYWIGKISGRQYPEILGKIHFWITFIGVNLTFFPQHFLGLAGMPRRIPDYPDAFAGWNMVSSIGSTISIIAAFFFIY IAIYTIFYGKKCPANPWGQGATTLEWSLESPPPYHCFQEPPKMENVDH |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1478 | YP_001800872.1 | cytochrome c oxidase subunit I | Not tested | Not named | Protein | 7e-87 | 44 |
