|
Name : SaurJH9_2010 (SaurJH9_2010) Accession : YP_001247370.1 Strain : Staphylococcus aureus JH9 Genome accession: NC_009487 Putative virulence/resistance : Unknown Product : TP901 family phage tail tape measure protein Function : - COG functional category : S : Function unknown COG ID : COG5412 EC number : - Position : 2141077 - 2145609 bp Length : 4533 bp Strand : - Note : TIGRFAM: phage tail tape measure protein, TP901 family; PFAM: peptidase M23B; TMP repeat-containing protein; Lytic transglycosylase, catalytic DNA sequence : ATGGGAGAAAGAATAAAAGGTTTATCTATAGGTTTGGATTTAGATGCAGCAAATTTAAATAGATCATTTGCAGAAATCAA ACGAAACTTTAAAACTTTAAATTCTGACTTAAAGTTAACCGGTAACAACTTCAAATATACCGAAAAATCAACTCATAGTT ACAAACAAAGGATTAAAGAACTTGATGGAACTATCACAGGTTATAAGAAAAACGTTGATGATTTAGCCAAGCAATATGGC AAGGTATCTCAAGAACAGGGCGAAAACAGCGCGGAAGCTCAAAAATTACGACAAGAATATAACAAACAAGCAAATGAGCT GAATTTTTTAGAAAAAGAACTAGAAAAAACAACAACTGAGTTTGAAGAGTTCAAAAAAGCTCAAGTTGAAGCTCAAAGAA TGGCAGAAAGTGGCTGGGGAAAAACCAGTAAAGTTTTTGAAAGTATGGGACCTAAATTAACAAAAATGGGTGATGGTTTA AAATCCATTGGTAAAGGTTTGATGATTGGTGTAACTGCACCTGTTTTAGGTATTGCAGCAGCATCAGGAAAAGCTTTTGC AGAAGTTGATAAAGGTTTAGATACAGTTACCCAAGCAACAGGAGCAACCGGCGGAGAGCTTAAGAAGTTGCAGAATTCAT TTAAAGATGTTTATGGCAACTTTCCAGAAGACGCTGAGACTGTAGGCGGTGTTTTAGGGGAAGTTAACACAAGGTTAGGT TTCACTGGCAAAGAACTTGAGAGTGCCACAGAGTCATTCTTGAAATTTAGTCACATAACAGGTTCTGACGGCGTACAAGC CGTTCAATTAATTACGCGTGCAATGGGTGATGCAGGTATTGAAGCTGATGAGTATCAAAGTGTACTTGATATGGTAGCGA AAGCAGCACAGGCTAGCGGTATAAGTGTTGATACATTAGCTGATAGCATTACTAAATACGGTGCTCCAATGAGGGCTATG GGCTTTGAGATGAAAGAATCAATCGCTTTATTCTCTCAATGGGAGAAATCAGGTGTTAATACTGAAATAGCCTTCAGTGG TTTGAAAAAAGCTATATCCAATTGGGGTAAAGCGGGTAAAGACCCAAGAGAAGAATTTAAGAAGACATTAGCAGAAATTG AAAGGACACCGGATATAGCTAGCGCAACAAGTTTAGCGATTGAAGCATTTGGTGCAAAAGCAGGTCCTGATTTAGCAGAT GCTATTAAAGGCGGTCGCTTTAGTTACCAAGAGTTCTTAAAAACTATCGAAGATTCGCAAGGAACGGTCAATCAGACATT TAAAGATTCTGAAAGTGGCTCCGAAAGATTTAAAGTAGCAATGAATAAACTTAAATTAGTAGGTGCTGATGTATGGGCTT CTATTGAAAGTGCGTTTGCTCCAGTCATGGAAGAATTAATCAAAAAGCTATCTGTAGCAGTTGATTGGTTTTCAAGTTTA AGTGATGGATCTAAAAGGTCGATTGTTATATTCGGTGGTATTGCTGCTGCAATTGGTCCTGTAGTTTTTGGATTAGGTGC ATTCATAAGCACAGTTGGCAACGCAGTAACTGTATTAGCTCCATTATTAGCTAGTATTGCAAAGGCTGACGGATTGATTA GTTTTTTATCAACTAAAGTGCCTATTTTAGGAACAGTCTTCACAGCATTAACTGGTCCAATTGGTATCGTGTTAGGTGTA CTGGCTGGTTTAGCAGTCGCATTTACAATAGCTTATAAGAAATCTGAAACATTCAGAAATTTTGTTAATGGTGCAATTAA CAGTGTTAAACAAACGTTTAGTAATTTCATTCAATTTATCCAACCTTTCATTGATTCCGTTAAAAACGTCTTTAAACAAG CGGTTTCAGCAATCGTTGATTTCGCTAAAGATATTTGGAGTCAAATTAATGGATTCTTTAATGAAAACGGAATTTCTATT GTTCAAGCGCTTCAAAATATATGCAATTTTATCAAAGCTATATTTGAATTTATCTTAAATTTTGTAATTAAACCAATCAT GTTTGCGATTTGGCAAGTGATGCAATTTATTTGGCCGGCGGTTAAAGCCTTGATTGTCAGTACTTGGGAGAATATAAAAG GAGTAATACAAGGTGCTTTAAATATCATACTTGGCTTTATCAAGTTCTTTTCAAGTTTATTCACTGGTAATTGGCGAGGT GTTTGGGACGGTATTGTGATGATACTAAAAGGCACTGTGCAGTTAATTTGGAATTTAATACAACTGTGGTTTGTAGGTAA GATTCTAGGTGTTGTTAGATACTTTGGTGGATTGCTTAAAGGTTTAATATCCGGTATCTGGGGTGTTATCAAAGGTATTT TCACAAAATCATTATCTGCAATTTGGAATGCAACGAAAAGTATTTTCGGTTTCTTATACAATAGTGTTAAATCTATTTTC ACTAATATGAAAAACTGGTTATCTAGTACGTGGAATAATATCAAAAGCAATACCGTCGGCAAGGCTCATTCGTTATTTAC GGGTGTAAGGTCTAAATTCACAAGTTTATGGAATGCGACGAAAGATATATTTACTAAGTTAAGAAATTGGATGTCAAACA TCTGGAACTCTATTAAAGATAACACGGTAGGTATAGCTGGTCGTTTGTGGGATAAAGTACGTAATATCTTCGGAAACATG CGTGACGGTTTAAAATCTATCATTGGTAAAATTAAAGATCATATCGGCGGTATGGTAGATGCTATTAAAAAAGGACTTAA TAAATTAATTGAAGGCTTAAACTGGGTCGGTGGTAAGTTAGGTATGGATGAAATACCTAGGTTACACACTGGTACAGAGC ACACACATACTACTACAAGATTAGTTAAGAACGGTAAGATTGCACGTGATACATTCGCTACAGTTGGGGATAAAGGACGT GGAAATGGTCCAAATGGTTTTAGAAATGAAATGATTGAATTCCCTAATGGTAAACGTGTAATCACACCTAATACAGACAC TACTGCTTATTTACCTAAAGGCTCAAAAGTATACAACGGTGCACAAACTTATTCAATGTTAAACGGAACGCTTCCGAGAT TTCATTTCGGTACTACTATGTGGAAAGATATTAAATCTAGTGCATCATCGGCATTTAACTGGACAAAAGATCAAATAGGT AAAGGTACCAAATGGCTTGGCGATAAAGTTGGCGATGTTTTAGATTTTATGGAAAATCCAGGCAAACTTTTAAATTATAT ACTTGAAGCTTTTGGAATTGATTTCAATTCTTTAACTAAAGGTATGGGAATTGCAGGCGACATAACAAAAGCTGCATGGT CTAAGATTAAGAAAAGTGCTACTGATTGGATAAAAGAAAATTTAGAAGCTATGGGCGGTGGCGATTTAGTCGGTGGAATA TTAGACCCTGACAAAATTAATTATCATTATGGACGTACCGCAGCTTATACCGCTGCAACTGGAAGACCATTTCATGAAGG TGTCGATTTTCCATTTGTATATCAAGAAGTTAGAACGCCGATGGGTGGCAGACTTACAAGAATGCCATTTATGTCTGGTG GTTATGGTAATTATGTAAAAATTACTAGTGGAGTTATCGATATGCTATTTGCGCATTTGAAAAACTTTAGCAAATCACCA CCTAGTGGCACGATGGTAAAGCCCGGTGATGTTGTTGGTTTAACTGGTAATACCGGATTTAGTACAGGACCACATTTACA TTTTGAAATGAGGAGAAATGGACGACATTTTGACCCTGAACCATATTTAAGGAATGCTAAGAAAAAAGGTAGGTTATCAA TTGGTGGCGGTGGCGCTACTTCTGGAAGTGGTGCAACTTATGCCAGCCGAGTAATCCGACAAGCACAAAGTATTTTAGGA GGACGTTATAAAGGTAAGTGGATTCATGACCAGATGATGCGAGTTGCAAAGCGCGAAAGTAACTATCAATCAAATGCAGT GAATAATTGGGACATTAATGCTCAAAGAGGAGACCCGTCTAGAGGATTATTCCAAATTATCGGCTCAACTTTTAGAGCTA ACGCTAAACGAGGGTACACTAATTATAATAATCCAGTACATCAAGGTATCTCAGCAATGCAGTACATTGTTAGACGATAT GGTTGGGGTGGTTTTAAACGTGCTGGTGATTACGCATATGCTACAGGTGGAAAAGTTTTTGATGGTTGGTATAACTTAGG TGAAGACGGTCATCCAGAATGGATTATTCCAACAGATCCAGCTCGTAAAAATGATGCAATGAAGATGTTGCATTATGCAG CAGCAGAAGTAAGAGGGAGAAAAGCGAGTAAAAATAAGCGTCCTAGTCAATTGTCTAATGTAAATGGGTTTGATGACCCA AGCTTATTATTGAAAATGATTGAACAACAGCAACAACAAATAGCTTTATTACTGAAGATAGCGCAATCTAACGATGTGAT TGCAGATAAAGATTATCAGCCGATTATTGACGAATACGCTTTTGATAAAAAGGTGAACGCGTCTATAGAAAAGCGAGAAA GGCAAGAATCAACAAAAGTAAAGTTTAGAAAAGGAGGAATTGCTATTCAATGA Protein sequence : MGERIKGLSIGLDLDAANLNRSFAEIKRNFKTLNSDLKLTGNNFKYTEKSTHSYKQRIKELDGTITGYKKNVDDLAKQYG KVSQEQGENSAEAQKLRQEYNKQANELNFLEKELEKTTTEFEEFKKAQVEAQRMAESGWGKTSKVFESMGPKLTKMGDGL KSIGKGLMIGVTAPVLGIAAASGKAFAEVDKGLDTVTQATGATGGELKKLQNSFKDVYGNFPEDAETVGGVLGEVNTRLG FTGKELESATESFLKFSHITGSDGVQAVQLITRAMGDAGIEADEYQSVLDMVAKAAQASGISVDTLADSITKYGAPMRAM GFEMKESIALFSQWEKSGVNTEIAFSGLKKAISNWGKAGKDPREEFKKTLAEIERTPDIASATSLAIEAFGAKAGPDLAD AIKGGRFSYQEFLKTIEDSQGTVNQTFKDSESGSERFKVAMNKLKLVGADVWASIESAFAPVMEELIKKLSVAVDWFSSL SDGSKRSIVIFGGIAAAIGPVVFGLGAFISTVGNAVTVLAPLLASIAKADGLISFLSTKVPILGTVFTALTGPIGIVLGV LAGLAVAFTIAYKKSETFRNFVNGAINSVKQTFSNFIQFIQPFIDSVKNVFKQAVSAIVDFAKDIWSQINGFFNENGISI VQALQNICNFIKAIFEFILNFVIKPIMFAIWQVMQFIWPAVKALIVSTWENIKGVIQGALNIILGFIKFFSSLFTGNWRG VWDGIVMILKGTVQLIWNLIQLWFVGKILGVVRYFGGLLKGLISGIWGVIKGIFTKSLSAIWNATKSIFGFLYNSVKSIF TNMKNWLSSTWNNIKSNTVGKAHSLFTGVRSKFTSLWNATKDIFTKLRNWMSNIWNSIKDNTVGIAGRLWDKVRNIFGNM RDGLKSIIGKIKDHIGGMVDAIKKGLNKLIEGLNWVGGKLGMDEIPRLHTGTEHTHTTTRLVKNGKIARDTFATVGDKGR GNGPNGFRNEMIEFPNGKRVITPNTDTTAYLPKGSKVYNGAQTYSMLNGTLPRFHFGTTMWKDIKSSASSAFNWTKDQIG KGTKWLGDKVGDVLDFMENPGKLLNYILEAFGIDFNSLTKGMGIAGDITKAAWSKIKKSATDWIKENLEAMGGGDLVGGI LDPDKINYHYGRTAAYTAATGRPFHEGVDFPFVYQEVRTPMGGRLTRMPFMSGGYGNYVKITSGVIDMLFAHLKNFSKSP PSGTMVKPGDVVGLTGNTGFSTGPHLHFEMRRNGRHFDPEPYLRNAKKKGRLSIGGGGATSGSGATYASRVIRQAQSILG GRYKGKWIHDQMMRVAKRESNYQSNAVNNWDINAQRGDPSRGLFQIIGSTFRANAKRGYTNYNNPVHQGISAMQYIVRRY GWGGFKRAGDYAYATGGKVFDGWYNLGEDGHPEWIIPTDPARKNDAMKMLHYAAAEVRGRKASKNKRPSQLSNVNGFDDP SLLLKMIEQQQQQIALLLKIAQSNDVIADKDYQPIIDEYAFDKKVNASIEKRERQESTKVKFRKGGIAIQ |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SA1766 | NP_375064.1 | hypothetical protein | Not tested | ¥ÕSa3 | Protein | 0.0 | 98 |
| SAKOR_01932 | YP_008492120.1 | hypothetical protein | Not tested | ¥ÕSa3 | Protein | 0.0 | 97 |
| SAUSA300_1930 | YP_494581.1 | phi77 ORF001-like protein, phage tail tape measure protein | Not tested | ¥ÕSa3 | Protein | 0.0 | 96 |
| SAUSA300_1930 | YP_494581.1 | phi77 ORF001-like protein, phage tail tape measure protein | Not tested | ¥ÕSa3 | Protein | 0.0 | 96 |
| SAV1955 | NP_372479.1 | phi PVL ORF 15 and 16-like protein | Not tested | ¥ÕSa3 | Protein | 0.0 | 96 |
| MW1895 | NP_646712.1 | hypothetical protein | Not tested | ¥ÕSa3 | Protein | 0.0 | 54 |
