Gene Information

Name : ribD (COSY_0726)
Accession : YP_001219562.1
Strain : Candidatus Vesicomyosocius okutanii HA
Genome accession: NC_009465
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : bifunctional riboflavin biosynthesis protein RibD
Function : -
COG functional category : H : Coenzyme transport and metabolism
COG ID : COG0117
EC number : 1.1.1.193
Position : 764042 - 765091 bp
Length : 1050 bp
Strand : +
Note : bifunctional diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase (riboflavin-specific deaminase) / 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase.

DNA sequence : 
ATGCTAACAACTTTTTCAAAAAATGAAACCCAAAACATGACAATTGCAATTAAACTTGCCTTACAAGGAAGGTACGGTGT
AAAGTCTAACCCTATGGTAGGTTGTGTGATTGTTAAACATTCCAAGATTATTGCCAAAGGATATCACGAAAGTTTTGGCC
AAGCACACGGAGAAATTAATGCCTTACAACAAATTAACTATAAAGCTCATGGCGCTACACTCTACGTCACTCTAGAACCT
TGTTCACATCAAGGAAAAACACCGTCTTGTGCACAAGCTATTATTAATTCAGGTGTTAAAAAAGTTATTATCGCTATGCT
TGATCCTAATCCACTAGTCAATGGTAAAGGGGTTGTCATGCTTAAATATGCAGGTATCGAGGTTAAAATTGGTCTTTTAA
AAAATGATGCATCAATTCTTAATCAAGGATTTATTAAGCGTATGCAAACTAACCAGCCTTTTATACGTTGTAAAGTAGCT
ATGAGTATTGATGGTAAAACCTCAATGAGTTCAGGTGAAAGTAAATGGATTACCTCAAAAGTTGCAAGATTAGACGTACA
AAAACTACGTGCCAATCACCAAGCAATTATAACTGGATCAGGTACAATTATTAATGACAACCCTTTAATGACAGTACGTC
TTGATGGTGTTAATTCAAAACCACTACGTGTTGTAATTGATAGTAAGAATCAAATAACAGATACCTCGCTTAATATATTT
AACACTGATGCACCAACACTAATCCTAAACCCGGATAATACCAAGGTACTTGCCTCTGGCAAACTAGATCTTAGTAATGT
TTTAACCCAATTAGGCAATCAAGGTATTAATAATGTTTTACTTGAAGCAGGTCCTAAACTGATTGGTGCCATGATTAAAA
TTAATTTAATTGATGAGTTTATTATTTATATGGCGCCTATATTAATGGGCAGTGATGCTAATTCAATACTTAATCTAGTT
ATTAAAGATATGAGTTATAAAATAAAACTGGATATTGTTGATGTTAGGATGGTAGGTGACAACATCAAAATAACTGCTAC
TTTAAAATGA

Protein sequence : 
MLTTFSKNETQNMTIAIKLALQGRYGVKSNPMVGCVIVKHSKIIAKGYHESFGQAHGEINALQQINYKAHGATLYVTLEP
CSHQGKTPSCAQAIINSGVKKVIIAMLDPNPLVNGKGVVMLKYAGIEVKIGLLKNDASILNQGFIKRMQTNQPFIRCKVA
MSIDGKTSMSSGESKWITSKVARLDVQKLRANHQAIITGSGTIINDNPLMTVRLDGVNSKPLRVVIDSKNQITDTSLNIF
NTDAPTLILNPDNTKVLASGKLDLSNVLTQLGNQGINNVLLEAGPKLIGAMIKINLIDEFIIYMAPILMGSDANSILNLV
IKDMSYKIKLDIVDVRMVGDNIKITATLK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
BJAB07104_00289 YP_008207754.1 Pyrimidine deaminase Not tested AbaR25 Protein 1e-56 44
BJAB0868_00293 YP_008211619.1 Pyrimidine deaminase Not tested AbaR26 Protein 1e-56 44