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Name : lysS (COSY_0549) Accession : YP_001219390.1 Strain : Candidatus Vesicomyosocius okutanii HA Genome accession: NC_009465 Putative virulence/resistance : Virulence Product : lysyl-tRNA synthetase, class II Function : - COG functional category : J : Translation, ribosomal structure and biogenesis COG ID : COG1190 EC number : 6.1.1.6 Position : 574394 - 575884 bp Length : 1491 bp Strand : - Note : - DNA sequence : GTGAGAGACGAAGATAACAATAAATTAATTCTTAAAAGAAAATCAAAATTGGCCTTATTAAGAGAAGTTGGAAATCCATT TATTAATAATTTTAAGCCTGAAAACTTAGCACAAAATATTATTCAAGAATTTAAAGGTTTTTCTAAAGAAGAACTAGAGA AAAAGAATATGCAAGTATCAATAGCAGGACGGATGATGCTCAAGCGTGTTATGGGTAAGGTTAGTTTTGTACATGTACAA GATTCTAGTGGGAAAATTCAGCTTTTTGTCACTTGTGATAAGCTACCTGAGAGTTTTTATAATGAACAGTTTAAAAAATG GGATATTGGTGATATTATTGGCGCTATAGGTATTTTATTCAAAACCAATATGGGTGAATTGTCAATTCGTATTGACGATA TTAAGTTGTTAACTAAATCACTACGTCCGTTACCTGGAAAATTTCATGGCTTGTCTGATCAAGAAATTCGTTATCGTCAG CGTTATGTTGATTTGATTATGAATAAGACATCACGAAATACGTTTAAACGCCGTAGTCAAATTATTAACTATATCCGCAA TTTTTTCAATCATCATGATTTTATTGAGGTAGAAACACCTATGTTACAAACTATTCCAGGTGGCGCAACAGCCAAACCAT TTGAAACGTATCATAATGCATTAGACATGCCTATGTATTTTCGCATTTCACCTGAGCTTTACTTAAAACGTTTAATTATT GGTGGTATGAATAAAGTATTCGAAATTAATCGTAATTTTAGAAATGAAGGACTTTCCACTAGACATAATCCAGAATTTAC GATGATTGAATTTTACCAGGCTTATGGAACATATCATGATTTAATGAATTTGACAGAAAAATTATTTCGCAGTATCGCAC TTGATGTATGTGGCAGCGCTAATGTCTATTATCAAGGTAACAATCTTGATTTTTTTAAGTCATTTAAACGTATTAGTGTG GTTGATTCAATTTTACAATATAATCCAAGCTTGATAGCAACTGATTTAAATCAGAAAAATGCTAAACAAACTGCAGAAAA ATTAGGTATTCAAATTAAAGAAAATTGGGGTTTGGGCAAGATTCAAATTGAAATCTTTGAGACTACTGTTGAAGAAAAAT TATTACAGCCTACTTTTATCACTGAGTATCCAACTGAAGTATCACCATTAGCACGTCGAAATGACGATAATCCGTTTATT ACTGATCGGTTTGAATTATTTATTAGTGGGTGTGAAATTGCTAACGGCTTTTCTGAGCTTAATGATGCACAGGATCAAGC TGAGCGTTTTAAAAAACAAGTTGAAGAGAAAGATTTAGGTAATGATGAGTCTATGTATTATGATGCTGATTATATTCGTG CTTTAGAGTATGGCATGCCACCTACAGCAGGAGAAGGCATTGGTATTGATAGATTGGTAATGCTATTTACCGATTCGCCG TCAATTCGTGATGTTATTTTGTTTCCTCATATGCGTGCTGAAGTAAAGTGA Protein sequence : MRDEDNNKLILKRKSKLALLREVGNPFINNFKPENLAQNIIQEFKGFSKEELEKKNMQVSIAGRMMLKRVMGKVSFVHVQ DSSGKIQLFVTCDKLPESFYNEQFKKWDIGDIIGAIGILFKTNMGELSIRIDDIKLLTKSLRPLPGKFHGLSDQEIRYRQ RYVDLIMNKTSRNTFKRRSQIINYIRNFFNHHDFIEVETPMLQTIPGGATAKPFETYHNALDMPMYFRISPELYLKRLII GGMNKVFEINRNFRNEGLSTRHNPEFTMIEFYQAYGTYHDLMNLTEKLFRSIALDVCGSANVYYQGNNLDFFKSFKRISV VDSILQYNPSLIATDLNQKNAKQTAEKLGIQIKENWGLGKIQIEIFETTVEEKLLQPTFITEYPTEVSPLARRNDDNPFI TDRFELFISGCEIANGFSELNDAQDQAERFKKQVEEKDLGNDESMYYDADYIRALEYGMPPTAGEGIGIDRLVMLFTDSP SIRDVILFPHMRAEVK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| unnamed | CAD66193.1 | putative lysil-tRNA synthetase LysU | Not tested | PAI III 536 | Protein | 3e-134 | 58 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| lysS | YP_001219390.1 | lysyl-tRNA synthetase, class II | VFG1668 | Protein | 2e-134 | 58 |
