Gene Information

Name : glnA (COSY_0458)
Accession : YP_001219301.1
Strain : Candidatus Vesicomyosocius okutanii HA
Genome accession: NC_009465
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : glutamine synthetase
Function : -
COG functional category : E : Amino acid transport and metabolism
COG ID : COG0174
EC number : 6.3.1.2
Position : 473999 - 475414 bp
Length : 1416 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence : 
ATGTCTGCTAAAAATATAATGAAGATTATTGAAGATAATAAAGTTAAATTCATTGATTTTCGTTTTACCGATACCATTGG
TAAGGAACAACATGTGAGTGTTCCAGCACACACCATGAATATCGCAAAACTAACTGAAGGACAAACATTTGATGGTTCGT
CAATTGCTGGTTGGAAATCTATTGATAAATCTGACATGATTATGATGCCAGACACAGCAACAGCGGTAATGGATCCATTT
ACCGAAGAATCTACACTTAACATTATTTGTGATATTATTGAATCAAATAATATGGCTAACTATGAAAAAGACCCTCGTTC
TATTGCAAAAAGAGCTGAAATTTATTTAAACAAAACTGGTATTGGTGATACCGCATATTTTGGCAATGAGCCAGAATTTT
TTATCTTTGATAGTGTTAAGTGGGATACAGGCTTTGGTTTAGGTAAAGCTTTTTATGAAATTAATTCCGAAGAGGCGTAT
TGGGAGTCTGGTTCTGATTTTGAAGGCGGTAATAAAGGTCATCGTCCTAGAATTAAAGGGGGGTATTTTCCAGTTCCTCC
GGTAGATTCATTACATAATTTACGTGCACAGATGTGCTTAGCAATTGAAGAAATGGGAGTAACTACCGAGATTCATCATC
ATGAAGTTGGTACTGCTGGACAATGTGAAATTGGTGCATTATTTAATACGTTAGTGAAAAAAGCTGATGAAACTCAAATA
TTAAAATATTGTGTTCATAATGTTGCACATTCTTATGGTAAAACAGCAACTTTTATGCCTAAACCAATTGCAGTTGATAA
TGGTAATGGTATGCATGTTCATCAATCAATTACTAAAAATGGTAAGAACTTATTTGATGGTAATGAATACGGTAATTTAA
GTGAAATGGCGCTTCACTATATTGGGGGTATTATTAAGCACGCTCAAGCACTTAATGCTTTTACTAATGCTTCTACTAAC
TCGTACAAGCGTTTAGTGCCAGGTTTTGAAGCACCAGAAATGTTGGCGTATTCGGCTAAAAATCGTTCTGCTGCTATTCG
TATTCCTTTTGTGTCTCATTCTAAAGGTCGTCGTATTGAAGTACGTTTTCCTGATTCAACAGCTAATCCATATCTTGCAT
TTGCAGCGATGTTAATGGCAGGTCTTGATGGTATTAAGAATAAGATTCATCCTGGAAAACCAGGCGATGAAGATTTATAT
AGTTTGACAGAAAAAGAAAAATTATCTTTTCCTAAAGTTTGTAGCTCATTAGATCAAGCTCTTGAAGCGCTAGATAAAGA
TCGTGAGTTTTTAAAGAAAGGTAGTGTATTTACTGATAATATTATTGATTCATTTATCAATCTTAAAATAAAAGAAGTAA
CTGCACTTCGTGCTTCTCCTCATCCGGTAGAATTTGATATGTACTACAGTGTATAA

Protein sequence : 
MSAKNIMKIIEDNKVKFIDFRFTDTIGKEQHVSVPAHTMNIAKLTEGQTFDGSSIAGWKSIDKSDMIMMPDTATAVMDPF
TEESTLNIICDIIESNNMANYEKDPRSIAKRAEIYLNKTGIGDTAYFGNEPEFFIFDSVKWDTGFGLGKAFYEINSEEAY
WESGSDFEGGNKGHRPRIKGGYFPVPPVDSLHNLRAQMCLAIEEMGVTTEIHHHEVGTAGQCEIGALFNTLVKKADETQI
LKYCVHNVAHSYGKTATFMPKPIAVDNGNGMHVHQSITKNGKNLFDGNEYGNLSEMALHYIGGIIKHAQALNAFTNASTN
SYKRLVPGFEAPEMLAYSAKNRSAAIRIPFVSHSKGRRIEVRFPDSTANPYLAFAAMLMAGLDGIKNKIHPGKPGDEDLY
SLTEKEKLSFPKVCSSLDQALEALDKDREFLKKGSVFTDNIIDSFINLKIKEVTALRASPHPVEFDMYYSV

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
glnA YP_003728749.1 glutamine synthetase Not tested cag PAI Protein 4e-102 47

• Homologs from VFDB (virulence genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
glnA YP_001219301.1 glutamine synthetase VFG1399 Protein 2e-103 48