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Name : SSU98_0333 (SSU98_0333) Accession : YP_001199891.1 Strain : Streptococcus suis 98HAH33 Genome accession: NC_009443 Putative virulence/resistance : Unknown Product : RecG-like helicase Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG1200 EC number : - Position : 331889 - 333796 bp Length : 1908 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAAAAGACTATGTGATGAATTATCGGTTTTGCCAGGGATTGGTCCAAAATCGGCTGAAAAATTCTTAAAAATTAGCAT TCAGAATATTAATGATTTGCTGACTTACTATCCATTTAGATATGAAGATTTTGAGAGTAAGTCTATTTATGATTTGCAGG ATGGGGAGAAGGCAGTGGTAGTTGGGGAGGTGGTATCTCCAGCTAATGTACAGTATTATGGTTACAAAAGAAATAGACTC CGTTTTTCAATGAAACAGGGTGAGGTTGTCTTAGCAGTTTCGTTTTTTAATCAGCCTTATTTAGCAGATAAGATTGTTTT GGGGCAGGATATTGCAGTTTGGGGAAAGTGGGATAAGGCTAAGGCAAGTTTGACAGGAATGAAAATTTTGGCTCAAGTAT CAGATGAGCTCCAACCTGTCTATCATGTGGCGCAAGGGATTTCGCAAGTAAATTTGGTTAAGGCTATTAAAACAGCTATT GATCAGGGATATTTGCATTTATTAGAGGAGAACTTGCCATCAGTTTTACGAGAGCGCTATCGGTTAATGAATCGCCGAGA GGCGGTTTTTGCGATGCATTTTCCTACAAATTTAGAAGAGTATAGACAAGCTTTGCGACGTATGAAGTTTGAGGAATTAT TTTATTTTCAATTACAGTTGCAAATGCTGAAAGCCAACAATCGTGATATTTTGAATGGTTTGAAGATTGCCTATGATGCT GATAGATTGGCTATGCAAATAAGACAATTGCCGTTTGTCTTAACAGATGCTCAGTCTGGGGCTTTGGCTGAAATACTATC AGATATGAAGTCCTATGGGCACATGAATCGTTTGTTACAAGGGGATGTTGGTTCAGGGAAGACAGTAGTTGCTGGATTGG CTATGTTTGCTGCTGTGACTGCGGGGATGCAGGCTGCAATTATGGTGCCGACAGAAATTTTGGCTGAGCAACACTTTGAG AGTTTGCGCCAGCTTTTTCCAGAACTTTCTATTGCTCTTTTGACAGGTGGAATGAAAGCTGCGGAGCGTCGTACTGCTTT AGAGGCGATTTCTAGTGGTCAGGTAGACATCATTGTAGGAACTCATGCTCTTATACAGGAAAGTGTGACGTACCATAAGC TTGGTTTGGTTGTGACGGATGAGCAACATCGTTTTGGTGTTAAACAGCGCCGTCTGTTTCGTGAGAAGGGTGATAATCCG GATGTGCTTATGATGACTGCTACACCTATTCCTCGGACGTTAGCCATTACAGCTTTTGGAGATATGGATGTATCAATTAT TAATCAGTTACCTGCTGGTCGAAAGCCAATTATCACTCGCTGGGTCAAACATCAACAGCTGCCCACGGTCTTAGATTGGT TGGAGCGGGAGTTAGAAGTGGGTGCTCAGGTTTATTTTATCTCTCCGCTGATTGAAGAATCTGAGGCTCTAGATTTAAAG AATGCTGTAGATCTACAATCTGATTTACAGGCGCATTTTGGAGAGCAAGTTACAGTGGATTTGTTACACGGTAAGATGAA GAATGACGAGAAAGATGCCATCATGCAGGCTTTTAAGGAGCGAAAAACGAATATTTTGGTTTCTACCACTGTTATTGAAG TCGGAGTCAATGTGCCCAATGCAACGGTGATGGTTATTATGGATGCTGATCGTTTTGGTTTAAGCCAATTACATCAGTTG AGAGGGCGTGTAGGACGTGGTCATAAGCAGTCTTATGCAGTGTTAGTTGCTAATCCTAAAACAGAGTCTGGTAAGGAACG CATGAAAATTATGACAGAGACGACAGATGGTTTTATTTTGGCTGAAGCTGACTTAAAAATGCGTGGGTCTGGAGAAATAT TTGGAACTCGTCAATCAGGTTTGCCAGAATTTCAAGTTGCAATATTATCGAGGACTATCCAATTTTAG Protein sequence : MKRLCDELSVLPGIGPKSAEKFLKISIQNINDLLTYYPFRYEDFESKSIYDLQDGEKAVVVGEVVSPANVQYYGYKRNRL RFSMKQGEVVLAVSFFNQPYLADKIVLGQDIAVWGKWDKAKASLTGMKILAQVSDELQPVYHVAQGISQVNLVKAIKTAI DQGYLHLLEENLPSVLRERYRLMNRREAVFAMHFPTNLEEYRQALRRMKFEELFYFQLQLQMLKANNRDILNGLKIAYDA DRLAMQIRQLPFVLTDAQSGALAEILSDMKSYGHMNRLLQGDVGSGKTVVAGLAMFAAVTAGMQAAIMVPTEILAEQHFE SLRQLFPELSIALLTGGMKAAERRTALEAISSGQVDIIVGTHALIQESVTYHKLGLVVTDEQHRFGVKQRRLFREKGDNP DVLMMTATPIPRTLAITAFGDMDVSIINQLPAGRKPIITRWVKHQQLPTVLDWLERELEVGAQVYFISPLIEESEALDLK NAVDLQSDLQAHFGEQVTVDLLHGKMKNDEKDAIMQAFKERKTNILVSTTVIEVGVNVPNATVMVIMDADRFGLSQLHQL RGRVGRGHKQSYAVLVANPKTESGKERMKIMTETTDGFILAEADLKMRGSGEIFGTRQSGLPEFQVAILSRTIQF |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| recG | CAJ77039.1 | ATP-dependent DNA helicase | Not tested | AbaR1 | Protein | 6e-95 | 45 |
