|
Name : Fjoh_3655 (Fjoh_3655) Accession : YP_001195988.1 Strain : Flavobacterium johnsoniae UW101 Genome accession: NC_009441 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ATP-dependent OLD family endonuclease Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG3593 EC number : - Position : 4346439 - 4348820 bp Length : 2382 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGCATTTAAAATCTATTACAGTTAAAAATTTTAGAAGGCTAAAAAAAACTCAAATTGACTTAGAAAAAGATGATTCAAT TTTTGTTGGCGCAAATAATAGTGGAAAAACTTCGGCTACCTATCTTTTATATCGCTTTTTAGAAGATCAAAAAGCTAAAT TTTCTTTGCATGACTTTAGTAGTCATTGTTGGAAAATATTCGATGATTTAGGTAACTCGGAAACTTTACTAAAAGCCTCG GAATTCCCGTCAATTTCTCTCGATTTATGGTTTCAAATTCAAAGTTCAGATTTGCATAGAGTATTAGATTTACTACCAAG TTTAGAATGGCAAAATGCTCCTGTTGGAGCTAGAGTTGAATTCAGTGTAAAGGATGTTTCCACACTTATGGAAAATTATA AACAGGCTAAAAGTAAGGCAGTCGCGAACAAAAAAGAACAATATCATCCTTGGCCTAAAAATCTCTCTGATTATCTACGG AAAAATCTTAATCAAGAATTCAATTTTAAATTCTATGTTCTTGACTTTGAAAAATTTGACAATGATTTCAATCAGGAGGA GGGATATGAACCGCTAACATTAGGAAACGACACAGATAGATCTGGGAGTAAGATAATAAAATCAATAATAAAAGTTGATA TCCTAAATGCTCAAAGGCATCTTACAGATAACAACTCGGCTAGATCTGAAGACCTCTCAAAAAGAATGAATCGTTTTTAC GAGAGAAATCTTAGGAAAAAAGAAAACGATTATGAAGCGATGCGAGCTCTTGATAATTCTGAAAAAGAATTGACAGCTCA CTTATCCGAAGTTTTTGCACCAACATTACAAAGTCTAAATAATTTAGGATACAGAGGCTTTAATGACCCTAAACTTCTTA TTAAAGCAGCTTTGAATTCTGAGATGATTGCTAGTCAGACTAAATTACATTATGCTCTTAGTGACGATCCAGAGTTAATG GCTTTACCTGACCAATATAATGGTCTAGGATTTAAGAATCTTATATATATGGTAATTGAAATTCTTGATTTTCATGCTCG GTGGATGGACGATGAAGAAAATCGAGCACCACTTCATCTAGTAATTATTGAAGAGCCAGAAGTTCATCTTCACGCTCAGC TTCAGCAGGTTTTTATTCGTGAAATTCGTAAGGTAATTCAAAAAGCTGAAACAAGTGAGTTTTTTGCTACACAAGTTGTA ATATCTACTCATTCCCCTCACATAATTTACGAAAGCGGTTTTAAGCCCATACGTTATTTTCAACGAGAAATAGATGATGA TGGACATCAAAAGTCAAATGTTCTAAATCTTTCTACATTTTACGATGGTTCGAGACCAAAGACAATAAAATTTCTTCAGC AATATATGAAGTTAACTCATTGCGATCTTTTCTTCGCTGATGGAACAATTTTAGTAGAAGGAAATGTTGAAAGATTGCTT TTGCCCATGATGATCAATAAAAGTGCCTCTGAGCTTAATGCTTCTTATATAACTATTATAGAAGTTGGTGGTGCTTTCGC TCACCTATTCAAAAAGCTTATAAATTTCTTAGGGTTAAAATGCTTAATAATAACGGATATTGACAGTATGTTAGGAAGAG ATGAAACATCGAAAACCTTGTCTTCAACCGTGTGTTTTGATAATAAAACACCATTTAAAGATAGTCCAGATTCTTTAGAA AATGGGGAATCTGCTAGCAATATTTTAAACGAAGATGATGAAGATGATGAAGATGATGAAGATGATGAAGATGAAGATGA TGAAGATGAAGATGAAGATGAAGATGAAGATGAAGATGTAAAAAAAGAAAATAAAAATGGGAAGTGTCCAACCGATACAG AAAACGCTGTCACTTCAAATCAGACTTTAATAAAATGGTTGCCAAAATTATCAAAAATTTCAGAATTATTCGAAGCAAAT GATGATGCAAAAACTCAAATTCCATCTGCGATATCTAAGTCTCATGTATTTATAACATACCAAACGCCACAAAAAGTTAC TTGGGAAGGTAAAAGCAAAAAAATATCTGGGCGAACCATTGAGGAAGCATTTGCATTAGAAAATTTGGCTTGGACGCAAA AAGTTGAGCATAAAGATTTGAAATTGCGTGTTATAACATTAATTGATAACCGATCACTTGATGAAGTTAAGGATCGTTTG TATAGGAGAATTAACTTAAATAATTTTAATAAAACTGATTTTGCGCTAAGACTGATGATGAAAAATTCCGAAGAATGGAA AGTTCCATCGTATATCGATTTAGGATTAAAATGGTTGCAAAAACAGTTATCCGAAGAGCAACAGATTATTAAGAAGACAA TAACAGTGCAAAAAAAAGATCCTAAGCCAAAAAAAAATAATAAAAAACAAGATCAAATATGA Protein sequence : MHLKSITVKNFRRLKKTQIDLEKDDSIFVGANNSGKTSATYLLYRFLEDQKAKFSLHDFSSHCWKIFDDLGNSETLLKAS EFPSISLDLWFQIQSSDLHRVLDLLPSLEWQNAPVGARVEFSVKDVSTLMENYKQAKSKAVANKKEQYHPWPKNLSDYLR KNLNQEFNFKFYVLDFEKFDNDFNQEEGYEPLTLGNDTDRSGSKIIKSIIKVDILNAQRHLTDNNSARSEDLSKRMNRFY ERNLRKKENDYEAMRALDNSEKELTAHLSEVFAPTLQSLNNLGYRGFNDPKLLIKAALNSEMIASQTKLHYALSDDPELM ALPDQYNGLGFKNLIYMVIEILDFHARWMDDEENRAPLHLVIIEEPEVHLHAQLQQVFIREIRKVIQKAETSEFFATQVV ISTHSPHIIYESGFKPIRYFQREIDDDGHQKSNVLNLSTFYDGSRPKTIKFLQQYMKLTHCDLFFADGTILVEGNVERLL LPMMINKSASELNASYITIIEVGGAFAHLFKKLINFLGLKCLIITDIDSMLGRDETSKTLSSTVCFDNKTPFKDSPDSLE NGESASNILNEDDEDDEDDEDDEDEDDEDEDEDEDEDEDVKKENKNGKCPTDTENAVTSNQTLIKWLPKLSKISELFEAN DDAKTQIPSAISKSHVFITYQTPQKVTWEGKSKKISGRTIEEAFALENLAWTQKVEHKDLKLRVITLIDNRSLDEVKDRL YRRINLNNFNKTDFALRLMMKNSEEWKVPSYIDLGLKWLQKQLSEEQQIIKKTITVQKKDPKPKKNNKKQDQI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| RL009 | AAP84136.1 | pathogenesis-related protein | Not tested | PAPI-1 | Protein | 2e-120 | 47 |
