Gene Information

Name : Dred_2190 (Dred_2190)
Accession : YP_001113530.1
Strain : Desulfotomaculum reducens MI-1
Genome accession: NC_009253
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : L-lactate transport
Function : -
COG functional category : C : Energy production and conversion
COG ID : COG1620
EC number : -
Position : 2394024 - 2395754 bp
Length : 1731 bp
Strand : -
Note : TIGRFAM: L-lactate transport; PFAM: L-lactate permease; KEGG: chy:CHY_0431 L-lactate/glycolate permease

DNA sequence :
ATGTGGCTACAAGAAACGAACCCTTTTGGGAACATTGGGATTTCCGCACTGGTTGCTTCTATACCAATTCTTATTCTGTT
CTACGCCCTTGCAATTAAACGCATGAAGGGGCATATAGCAGGCATAATCACCCTTGTTGCAGCAATTTTAGTTGCTATCG
TTGCCTACGGTATGCCAGCTAAATTAGCCGTACTTTCAACGATATACGGTATTTTAACGGGGATATTTCCCATTGGTTGG
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TGTTGTAAGTCAAATGATAGCAAATCAATTACCTTTACTATCCTTTGTTGTTCCGTTCTGGTTGGTCTTTATTATGTCTG
GCTGGAAGGGCATGAAAGAAGTTTTTGCACCAGTTTTCGTCACTGCAGCTTCCTTCAGTGTTACCATGTGGTTCGTAGCA
TTTAAAATTGGTCCTGAATTACCCAATATTATTTCAGCACTGGTAGCCATTGTAGTACTGGTTTCTTTCTTAAAGGTCTG
GAAGCCAAAGCAAATCTGGCGTTTTCCTAATGAACCTGCAGCCAGTATGGAAGTAAAGCATCACCCCTTTGGTAGAATTG
TACAAGCTTGGACTCCCTTTATTGTGCTGACTGTATTAATTGGTGACTGGGGAATTAGTGGTATTAAGTACCTGTTGGAT
CAGTTTACTGTTAAAATTCCCATTGCTGGCTTGCATAATGCTATTATGATTGGGGACAAACCTCTAGAAGTTATCTATAA
ATTTAACTGGTTAGGGGCAGCTGGTACTGCCATTCTCATTGCAACCATTATATCAGCCATTATCCTAAGGGTACGTCCTA
AAACATATCTTTCTGTATTTGGAGAAACCTTAAACAGCTTGAAGTATTCTCTAACAACGGTTGCTTGTGTTCTAGGTTTT
GCCTATGTTGCTAACTTTGCTGGAATTACCCCTACCCTGGGACAAGCCCTCACTGTAACTGGATCTTTCTTCCCGTTTGT
TTCCCCCTTTCTGGGATGGGTAGGTGTCTTTGTTACCGGCAGTGATACCTCTGCCAATGCATTGTTCTGCAACATGCAGA
AAATAACAGCCCAACAGATTGATGTAAACCCCGTTTTAACTGTAACAGCTAACACTAGCGGTGGTGTGGCTGCCAAGATG
ATTTCACCTCAGAGTATTGCAGTGGCTTGTGCATCTGTAAATTTGGTTGGTAAAGAGAGTGATTTGTTTAGATTTACTGT
AAAACACAGTTTACTCTTTACAGCAATCATGGGTGTAATTGTATATATACAAGCATACTATTTAAAAGGGATGGTGCCTG
CAGTGGTAGAGGCTTCCGCTGTTGCGAAGGCCGCAACTCCTGATTATGGACTAAGTACAGTAGCTTTAGTAGTATCCTTT
GCTGTTATGGTGCTGCTTGGTATAGTAGCTGCTCGTCAGAGAATGGAATAA

Protein sequence :
MWLQETNPFGNIGISALVASIPILILFYALAIKRMKGHIAGIITLVAAILVAIVAYGMPAKLAVLSTIYGILTGIFPIGW
IVLCAVFLYNLTVKTGHFEVIKDSIASITEDRRLQALLIGYCFGAFLEGAAGFGAPVAITAGMLVGLGFQPLYAAGLCLI
ANTAPVAFGGIGIPIITAGKVSGLDPFVVSQMIANQLPLLSFVVPFWLVFIMSGWKGMKEVFAPVFVTAASFSVTMWFVA
FKIGPELPNIISALVAIVVLVSFLKVWKPKQIWRFPNEPAASMEVKHHPFGRIVQAWTPFIVLTVLIGDWGISGIKYLLD
QFTVKIPIAGLHNAIMIGDKPLEVIYKFNWLGAAGTAILIATIISAIILRVRPKTYLSVFGETLNSLKYSLTTVACVLGF
AYVANFAGITPTLGQALTVTGSFFPFVSPFLGWVGVFVTGSDTSANALFCNMQKITAQQIDVNPVLTVTANTSGGVAAKM
ISPQSIAVACASVNLVGKESDLFRFTVKHSLLFTAIMGVIVYIQAYYLKGMVPAVVEASAVAKAATPDYGLSTVALVVSF
AVMVLLGIVAARQRME

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
glcA CAE85240.1 GlcA protein, putative glycolate permease Not tested PAI V 536 Protein 6e-109 53