Name : tcdA (CD630_06630) Accession : YP_001087137.1 Strain : Clostridium difficile 630 Genome accession: NC_009089 Putative virulence/resistance : Virulence Product : Toxin A Function : - COG functional category : R : General function prediction only COG ID : COG5263 EC number : 2.4.1.- Position : 795843 - 803975 bp Length : 8133 bp Strand : + Note : Evidence 1a : Function experimentally demonstrated in the studied strain; PubMedId : 18480324,18480323,17237138, 16857405, 15831824, 11591205,10981356,15576779; Product type e : enzyme DNA sequence : ATGTCTTTAATATCTAAAGAAGAGTTAATAAAACTCGCATATAGCATTAGACCAAGAGAAAATGAGTATAAAACTATACT AACTAATTTAGACGAATATAATAAGTTAACTACAAACAATAATGAAAATAAATATTTACAATTAAAAAAACTAAATGAAT CAATTGATGTTTTTATGAATAAATATAAAACTTCAAGCAGAAATAGAGCACTCTCTAATCTAAAAAAAGATATATTAAAA GAAGTAATTCTTATTAAAAATTCCAATACAAGCCCTGTAGAAAAAAATTTACATTTTGTATGGATAGGTGGAGAAGTCAG TGATATTGCTCTTGAATACATAAAACAATGGGCTGATATTAATGCAGAATATAATATTAAACTGTGGTATGATAGTGAAG 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TCTTATTACCTATAGCTGGTATATCTGCAGGAATACCTTCATTAGTTAATAATGAATTAATATTGCATGATAAGGCAACT TCAGTGGTAAACTATTTTAATCATTTGTCTGAATCTAAAAAATATGGCCCTCTTAAAACAGAAGATGATAAAATTTTAGT TCCTATTGATGATTTAGTAATATCAGAAATAGATTTTAATAATAATTCGATAAAACTAGGAACATGTAATATATTAGCAA TGGAGGGGGGATCAGGACACACAGTGACTGGTAATATAGATCACTTTTTCTCATCTCCATCTATAAGTTCTCATATTCCT TCATTATCAATTTATTCTGCAATAGGTATAGAAACAGAAAATCTAGATTTTTCAAAAAAAATAATGATGTTACCTAATGC TCCTTCAAGAGTGTTTTGGTGGGAAACTGGAGCAGTTCCAGGTTTAAGATCATTGGAAAATGACGGAACTAGATTACTTG ATTCAATAAGAGATTTATACCCAGGTAAATTTTACTGGAGATTCTATGCTTTTTTCGATTATGCAATAACTACATTAAAA CCAGTTTATGAAGACACTAATATTAAAATTAAACTAGATAAAGATACTAGAAACTTCATAATGCCAACTATAACTACTAA CGAAATTAGAAACAAATTATCTTATTCATTTGATGGAGCAGGAGGAACTTACTCTTTATTATTATCTTCATATCCAATAT CAACGAATATAAATTTATCTAAAGATGATTTATGGATATTTAATATTGATAATGAAGTAAGAGAAATATCTATAGAAAAT GGTACTATTAAAAAAGGAAAGTTAATAAAAGATGTTTTAAGTAAAATTGATATAAATAAAAATAAACTTATTATAGGCAA TCAAACAATAGATTTTTCAGGCGATATAGATAATAAAGATAGATATATATTCTTGACTTGTGAGTTAGATGATAAAATTA 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Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
tcdA | CAA63564.1 | - | Virulence | PaLoc | Protein | 0.0 | 99 |
tcdB | CAA63562.1 | - | Virulence | PaLoc | Protein | 0.0 | 48 |
Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
tcdA | YP_001087137.1 | Toxin A | VFG2287 | Protein | 0.0 | 100 |
tcdA | YP_001087137.1 | Toxin A | VFG2288 | Protein | 0.0 | 48 |