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Name : tcdB (CD630_06600) Accession : YP_001087135.1 Strain : Clostridium difficile 630 Genome accession: NC_009089 Putative virulence/resistance : Virulence Product : Toxin B Function : - COG functional category : R : General function prediction only COG ID : COG5263 EC number : 2.4.1.- Position : 787393 - 794493 bp Length : 7101 bp Strand : + Note : Evidence 1a : Function experimentally demonstrated in the studied strain; PubMedId : 18480324,18480323,17237138, 16857405, 15831824, 15673503,11591205,10981356, 15576779; Product type e : enzyme DNA sequence : ATGAGTTTAGTTAATAGAAAACAGTTAGAAAAAATGGCAAATGTAAGATTTCGTACTCAAGAAGATGAATATGTTGCAAT ATTGGATGCTTTAGAAGAATATCATAATATGTCAGAGAATACTGTAGTCGAAAAATATTTAAAATTAAAAGATATAAATA GTTTAACAGATATTTATATAGATACATATAAAAAATCTGGTAGAAATAAAGCCTTAAAAAAATTTAAGGAATATCTAGTT ACAGAAGTATTAGAGCTAAAGAATAATAATTTAACTCCAGTTGAGAAAAATTTACATTTTGTTTGGATTGGAGGTCAAAT AAATGACACTGCTATTAATTATATAAATCAATGGAAAGATGTAAATAGTGATTATAATGTTAATGTTTTTTATGATAGTA 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CAAAAGAATATATATCATTTAATCCTAAAGAAAATAAAATTACAGTAAAATCTAAAAATTTACCTGAGCTATCTACATTA TTACAAGAAATTAGAAATAATTCTAATTCAAGTGATATTGAACTAGAAGAAAAAGTAATGTTAACAGAATGTGAGATAAA TGTTATTTCAAATATAGATACGCAAATTGTTGAGGAAAGGATTGAAGAAGCTAAGAATTTAACTTCTGACTCTATTAATT ATATAAAAGATGAATTTAAACTAATAGAATCTATTTCTGATGCACTATGTGACTTAAAACAACAGAATGAATTAGAAGAT TCTCATTTTATATCTTTTGAGGACATATCAGAGACTGATGAGGGATTTAGTATAAGATTTATTAATAAAGAAACTGGAGA ATCTATATTTGTAGAAACTGAAAAAACAATATTCTCTGAATATGCTAATCATATAACTGAAGAGATTTCTAAGATAAAAG GTACTATATTTGATACTGTAAATGGTAAGTTAGTAAAAAAAGTAAATTTAGATACTACACACGAAGTAAATACTTTAAAT GCTGCATTTTTTATACAATCATTAATAGAATATAATAGTTCTAAAGAATCTCTTAGTAATTTAAGTGTAGCAATGAAAGT CCAAGTTTACGCTCAATTATTTAGTACTGGTTTAAATACTATTACAGATGCAGCCAAAGTTGTTGAATTAGTATCAACTG CATTAGATGAAACTATAGACTTACTTCCTACATTATCTGAAGGATTACCTATAATTGCAACTATTATAGATGGTGTAAGT TTAGGTGCAGCAATCAAAGAGCTAAGTGAAACGAGTGACCCATTATTAAGACAAGAAATAGAAGCTAAGATAGGTATAAT GGCAGTAAATTTAACAACAGCTACAACTGCAATCATTACTTCATCTTTGGGGATAGCTAGTGGATTTAGTATACTTTTAG 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ATGATCTATCTATACGATATGTATGGAGTAATGATGGTAATGATTTTATTCTTATGTCAACTAGTGAAGAAAATAAGGTG TCACAAGTTAAAATAAGATTCGTTAATGTTTTTAAAGATAAGACTTTGGCAAATAAGCTATCTTTTAACTTTAGTGATAA ACAAGATGTACCTGTAAGTGAAATAATCTTATCATTTACACCTTCATATTATGAGGATGGATTGATTGGCTATGATTTGG GTCTAGTTTCTTTATATAATGAGAAATTTTATATTAATAACTTTGGAATGATGGTATCTGGATTAATATATATTAATGAT TCATTATATTATTTTAAACCACCAGTAAATAATTTGATAACTGGATTTGTGACTGTAGGCGATGATAAATACTACTTTAA TCCAATTAATGGTGGAGCTGCTTCAATTGGAGAGACAATAATTGATGACAAAAATTATTATTTCAACCAAAGTGGAGTGT TACAAACAGGTGTATTTAGTACAGAAGATGGATTTAAATATTTTGCCCCAGCTAATACACTTGATGAAAACCTAGAAGGA GAAGCAATTGATTTTACTGGAAAATTAATTATTGACGAAAATATTTATTATTTTGATGATAATTATAGAGGAGCTGTAGA ATGGAAAGAATTAGATGGTGAAATGCACTATTTTAGCCCAGAAACAGGTAAAGCTTTTAAAGGTCTAAATCAAATAGGTG ATTATAAATACTATTTCAATTCTGATGGAGTTATGCAAAAAGGATTTGTTAGTATAAATGATAATAAACACTATTTTGAT GATTCTGGTGTTATGAAAGTAGGTTACACTGAAATAGATGGCAAGCATTTCTACTTTGCTGAAAACGGAGAAATGCAAAT AGGAGTATTTAATACAGAAGATGGATTTAAATATTTTGCTCATCATAATGAAGATTTAGGAAATGAAGAAGGTGAAGAAA 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AAFFIQSLIEYNSSKESLSNLSVAMKVQVYAQLFSTGLNTITDAAKVVELVSTALDETIDLLPTLSEGLPIIATIIDGVS LGAAIKELSETSDPLLRQEIEAKIGIMAVNLTTATTAIITSSLGIASGFSILLVPLAGISAGIPSLVNNELVLRDKATKV VDYFKHVSLVETEGVFTLLDDKIMMPQDDLVISEIDFNNNSIVLGKCEIWRMEGGSGHTVTDDIDHFFSAPSITYREPHL SIYDVLEVQKEELDLSKDLMVLPNAPNRVFAWETGWTPGLRSLENDGTKLLDRIRDNYEGEFYWRYFAFIADALITTLKP RYEDTNIRINLDSNTRSFIVPIITTEYIREKLSYSFYGSGGTYALSLSQYNMGINIELSESDVWIIDVDNVVRDVTIESD KIKKGDLIEGILSTLSIEENKIILNSHEINFSGEVNGSNGFVSLTFSILEGINAIIEVDLLSKSYKLLISGELKILMLNS NHIQQKIDYIGFNSELQKNIPYSFVDSEGKENGFINGSTKEGLFVSELPDVVLISKVYMDDSKPSFGYYSNNLKDVKVIT KDNVNILTGYYLKDDIKISLSLTLQDEKTIKLNSVHLDESGVAEILKFMNRKGNTNTSDSLMSFLESMNIKSIFVNFLQS NIKFILDANFIISGTTSIGQFEFICDENDNIQPYFIKFNTLETNYTLYVGNRQNMIVEPNYDLDDSGDISSTVINFSQKY LYGIDSCVNKVVISPNIYTDEINITPVYETNNTYPEVIVLDANYINEKINVNINDLSIRYVWSNDGNDFILMSTSEENKV SQVKIRFVNVFKDKTLANKLSFNFSDKQDVPVSEIILSFTPSYYEDGLIGYDLGLVSLYNEKFYINNFGMMVSGLIYIND SLYYFKPPVNNLITGFVTVGDDKYYFNPINGGAASIGETIIDDKNYYFNQSGVLQTGVFSTEDGFKYFAPANTLDENLEG EAIDFTGKLIIDENIYYFDDNYRGAVEWKELDGEMHYFSPETGKAFKGLNQIGDYKYYFNSDGVMQKGFVSINDNKHYFD DSGVMKVGYTEIDGKHFYFAENGEMQIGVFNTEDGFKYFAHHNEDLGNEEGEEISYSGILNFNNKIYYFDDSFTAVVGWK DLEDGSKYYFDEDTAEAYIGLSLINDGQYYFNDDGIMQVGFVTINDKVFYFSDSGIIESGVQNIDDNYFYIDDNGIVQIG VFDTSDGYKYFAPANTVNDNIYGQAVEYSGLVRVGEDVYYFGETYTIETGWIYDMENESDKYYFNPETKKACKGINLIDD IKYYFDEKGIMRTGLISFENNNYYFNENGEMQFGYINIEDKMFYFGEDGVMQIGVFNTPDGFKYFAHQNTLDENFEGESI NYTGWLDLDEKRYYFTDEYIAATGSVIIDGEEYYFDPDTAQLVISE |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| tcdB | CAA63562.1 | - | Virulence | PaLoc | Protein | 0.0 | 100 |
| tcdA | CAA63564.1 | - | Virulence | PaLoc | Protein | 0.0 | 48 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| tcdB | YP_001087135.1 | Toxin B | VFG2288 | Protein | 0.0 | 100 |
| tcdB | YP_001087135.1 | Toxin B | VFG2287 | Protein | 0.0 | 48 |
