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Name : tex (llmg_0297) Accession : YP_001031652.1 Strain : Lactococcus lactis MG1363 Genome accession: NC_009004 Putative virulence/resistance : Unknown Product : transcription accessory protein TEX Function : - COG functional category : K : Transcription COG ID : COG2183 EC number : - Position : 286157 - 288298 bp Length : 2142 bp Strand : + Note : contains S1 RNA binding domain; High confidence in function and specificity DNA sequence : GTGGAAAATGTTAAAAAAATTGCTGAATTATTGAATATCAAAAATTCACAAGTTGAAAAAGTATTAGAATTGACGGCTGA GGGGAACACGGTTCCTTTTATTGCTCGTTATCGTAAGGAAGCAACAGGTTCACTTGACGAAGTTGAAATCAAAAAAATTA TTGATGAAGATAATTTACTGACCAAACTTTCAGAACGTAAAACGGCTGTTTTGTCAAAAATTGAGGAGCTTGGCAAGTTA ACTGACAGTTTGAGATCACAAATTTTATCGGCCGAAAAACTAACAGAAGTCGAAGATTTGTATTTGCCTTACAAAGAAAA ACGGCGCACCAAAGCAACGATTGCTAAGGAAAATGGTCTTTTTCCATTGGCACAATTAATTGTAAAAAATTCAGCGAATC TTGAAGAAGAAGCTGAAAAATTTGTCAATGAGAATTTTACAAGTCCTCAAAAAGCTTTAGAAGGTGCCGTGGATATCTTG TCAGAAGCGATTTCTGAAGATGCGCGGTTGCGTTCATGGCTGACTGGTGAAATCAAAAACAATAGTTTACTGACAAGTAG TTTGAAAAAAGATGCCGTTGATGAAAAGCAAGTTTTTCAAATGTATTATGAATTCTCAGAAAAAGTTTCAGAATTACCAA ATTATCGTGTATTGGCTTTAAACCGTGGTGAAAAATTGGGGATTCTGTCAGTAAAATTTGAAAATAACGAAGACAAAATT TTACGTTATTTTGCCGCCCGTTTTGCTGCTCAAAATAATTTAATGATGCAAGTGGCCATTAAAGATGCCGTCAAGAAAAA ATTGATTCCGGCTATGGAACGAAGTATTCGAGGCGAGCTGACAGAAAAAGCTGAAGCATCTGCTATTGAAGTTTTTGGCG AAAATTTGAAAAATCTTTTATTGGTTGCACCGCTTAAAGGCCGTGTAGTCATGGGATTTGACCCTGCTTACCGTACTGGA GCAAAGCTTGCTATTGTTGATGAGACAGGTAAATTATTGATGACAACTGTCATTTATCCTGTCAAACCAGCAAATGCAGG ACAAATTGCTCAAGCGAAAAAAAATTTAGCAAAATTTATTCGTGAATATGGTGTAAATATGATTGCCATTGGGAATGGAA CTGCCAGCCGCGAATCTGAAAGTTTTGTTTCTGAAGTCCTCAAAGAAAATAATTTTTCTGATGTTTATTATGTGATTGTC AGTGAATCTGGAGCCTCTGTTTATTCAGCAAGTGAATTGGCACGTGAAGAATTCCCAGAATTGACTGTTGAAAAGCGGTC AGCAATTTCGATTGCACGCCGTTTGCAAGATCCATTGGCTGAACTTGTAAAAATTGAACCAAAAGCCATCGGTGTGGGTC AATATCAACATGATGTTTCTGAGAAAAAATTGACAGAAAATCTAGATTTTGTTGTTGAAACAGTCGTTAACCAAGTTGGT GTTAATGTCAATACAGCCAGTCCTAGTTTGCTTTCACACGTTGCGGGCCTTAATAAAAGTTTGGCACAGAATGTAGTAAA ATATCGTGAAGAAAATGGCGCACTCAAAACAAGAGCGGAACTAAAAAAAGTCCCACGTTTGGGAGCTAAAGCATTTGAAC AAGCGGCAGGTTTCTTAAGAATTCCAGAAGGTAAAAATTTCCTTGACAATACCGGTGTTCACCCAGAATCTTATAAAGTG ACGGAACAACTTTTGGCTGAAATTGCTGCTGGACCTGCTGTCAGTAATGAAGAATTACTGACCAAACTTTCGTCAGTAAA TATTCCTGAAATGGCTGAAAAACTTGGTCTTGGTCAGGAAACATTGACCGATATTATTAATGATTTGAAAAAACCTGGTC GTGATTTACGTGATAGCTTTGATGCACCGATTCTTCGTCAAGATGTCTTGTCTGCTGGAGATTTACAAATTGGTCAGCAA CTTGAAGGTGTGGTCCGTAATGTTGTTGATTTTGGTGCCTTTATTGATATCGGAATTAAAAATGACGGCTTGGCACACGT TTCTGATTTGAGCAAATCATTTGTCAAAAATCCAAGTGATGTGGTCGCTGTTGGACAAATTGTAACGGTTTGGGTCAAAT CTCTTGATTTACAAAGAGGAAAAATTAATTTGACCCTAGTGAATCCTCGCGAAGAAGATTAA Protein sequence : MENVKKIAELLNIKNSQVEKVLELTAEGNTVPFIARYRKEATGSLDEVEIKKIIDEDNLLTKLSERKTAVLSKIEELGKL TDSLRSQILSAEKLTEVEDLYLPYKEKRRTKATIAKENGLFPLAQLIVKNSANLEEEAEKFVNENFTSPQKALEGAVDIL SEAISEDARLRSWLTGEIKNNSLLTSSLKKDAVDEKQVFQMYYEFSEKVSELPNYRVLALNRGEKLGILSVKFENNEDKI LRYFAARFAAQNNLMMQVAIKDAVKKKLIPAMERSIRGELTEKAEASAIEVFGENLKNLLLVAPLKGRVVMGFDPAYRTG AKLAIVDETGKLLMTTVIYPVKPANAGQIAQAKKNLAKFIREYGVNMIAIGNGTASRESESFVSEVLKENNFSDVYYVIV SESGASVYSASELAREEFPELTVEKRSAISIARRLQDPLAELVKIEPKAIGVGQYQHDVSEKKLTENLDFVVETVVNQVG VNVNTASPSLLSHVAGLNKSLAQNVVKYREENGALKTRAELKKVPRLGAKAFEQAAGFLRIPEGKNFLDNTGVHPESYKV TEQLLAEIAAGPAVSNEELLTKLSSVNIPEMAEKLGLGQETLTDIINDLKKPGRDLRDSFDAPILRQDVLSAGDLQIGQQ LEGVVRNVVDFGAFIDIGIKNDGLAHVSDLSKSFVKNPSDVVAVGQIVTVWVKSLDLQRGKINLTLVNPREED |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| NMB0075 | NP_273139.1 | transcriptional accessory protein Tex | Not tested | IHT-A | Protein | 1e-138 | 46 |
