Name : leuS (NATL1_09941) Accession : YP_001014817.1 Strain : Prochlorococcus marinus NATL1A Genome accession: NC_008819 Putative virulence/resistance : Unknown Product : leucyl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : J : Translation, ribosomal structure and biogenesis COG ID : COG0495 EC number : 6.1.1.4 Position : 913884 - 916472 bp Length : 2589 bp Strand : - Note : leucine--tRNA ligase; LeuRS; class-I aminoacyl-tRNA synthetase; charges leucine by linking carboxyl group to alpha-phosphate of ATP and then transfers aminoacyl-adenylate to its tRNA; due to the large number of codons that tRNA(Leu) recognizes, the leucyl DNA sequence : TTGAATAATACTACTTCAGATATTAATGACCAGCGATACGAGCCTCGGGAAGTAGAAGCTTATTGGCAAAAAGAATGGGC TAATGATGACCTCTATAGGACAAATACTGAGGTAAATAAAGAAAATACTTTCTATGCCTTGTCGATGTTTCCATACCCAT CAGGTTCTTTACATATGGGTCACGTAAGGAATTATGTAATTACTGACGTGCTCGCTAGATATAAAAGGATGAAAGGTTTA AACGTCCTACATCCAATGGGTTGGGATTCCTTCGGATTACCTGCTGAAAATGCAGCAATAGAGAGAGAAACAAGTCCATC GACATGGACAGATAAAAATATTTCACAAATGAAAGATCAATTAGATCGTCTAGGACTATCAATAGATTGGTCTAAAGAAG TTACTACTTGCAAAGAAGACTATTATAAATGGACTCAATATATATTTAATCAATTACATAAAAATAATCTTGCCTATCAA AAAAAAGCAACAGTTAATTGGGATCCAATTGATCAAACTGTTCTTGCTAATGAGCAAGTAGACGCTGAAGGTAAATCATG GAGATCTGGAGCTAAAGTTGAGAAAAAAGAATTAAATCAGTGGTTTTTACGAATTACTAGTTTCGCCGAAGATCTTAATA AGGATTTAGTTACGCTTAATGACTGGCCAGATAGAGTAAGAGTTATGCAAAAAAATTGGATTGGTAAATCCATCGGAGCA GAAATAACATTTGATATCAAAAATAGCGACCAAAAAATAACAGCTTTCACAACAAGAATAGATACTGTTTATGGAGTAAG TTATCTGGTATTAGCATCAAATCATCCATTAATTGATCAATTAATAAGTTCTAATGATATAGATAAATTAAATGACTTTA GACAAACTCAAGAAAAGTTAAGTGATCTTGAACGTAATTCAGATACCAGACAAAAACTTGGAATGTACTTAGGAGTAGAT GCAATTAATCCAGCAAATAATAAAGAGATACCGATTTGGATAGGAGACTATGTGATTATGGAATATGGAACTGGTGCTGT GATGGGTGTTCCAGCTCACGATAGTAGAGATTATCAGTTTGCGAAATCATATGATTTACCAATTCAATATGTAATAAAAC CTAATATTGGTGAAGATGAAAGTTATTTAAATGCTGAATTTGTTGATAAGGGAGTCATGATCAATTCAGATAAATTTAAT GGTATTGAATCTGATATTGCAAAAACAAAAATACTTGAATTTGGTTCAAATTCAAATTGGGCAAAACCAAAGATCACATA CAAATTAAGAGATTGGCTTATATCTAGACAACGATATTGGGGCTGCCCAATTCCGATTATTAATTGTAAGAAGTGTGGCC AAGTAAGAGTCCCTGACGATGATCTTCCAGTTGTATTACCAATTGATATTAAATTAACTGGTAAAGGTAAGAGTCCTTTA ACAACCAAAACCGAATGGATAAATACTTGTTGCCCAAAATGTGGAACTGATGCAAAAAGAGAAACTGATACAATGGACAC TTTTATGTGTTCATCTTGGTACTTTTTAAGATATATAAACCCTGATAATTGTGAAAAGCCTTTTCTGAAAAGCGAAATAG ACAAATGGCTTCCAGTTAAGCAGTATGTCGGTGGTATCGAGCACGCTATTTTACATTTACTATATTCTAGATTTTTAACC AAGGCTCTCAAGAGATGTGGATTAATAAATATCGATGAACCTTTTAAGAAACTGCTAACTCAAGGGATGGTTCAAGCCGT TACTTTTAAAAATCCCAATACAAATAAATATTTTTCAAAGGATCAAATTAAAGATATTGATAATCCTAAAGATCCACTTA CAGGAGAGAATATTGAAATCATCTATGAAAAGATGTCGAAGTCAAAATACAATGGTGTAGATCCATCTGTAGTGATAGAT AAATATGGAGCTGACACAGCAAGAATGTTTATTCTTTTTAAAGCTCCACCGGAAAAAGATTTAGAGTGGGATGACTCCGA TGTCGAAGGTCAATACCGATTTATACAGAGACTCTGGAAATTTGTTATTAATACCTTTAAACTAACAAATAATAATTCAA GATCTAATATAGAAAAAGAAAAGTCTAAAGACGAAGAGGCTTTACGCCTAATTAATATTGCTATTAAGGAAATTACTGAT GATTTGGATAATCTTCAATTTAATACAGCAATATCTGAACTTATGAAGGTTGTAAATGGCCTAAGTTTAATAGTTAATTA CTGTAGTAATGAAACACTAAATAAAGTTATTTCAATATTAGTTAAAATAACTTCTCCATTTTCTCCTCATATTGCAGAGG AGCTTTGGAAGACAATTGGAAATACCCAAAGTATTCATCTTCAGTCATGGCCAGAATTTGATGCAGGTGCAATTGAACAA GATACTTTTAAACTTATGATTCAAATCAATGGAAAAGTTAGAGGATCAATTAATGCTAGTAAAAATCTATCTAAAGAAAA TTTAGAGGACTTAGCTATTAAAACTGAGGCTGCTATAAAATGGATGGATGGAAAAGAACCAAAACGAATAATTGTTGTCC CGAATAAATTAGTAAATATAGTTATTTAG Protein sequence : MNNTTSDINDQRYEPREVEAYWQKEWANDDLYRTNTEVNKENTFYALSMFPYPSGSLHMGHVRNYVITDVLARYKRMKGL NVLHPMGWDSFGLPAENAAIERETSPSTWTDKNISQMKDQLDRLGLSIDWSKEVTTCKEDYYKWTQYIFNQLHKNNLAYQ KKATVNWDPIDQTVLANEQVDAEGKSWRSGAKVEKKELNQWFLRITSFAEDLNKDLVTLNDWPDRVRVMQKNWIGKSIGA EITFDIKNSDQKITAFTTRIDTVYGVSYLVLASNHPLIDQLISSNDIDKLNDFRQTQEKLSDLERNSDTRQKLGMYLGVD AINPANNKEIPIWIGDYVIMEYGTGAVMGVPAHDSRDYQFAKSYDLPIQYVIKPNIGEDESYLNAEFVDKGVMINSDKFN GIESDIAKTKILEFGSNSNWAKPKITYKLRDWLISRQRYWGCPIPIINCKKCGQVRVPDDDLPVVLPIDIKLTGKGKSPL TTKTEWINTCCPKCGTDAKRETDTMDTFMCSSWYFLRYINPDNCEKPFLKSEIDKWLPVKQYVGGIEHAILHLLYSRFLT KALKRCGLINIDEPFKKLLTQGMVQAVTFKNPNTNKYFSKDQIKDIDNPKDPLTGENIEIIYEKMSKSKYNGVDPSVVID KYGADTARMFILFKAPPEKDLEWDDSDVEGQYRFIQRLWKFVINTFKLTNNNSRSNIEKEKSKDEEALRLINIAIKEITD DLDNLQFNTAISELMKVVNGLSLIVNYCSNETLNKVISILVKITSPFSPHIAEELWKTIGNTQSIHLQSWPEFDAGAIEQ DTFKLMIQINGKVRGSINASKNLSKENLEDLAIKTEAAIKWMDGKEPKRIIVVPNKLVNIVI |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
leuS | YP_281511.2 | leucyl-tRNA synthetase | Not tested | Not named | Protein | 7e-160 | 41 |