Name : leuS (P9515_09711) Accession : YP_001011285.1 Strain : Prochlorococcus marinus MIT 9515 Genome accession: NC_008817 Putative virulence/resistance : Unknown Product : leucyl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : J : Translation, ribosomal structure and biogenesis COG ID : COG0495 EC number : 6.1.1.4 Position : 865515 - 868109 bp Length : 2595 bp Strand : + Note : leucine--tRNA ligase; LeuRS; class-I aminoacyl-tRNA synthetase; charges leucine by linking carboxyl group to alpha-phosphate of ATP and then transfers aminoacyl-adenylate to its tRNA; due to the large number of codons that tRNA(Leu) recognizes, the leucyl DNA sequence : GTGATTTATTCTGAGAATACAGATGAAAAGTCCAATCAACATACAAATAATTTATATAAACCATGTGAGATAGAAAATAA ATGGCAGGAAATTTGGGATAAGGAAAACTTATATAAAACAGATGACAAATCTAGTAAGAAAGAAAAATTCTATGCGCTAT CTATGTTTCCTTACCCATCAGGGAATCTTCATATGGGACATGTACGAAATTATGTAATAACAGATTTAATTGCTCGATTT CAAAGATTTCAAGGGAAATCATTATTACATCCAATGGGCTGGGACGCATTTGGTTTACCTGCAGAGAACGCAGCTATAGA AAGAGGAATTAACCCTAATGATTGGACCAAAAAAAATATCGCTCATATGAAATCACAATTAAAATTATTAGGTTTATCAG TTGATTGGGATAAAGAATTTGCCACTTGTGATGAAAATTATTATCTCTGGACACAATTTTTATTTTTAGAGTTACATAAA TCAGGTCTTGTTTATCAAAAGGAATCAGAAGTTAATTGGGACCCAATTGATAATACAGTTTTAGCTAATGAACAAGTTGA TTCAGAAGGTAAATCATGGAGATCCGGAGCAAAAGTTGAAAAGAAACTTTTAACACAATGGTTTTTAAAAATAACAAATT ATACAGAAGAGTTATTGCAAGATTTAGAAAAATTAAGCGAATGGCCAGAACGAGTAAAAATAATGCAGGAAAATTGGATT GGCAAATCAAAAGGGGCAAATATAATTTTTAAAATAAATGAATTTGAAAATGAAAAAATAAAAGTATTTACTACAAGACC AGATACTCTTTTTGGGGTTACCTATATAGCAATTTCAATTAACAATCCTTTAATTAACAAAATTTCTGATAATGAAATCT TAAGTAAATTAGAAAATTTAAAAATTTATTTAAAGAAAAATCAAGATAAGGATCAAAAGAAAATTGGAATTCCAACCAAT TTAAAGGCTATAAATCCTATAAATTCAAATGAAATTCCTATTTGGATAGCAAGTTATGTTCTTGATGAATATGGAACTGG AGCTGTAATGGGCGTTCCAGCCCATGATCAAAGAGATTTTGAATTTGCAAAAATTAATTTTATTGATATAAAACAAGTAA TTATTAAAGATAAGGATAATGATAAAAGTACTTTTAAATTAAAAAATGCTTTTACTGATAATGGCTTTTTAATTAATTCA AACAATTTTAATGGATTATGTAATAATGATGCCAAAAAGCAAATACTTGAACAAGGCAAAATAAATGGATGGGCAGAAGA AGAAATTCACTATCGATTAAGAGATTGGTTGATTTCAAGGCAACGATATTGGGGATGCCCAATACCAATTATTAAATGTA ATAATTGTGGCTCTATTCCCGTAAATAAAAAAAATCTACCTGTGAAATTACCGAAAGAAATTGAAATTTCTTCTAATAAG ATTAATTCTCTAGGTAGTTACAAGGATTGGGTTAAAACAACATGTCCAAAATGCGGAAATTTGGCGAGTAGGGAGACTGA TACTATGGATACCTTCATGTGTTCATCATGGTATTTTTTACGTTATCCCTCATCAAAATGTAAAACAAAGCCATTCGAAA AAGATAATGTAAACAAATGGTTACCTGTAGATCAATATGTTGGTGGTGTAGAACACGCAATTCTTCACCTTCTTTATGCA AGATTTCTTACCAAAGCACTTAGAGATAATAACCTTTTCGATATTGATGAACCATTTAAAAAACTTTTAACACAAGGTAT GGTTCAAGCTGCAGCTTATAAAAATACAAAAACAGGAAAATATATCTCTCCAAAAGATATTAAAGATTTTAATAATCCTA CTGATCCAAACGATGATTCAAAACTTGAGGTTCTTTTTGAAAAAATGTCAAAATCTAAATATAATGGGATAGATCCGGAA TCGGTAATTAAAAAATATGGAGCAGATACAGCCAGAATGTTTATATTATTTAAGGCTCCTCCAGAAAAAGACCTTGAATG GGGTGACTCTGATGTAGAAGGACAATATAGATTTTTATGTAGAATATGGAAACTTTTCTTAGATTACAGAAATAACGAAA GCTGGGATAATCAAAAGAACTACAATAGAGAAAAAGAAAATTCATTAACTAAGTCTATTAATATAGCTATTAAAGAAATT TCTAATGATATAAAAAATAATCAATTTAATACAGCTATATCCGAATTGATGAAATTTTATAATTCATTATCCTCCAGTAT GATTTACGTAAATAAAGACTTAAGGAAAGATGCTTTTAAAAAATTCTGTATATTACTAGCACCATTTGCTCCTCACATAG CAGAAGAGATTTGGAATTTAATAGGTTATCAAAAATCTGTACATTTAGAAAGATGGCCAATATTTAATGAAGATGCTTTA AAGGAAGATTGTTATGAATTAGTCATCCAAATCAATGGAAAAGTTAGAGACAAAATTAATGTAGGAATCGATATTTCTGA AGATCAAATTAAACAAAAAACATTAACAAGACCTAACGTAAGAAAATGGATTGATCAAAAAACCATAAGAAAAATAATAA TTGTAAAAGGTAAAATAATGAATATTGTTGTTTAA Protein sequence : MIYSENTDEKSNQHTNNLYKPCEIENKWQEIWDKENLYKTDDKSSKKEKFYALSMFPYPSGNLHMGHVRNYVITDLIARF QRFQGKSLLHPMGWDAFGLPAENAAIERGINPNDWTKKNIAHMKSQLKLLGLSVDWDKEFATCDENYYLWTQFLFLELHK SGLVYQKESEVNWDPIDNTVLANEQVDSEGKSWRSGAKVEKKLLTQWFLKITNYTEELLQDLEKLSEWPERVKIMQENWI GKSKGANIIFKINEFENEKIKVFTTRPDTLFGVTYIAISINNPLINKISDNEILSKLENLKIYLKKNQDKDQKKIGIPTN LKAINPINSNEIPIWIASYVLDEYGTGAVMGVPAHDQRDFEFAKINFIDIKQVIIKDKDNDKSTFKLKNAFTDNGFLINS NNFNGLCNNDAKKQILEQGKINGWAEEEIHYRLRDWLISRQRYWGCPIPIIKCNNCGSIPVNKKNLPVKLPKEIEISSNK INSLGSYKDWVKTTCPKCGNLASRETDTMDTFMCSSWYFLRYPSSKCKTKPFEKDNVNKWLPVDQYVGGVEHAILHLLYA RFLTKALRDNNLFDIDEPFKKLLTQGMVQAAAYKNTKTGKYISPKDIKDFNNPTDPNDDSKLEVLFEKMSKSKYNGIDPE SVIKKYGADTARMFILFKAPPEKDLEWGDSDVEGQYRFLCRIWKLFLDYRNNESWDNQKNYNREKENSLTKSINIAIKEI SNDIKNNQFNTAISELMKFYNSLSSSMIYVNKDLRKDAFKKFCILLAPFAPHIAEEIWNLIGYQKSVHLERWPIFNEDAL KEDCYELVIQINGKVRDKINVGIDISEDQIKQKTLTRPNVRKWIDQKTIRKIIIVKGKIMNIVV |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
leuS | YP_281511.2 | leucyl-tRNA synthetase | Not tested | Not named | Protein | 7e-153 | 42 |