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Name : lctP (CJJ81176_0113) Accession : YP_999802.1 Strain : Campylobacter jejuni 81-176 Genome accession: NC_008787 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1620 EC number : - Position : 97679 - 99361 bp Length : 1683 bp Strand : - Note : identified by match to protein family HMM PF02652; match to protein family HMM TIGR00795 DNA sequence : TTGGAACAAATTTTAACATGGCAACAAATTTATGACCCTTTTTCAAATATTTGGCTAAGTGCTTTAGTGGCATTTTTACC TATACTATGTTTTTTAGTTTGTTTGGTTGTTTTAAAACTTAAAGGCTATCAAGCAGGTTTTTTAACTGTTATACTTGCTA CTTTAGTAGCTTTATTTGCCTATAAAATGCCTTGGAATTTAGTGGGTGCAAGTTTTATTCAAGGCTTTACAAATGGTATG TGGCCTATAGCTTGGATTATCATCGCGGCAATCTTTCTTTACAAACTTTCTATCAAGTCAGGTTCTTTTGAAATCATTAA AAAAAGCGTGATGAGCATTACTCCAGATCATAGAATTCAAGTGATTTTAATAGGTTTTTGTTTTGGTTCATTTTTAGAGG GTGCTATAGGTTTTGGTGGCCCTGTGGCTATAACCGCTGCACTTTTAGTAGGACTTGGCTTGCGTCCTTTACAAGCTGCA GGGCTTTGTCTTATCGCAAATACCGCTCCTGTTGCTTTTGGTGCGGTGGGAATTCCTATTATTGCTATGGCAAATCTTGT CGGCATAGAACAGCATTCAGTTTCTGCCATGGTAGGTAGAATGCTAGTTCCTTTAAGCCTTACTATACCTTTTTTCATAG TTTTTTTAATGGATGGATTTAAAGGTATTAAAGAAACTTTTCCAGCTATTTTAGTTGCGGCGCTAAGTTTTACAACTACT CAATTTTTAAGCTCAAATCACCTAGGAGCGGAATTACCTGATATTATTTCAGCTGTGGTTTCTTTAGCAGTTACGACTGT ATTTTTGAAATTTTGGAAACCAAAAAATATTTTTAGATTTGACAATGAAAGCAATTTCACTCAAGATAACACCTTAAGTT TTAATCAAATTTTAAAAGCTTGGTCACCTTTTATTTTACTCATTGTTTGTATTATCATTTGGACACAACCTTGGTTTAAA GCCCTCTTTGATAAGGACGGAATTTTAAGCTATACAAGTATTACTTTACAATTTAGCAATATCACAACTGGAATTTTAAG CCCTTCTATCACAGGCATAGGAGAAGCTAAGCCTTTATCTTTGGCCTTGGGTGTAGATTTAATCAATGGAAAAACCGTAG CTCAAGCAGGAACAGCGATTTTACTTGCCGCTTTTCTAACTATAGCTATTTTAAAAATCAAAGCCGAAGATGCTGCAGAA TGCTTTTGGGTTACCTTAAAAGAAATGGCTATACCTTGTATCACCATAGGTTTGGTTGTGGCCTTTGCTTTTATCTCTAA AAATAGTGGTATGAGCACTACTTTAGGACTTGCTTTTGCACACACAGGTGATGCTTTTTCTTTCTTTTCACCAATCATTG GCTGGATAGGGGTATTTTTAACAGGCTCTGATACAAGTGCTAATTTACTTTTTGGAACCTTGCAACAAGTAAGCGCTCAA AAACTAGGTATTAGCGAAGCTTTATTTTTAGCAGCTAATTCAGTAGGTGGGGTTGTTGGAAAGATGATCAGTCCACAAAG CATTGCTATAGCTTGTGCAGCGGTTGGACTTGTGGGAAAAGAATCTGATCTTTTCAAATTCACATTAAAATATTCTGTAG CTTTTATTATTTTAATAGGAATTTGGACTTGCATTATAGCTTTTTTCTTACAAGGAATCATCCCTGAAGTTATAGTGAAA TAA Protein sequence : MEQILTWQQIYDPFSNIWLSALVAFLPILCFLVCLVVLKLKGYQAGFLTVILATLVALFAYKMPWNLVGASFIQGFTNGM WPIAWIIIAAIFLYKLSIKSGSFEIIKKSVMSITPDHRIQVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPVAITAALLVGLGLRPLQAA GLCLIANTAPVAFGAVGIPIIAMANLVGIEQHSVSAMVGRMLVPLSLTIPFFIVFLMDGFKGIKETFPAILVAALSFTTT QFLSSNHLGAELPDIISAVVSLAVTTVFLKFWKPKNIFRFDNESNFTQDNTLSFNQILKAWSPFILLIVCIIIWTQPWFK ALFDKDGILSYTSITLQFSNITTGILSPSITGIGEAKPLSLALGVDLINGKTVAQAGTAILLAAFLTIAILKIKAEDAAE CFWVTLKEMAIPCITIGLVVAFAFISKNSGMSTTLGLAFAHTGDAFSFFSPIIGWIGVFLTGSDTSANLLFGTLQQVSAQ KLGISEALFLAANSVGGVVGKMISPQSIAIACAAVGLVGKESDLFKFTLKYSVAFIILIGIWTCIIAFFLQGIIPEVIVK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 4e-100 | 50 |
