Name : CJJ81176_0580 (CJJ81176_0580) Accession : YP_001000255.1 Strain : Campylobacter jejuni 81-176 Genome accession: NC_008787 Putative virulence/resistance : Unknown Product : hypothetical protein Function : - COG functional category : P : Inorganic ion transport and metabolism COG ID : COG0471 EC number : - Position : 514411 - 515697 bp Length : 1287 bp Strand : + Note : identified by match to protein family HMM PF03600; match to protein family HMM PF07158 DNA sequence : ATGGTTTTTTTAATCATCTCTAGTATTATAGTGGCTATTATTTTGGGCTATATTACTAGACATAATGTTGGAATTTTTGC TATGATTTTTGCTTATATTATAGGAGCTTTTTTTATGGATTTAGCTCCTAAAAAAATCATAGCTTTTTGGCCTATTTCTA TATTTTTTGTTATTTTTGCTGTCTCATTGTTTTATAATTTTGCAACCGTAAATGGAACTCTTGAAAAATTAGCTGGACAT TTGATGTATCGTTTTGCTAATCATCCTTATTTGCTTCCTTTTGTTATTTTTGTGGTTAGTGCTATTATAGCTGCTTTAGG AGCAGGTTTTTATACAGTTTTAGCTTTTATGGCACCACTTACTTTTTTACTTTGCGATAAAATCGGTTTAAGCAAAATTG CTGGAGCTATGGCTATAAATTATGGTGCTTTGGGAGGAGCAAATTTTATGACTTCTCAAAGCGGGATTATTTTTCGAGGA TTGATGGAAAATTCAGGCATTGAAGCAAATGAAGCTTTTGCAAATTCTAGTATTATTTTTGCTTTTACTATAATTTTGCC TATTGTGGTATTATCTTTTTTTGTGTTTAATGCTTTTAAAAATAATATAAAAATTAGTGTTATTTCAAAACCTGATCCAT TTGATTATAAACAAAAAACTACTTTAATTCTCATGTTTATGATGATTGTTGTTGTTTTAATCTTTCCTGTGCTAAATATT ATTTTTCCACATAATGAGATAATTAGTTATTTTAATAAAAAAATAGATATAGCCATGATAGCCATGATTTTTGTTGCCAT TGCTTTATTTTTAAAATTAGCCGATGAGAAACAAGTTGTTGCTTTAATTCCTTGGGGAACCTTGATAATGATTTGTGGAG TAGGGATGTTAATTAGCATAGCAGTTGAAGCAGGGGCTATAAAATTATTTTCAGATCTTGTAGAAAATGAGATCAATGTG ATTTTTATTCCGTTAATAATGTGTGCTATTGCAGCTCTTATGTCGCTTTTTTCAAGTACTTTGGGTGTGGTTACTCCAGC GCTTTTTCCTATAGTTCCAAGCATTGCTGCAAGCAGTGGATTAAGCGAGGCATTGCTTTTTTCTTGTATTGTTGTAGGGG CTCAAGCTTCTGCTATTTCTCCTTTTTCTTCTGGAGGAAGTCTAATTTTAGGATCTTGCCCTGATAAATATAAGGAAAAA TTATTTAAAGATTTACTTATTAAAGCTGTGCCTATAGGATTTATAGCGGCGATTTTAGCTACTATTATAATGAGTTTTAT TTTATAA Protein sequence : MVFLIISSIIVAIILGYITRHNVGIFAMIFAYIIGAFFMDLAPKKIIAFWPISIFFVIFAVSLFYNFATVNGTLEKLAGH LMYRFANHPYLLPFVIFVVSAIIAALGAGFYTVLAFMAPLTFLLCDKIGLSKIAGAMAINYGALGGANFMTSQSGIIFRG LMENSGIEANEAFANSSIIFAFTIILPIVVLSFFVFNAFKNNIKISVISKPDPFDYKQKTTLILMFMMIVVVLIFPVLNI IFPHNEIISYFNKKIDIAMIAMIFVAIALFLKLADEKQVVALIPWGTLIMICGVGMLISIAVEAGAIKLFSDLVENEINV IFIPLIMCAIAALMSLFSSTLGVVTPALFPIVPSIAASSGLSEALLFSCIVVGAQASAISPFSSGGSLILGSCPDKYKEK LFKDLLIKAVPIGFIAAILATIIMSFIL |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
M5005_Spy_0169 | YP_281533.1 | malonate permease | Not tested | Not named | Protein | 4e-67 | 41 |