Gene Information

Name : CJJ81176_0580 (CJJ81176_0580)
Accession : YP_001000255.1
Strain : Campylobacter jejuni 81-176
Genome accession: NC_008787
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : hypothetical protein
Function : -
COG functional category : P : Inorganic ion transport and metabolism
COG ID : COG0471
EC number : -
Position : 514411 - 515697 bp
Length : 1287 bp
Strand : +
Note : identified by match to protein family HMM PF03600; match to protein family HMM PF07158

DNA sequence :
ATGGTTTTTTTAATCATCTCTAGTATTATAGTGGCTATTATTTTGGGCTATATTACTAGACATAATGTTGGAATTTTTGC
TATGATTTTTGCTTATATTATAGGAGCTTTTTTTATGGATTTAGCTCCTAAAAAAATCATAGCTTTTTGGCCTATTTCTA
TATTTTTTGTTATTTTTGCTGTCTCATTGTTTTATAATTTTGCAACCGTAAATGGAACTCTTGAAAAATTAGCTGGACAT
TTGATGTATCGTTTTGCTAATCATCCTTATTTGCTTCCTTTTGTTATTTTTGTGGTTAGTGCTATTATAGCTGCTTTAGG
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CTGGAGCTATGGCTATAAATTATGGTGCTTTGGGAGGAGCAAATTTTATGACTTCTCAAAGCGGGATTATTTTTCGAGGA
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TTGATTATAAACAAAAAACTACTTTAATTCTCATGTTTATGATGATTGTTGTTGTTTTAATCTTTCCTGTGCTAAATATT
ATTTTTCCACATAATGAGATAATTAGTTATTTTAATAAAAAAATAGATATAGCCATGATAGCCATGATTTTTGTTGCCAT
TGCTTTATTTTTAAAATTAGCCGATGAGAAACAAGTTGTTGCTTTAATTCCTTGGGGAACCTTGATAATGATTTGTGGAG
TAGGGATGTTAATTAGCATAGCAGTTGAAGCAGGGGCTATAAAATTATTTTCAGATCTTGTAGAAAATGAGATCAATGTG
ATTTTTATTCCGTTAATAATGTGTGCTATTGCAGCTCTTATGTCGCTTTTTTCAAGTACTTTGGGTGTGGTTACTCCAGC
GCTTTTTCCTATAGTTCCAAGCATTGCTGCAAGCAGTGGATTAAGCGAGGCATTGCTTTTTTCTTGTATTGTTGTAGGGG
CTCAAGCTTCTGCTATTTCTCCTTTTTCTTCTGGAGGAAGTCTAATTTTAGGATCTTGCCCTGATAAATATAAGGAAAAA
TTATTTAAAGATTTACTTATTAAAGCTGTGCCTATAGGATTTATAGCGGCGATTTTAGCTACTATTATAATGAGTTTTAT
TTTATAA

Protein sequence :
MVFLIISSIIVAIILGYITRHNVGIFAMIFAYIIGAFFMDLAPKKIIAFWPISIFFVIFAVSLFYNFATVNGTLEKLAGH
LMYRFANHPYLLPFVIFVVSAIIAALGAGFYTVLAFMAPLTFLLCDKIGLSKIAGAMAINYGALGGANFMTSQSGIIFRG
LMENSGIEANEAFANSSIIFAFTIILPIVVLSFFVFNAFKNNIKISVISKPDPFDYKQKTTLILMFMMIVVVLIFPVLNI
IFPHNEIISYFNKKIDIAMIAMIFVAIALFLKLADEKQVVALIPWGTLIMICGVGMLISIAVEAGAIKLFSDLVENEINV
IFIPLIMCAIAALMSLFSSTLGVVTPALFPIVPSIAASSGLSEALLFSCIVVGAQASAISPFSSGGSLILGSCPDKYKEK
LFKDLLIKAVPIGFIAAILATIIMSFIL

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
M5005_Spy_0169 YP_281533.1 malonate permease Not tested Not named Protein 4e-67 41