|
Name : Sputw3181_1813 (Sputw3181_1813) Accession : YP_963203.1 Strain : Shewanella sp. W3-18-1 Genome accession: NC_008750 Putative virulence/resistance : Unknown Product : hypothetical protein Function : - COG functional category : R : General function prediction only COG ID : COG1033 EC number : - Position : 2087471 - 2089786 bp Length : 2316 bp Strand : + Note : KEGG: shm:Shewmr7_1754 hypothetical protein DNA sequence : ATGTTAGAAAAACTGGTCAACGGATTTGAATCATTTTTATTTCGCAATCGCGCATGGGTAGTTGGTATTTTTGCGTTATT GACACTGTTTTTGGGATATCAAGCTAGTCAGTTGAAAATGGATGCGGCGTTTATCAAAAATATTCCGCTAAACCACAGTT ATATGCAGACTTACCTCAAACATCAAAAGGATTTTGGGGGAGCGAATAGCATTATGGTGGCCGTTGAAGATACAAGCGGC AATATTTTTAATGCAAATTACTTTGATACGTTAAAAAACGTCCATGACCAACTCTTCTTTATCCCCGGGGTCGAACGTTC GCAGGTGAAATCTATTTTTTCTCCTTCAACGCGTTTTACGGAAGTGGTAGAAGATGGCTTTGCAGGGGGGCCTGTGATCC CCGCTGATTTTTCAACGACTCAAACAGGGTTGGATACGGTTCGCGATAATATTGAAAAAGCAGGGATTGTTGGGCGCTTA ATCGCAAATGATTACAGTGCTGCTATGGTGTCCGCCCAATTAATGGATTTTGATCCACAAACAGGTAAACCACTGGATAC TATCGCTTTTGCGGCTCAACTTGAAAATGAACTCCGAGGGAAATTCGAAACCGATAAGGTTAAAATTCACATTATTGGTT TTGCCAAAATGGCGGGTGATGTTGCCGACGGTGCCAAGGGCGTGTTGCTGTTTTTTGTGATCGCGATTTTGATCACGGCC GTGATGGTTTATCTTTTTTCTAAGTCCCTGATCCTCACTATTTTGCCTTTGGCTTGCAGCTTGACAGCGGTGGTATGGCA ACTTGGACTATTAACGGTGATCGGTTTTGGTCTCGATCCCATGTCGATTTTAGTGCCATTCCTCGTATTTGCGATTGGGG TGAGCCACGGTGTGCAAATGATCAATGCGGTTAGGCGCCGAGTGATGGATGGGCAAACGACAAAAGCGGCGGCGGCATCG GCGTTTCGTAGTTTATTAGTCCCAGGCGGTGTGGCGTTACTCTCTGATACCGTTGGTTTTATTACACTGTTATCTATTGA TATCGGCATTATCCGTGAGTTAGCTATTTCTGCGTCTTTAGGCGTAGGTGTGATTATTTTCACTAACCTTATTTTGCTGC CATTAGTGATTTCTTTCACTGAATTGAAAGCCGTCAAACACGCAGAGCCGACGGCTGAAGAAGTGCGTGCTGAAGCCATT TGGCGTTTTTTAGCAAAGTTTGCGACCCCTAAGTATGCTGTTGTGGTGATTATCGCAACTACAGCATTGTATTTTGTTGG TTTGCAGCAGGCTAATCAGATGAAAATTGGCGATTTGCAGGGTGGGGCTCCCGCCTTACATCAAGACTCACGGTATAACT TAGATACTTTCTTTATTACTGACCATTTTTCTATTACCACAGATGTGATGACTGTGATTGTTGAAGCGACTCCAGAGGCA TGTACTTATCATGATATATTGACGCAAATAGATGAATTTGAATGGTTAGTTCGCAATACTCCTGGGATTGAATCGACAGT GAGTTTAGCTTCAGTTGCAAAAAAAGTGAATGCGGGCTTTAACGAAGGTAATCCAAGATGGGAAGTGCTGCCGCGCACGA CGGCAAGCTTGGTACAAGCGATAGGCCAGATCCCAACAACATCAGGGTTGTTAAATGGTGATTGTTCCGTGATGCCCGTG TATTTGTTTATGAAAGATCATAAGGCCGAAACCATCGAAACCGTTGTGGCAAAGGTGAAGGCGGTCGCGGCGAAAATGGA TAATGAACAATTGCAGTTTAAGCTGGCGTCGGGTCCTGTGGGTGTGATGGCTGCGACCAACGAAGCCGTTGCTGCCGCGC AATTGCCTATGATGCTATACGTCTATGGTGCTGTTTTTGTACTTTGTTTAATTAGCTTTAAATCCTTTAAAGCGACGGTG GCGGTGATTATTCCTTTATATGTTGTTTCAACATTAGCGCAAGCCTTGATGACGCAGCTTAATATTGGGCTCGCGGTCAG TACGTTACCTGTGATTGCTCTTGGTGTGGGAATTGGTGTGGATTATGGGATTTATATCTTATCTACTATGTCGTCTAAGC TGTCTAACGGTATGCCTGTTCAGCAGGCTTACTATGAAGCTTTGGTCGAACGGGGTAGTGCGGTGATTTTCACTGGTTTG ACTTTGGCGATTGGTGTGAGCACTTGGTTTTTCTCGGCGCTTAAGTTCCAAATGGATATGGGAATATTGCTTACCTTCAT GTTTGTGGTAAATATGCTGGGTGCAATAATTATCCTACCCGCGTTAGCCGCGGTATTTTGGCGACAAGCCAAGTAG Protein sequence : MLEKLVNGFESFLFRNRAWVVGIFALLTLFLGYQASQLKMDAAFIKNIPLNHSYMQTYLKHQKDFGGANSIMVAVEDTSG NIFNANYFDTLKNVHDQLFFIPGVERSQVKSIFSPSTRFTEVVEDGFAGGPVIPADFSTTQTGLDTVRDNIEKAGIVGRL IANDYSAAMVSAQLMDFDPQTGKPLDTIAFAAQLENELRGKFETDKVKIHIIGFAKMAGDVADGAKGVLLFFVIAILITA VMVYLFSKSLILTILPLACSLTAVVWQLGLLTVIGFGLDPMSILVPFLVFAIGVSHGVQMINAVRRRVMDGQTTKAAAAS AFRSLLVPGGVALLSDTVGFITLLSIDIGIIRELAISASLGVGVIIFTNLILLPLVISFTELKAVKHAEPTAEEVRAEAI WRFLAKFATPKYAVVVIIATTALYFVGLQQANQMKIGDLQGGAPALHQDSRYNLDTFFITDHFSITTDVMTVIVEATPEA CTYHDILTQIDEFEWLVRNTPGIESTVSLASVAKKVNAGFNEGNPRWEVLPRTTASLVQAIGQIPTTSGLLNGDCSVMPV YLFMKDHKAETIETVVAKVKAVAAKMDNEQLQFKLASGPVGVMAATNEAVAAAQLPMMLYVYGAVFVLCLISFKSFKATV AVIIPLYVVSTLAQALMTQLNIGLAVSTLPVIALGVGIGVDYGIYILSTMSSKLSNGMPVQQAYYEALVERGSAVIFTGL TLAIGVSTWFFSALKFQMDMGILLTFMFVVNMLGAIIILPALAAVFWRQAK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| unnamed | AAK01517.1 | transport protein | Not tested | PAGI-1 | Protein | 4e-122 | 41 |
