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Name : Ping_3383 (Ping_3383) Accession : YP_944668.1 Strain : Psychromonas ingrahamii 37 Genome accession: NC_008709 Putative virulence/resistance : Virulence Product : DNA mismatch repair protein MutS Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG0249 EC number : - Position : 4178736 - 4181306 bp Length : 2571 bp Strand : + Note : TIGRFAM: DNA mismatch repair protein MutS; PFAM: DNA mismatch repair protein MutS domain protein; MutS III domain protein; MutS II domain protein; MutS IV domain protein; KEGG: plu:plu0722 DNA mismatch repair protein MutS DNA sequence : ATGACGCTAAGTGCGCAACAATTACAACAACATACCCCAATGATGCAACAATTTTTAACCATCAAGAGCGAAGTGCCCGA CACTCTCCTTTTTTATCGCATGGGTGATTTTTACGAATTATTTTTTGATGATGCACGTAAAGCCTCACAGCTTCTGGGTA TTTCTTTAACCCAACGTGGTAAAACCGGTGGTAATGCCATACCCATGGCCGGTGTTCCATACCATAGTGTAGAAGGATAT TTAGCAAAATTAATTGCAATGGGAGAATCCATTGCAATTTGCGAGCAAATAGGTGATCCAGCCACTTCAAAAGGGCCTGT TGAACGAAAATTGGTGCGTATTATCACGCCGGGTACTGTTACCGATGAAGCTTTACTTAACGATCGTCAGGACAATTTAT TATGCTCGGTCTACCAGTTACAAAATAGCTTTGGCATTGCGTCATTAGATCTTGGTAGCGGTCGTTTTATTATTAATCAA TTCCAGCATACTGAAACCTTACAAGCAGAACTACAACGCCTTAATCCTGCCGAGCTTTTATATCCTGAAAACTTTGAACA TATGGATTTAATAGAGCACCTACAAACCATTCGTCGCCGCCCTGAATGGGAATTTGAGCTGGCCACCAGCAAAAAAATAT TAAATCAACAATTTTCCACCAAGGATTTAATCGGATTTGGTGTAGAAAAAGCAGAGGTTGCGCTTTGTGCCGCAGGCGCG TTACTGCAGTATATTAAAGATACCCAACGCACCAGTTTGCCACATTTACAATCGATCCAGTTAGAAAAAAATATTGACAG TGTTATTTTAGATGCTGCAACACGAAAAAACTTAGAGTTAACCCAGAACCTTTCCGGCGGCTTTGATAATACCTTAGCTG AAGTACTGGATTTCACCGTCACACCAATGGGAAGCAGACTATTAAAACGTTGGATACATCAACCGATCCGCAATTTTAAT ACGCTAACTTACCGCCAAACGATGATCCAAACCTTAATCGAACAGGATCTAAGCAGTGCCCTGGCTGACCCCCTAAAACA GATTGGTGATGTTGAACGTGTTATTGCCCGATTGGCATTACGCTCTGCCCGTCCACGCGATTTAACGCGCTTGCGTACCG CTTTTTCACTCTTACCAGAACTCCAGCACCTGATCGCAGACCTGCCAACTGAATTAGTCGGTAAGCTCAATAAAGAGATG GGACTTTACCCAGAGCTGCTGACATTATTAGAAAAAGCAGTCATTGATAATCCACCAGTTATTATTCGCGACGGTGGGGT TATCAAAGAGGGTTATAATGAAGAGTTAGACCAGTGGCGAAATCTTGCCAAAGGCGCAACCGATTATCTTGAGCAACTTG AAACTCGCGAACGTCAGGCAACCGGCATCAGCACCTTAAAAGTAGGCTATAACCGTGTGCATGGTTATTATATAGAAACC AGTCGTTCACAATCAGATATTGTTCCTGCCCACTACATCCGCCGGCAGACACTGAAAAATACCGAACGTTATATTATTGC TGAATTAAAAGAGCATGAAGATAAGGTTTTATCGAGCCGAGGCAAAGCGCTCGCCTTAGAAAAAAAGCTCTATGAGCAGT TAATCGACCTGTTATTACCGCATCTGCAAAATTTACAGTCAACCGCGCAAGCACTGGCCGAGTTAGATGTCCTTAATAAC CTTGCAGAACGCGCTGTGACACTCAATTATGTGCGCCCTACCTTACAAGCTGAAAATGGTATTGAGATTGAAGAAGGCCG TCATCCGGTCGTTGAACAAGTGAGTAAAACACCTTTTATTGCCAATCCGGTTATGCTTAATGATAAGCGTCGTATGCTGA TTATTACGGGTCCTAATATGGGCGGAAAATCCACTTATATGCGCCAGGTTGCACTAATGGTATTAATGGCACATATCGGC AGTTTCATCCCTGCTCAGCAGGCAAAAATAGGCCCTGTGGATCGTATTTTCACACGGATTGGTGCATCGGATGATCTTGC CAGTGGACGTTCCACTTTTATGGTTGAGATGACCGAAACGGCTAATATTTTGCATAATGCCACCAAAAACAGTTTGGTAT TAATGGATGAAATAGGCCGGGGCACCAGTACTTTTGACGGTTTATCTCTGGCTTGGGCATGTGCTGAACAATTAGCCAAA AAAATCCAAGCCTACACGCTTTTTGCAACGCATTATTTTGAGTTAACCAAGCTACCTGAAAATATTCCCGAGTTAGTCAA TGTTCACCTGGATGCCGTTGAACATGGTGATGCTATTGCCTTTTTGCATGCAGTACAGGAAGGTGCCGCTAATAAAAGTT ACGGTTTGCAGGTTGCCGCATTAGCGGGTGTGCCAAAAGAGGTGGTGAGTAATGCCAAAAATATATTACGTCAATTAGAA TTAGGCTCGCAGCCTCAAGCGAACTTAAATGAAAAACCGCTGCAGACAACCTTAGCTTTTGATGACGCGCAAACGAATCA GGCTCTGCTATTATTGGCCAACATTAATCCCGATGAGTTAACCCCCAAAAAAGCGCTGGAGTTAATTTATTTATTAAAAG AGCGGGCTTAG Protein sequence : MTLSAQQLQQHTPMMQQFLTIKSEVPDTLLFYRMGDFYELFFDDARKASQLLGISLTQRGKTGGNAIPMAGVPYHSVEGY LAKLIAMGESIAICEQIGDPATSKGPVERKLVRIITPGTVTDEALLNDRQDNLLCSVYQLQNSFGIASLDLGSGRFIINQ FQHTETLQAELQRLNPAELLYPENFEHMDLIEHLQTIRRRPEWEFELATSKKILNQQFSTKDLIGFGVEKAEVALCAAGA LLQYIKDTQRTSLPHLQSIQLEKNIDSVILDAATRKNLELTQNLSGGFDNTLAEVLDFTVTPMGSRLLKRWIHQPIRNFN TLTYRQTMIQTLIEQDLSSALADPLKQIGDVERVIARLALRSARPRDLTRLRTAFSLLPELQHLIADLPTELVGKLNKEM GLYPELLTLLEKAVIDNPPVIIRDGGVIKEGYNEELDQWRNLAKGATDYLEQLETRERQATGISTLKVGYNRVHGYYIET SRSQSDIVPAHYIRRQTLKNTERYIIAELKEHEDKVLSSRGKALALEKKLYEQLIDLLLPHLQNLQSTAQALAELDVLNN LAERAVTLNYVRPTLQAENGIEIEEGRHPVVEQVSKTPFIANPVMLNDKRRMLIITGPNMGGKSTYMRQVALMVLMAHIG SFIPAQQAKIGPVDRIFTRIGASDDLASGRSTFMVEMTETANILHNATKNSLVLMDEIGRGTSTFDGLSLAWACAEQLAK KIQAYTLFATHYFELTKLPENIPELVNVHLDAVEHGDAIAFLHAVQEGAANKSYGLQVAALAGVPKEVVSNAKNILRQLE LGSQPQANLNEKPLQTTLAFDDAQTNQALLLLANINPDELTPKKALELIYLLKERA |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| mutS | AAA80578.1 | DNA mismatch repair protein | Virulence | SPI-1 | Protein | 0.0 | 63 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| Ping_3383 | YP_944668.1 | DNA mismatch repair protein MutS | VFG0562 | Protein | 0.0 | 66 |
