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Name : Ping_2523 (Ping_2523) Accession : YP_943843.1 Strain : Psychromonas ingrahamii 37 Genome accession: NC_008709 Putative virulence/resistance : Unknown Product : type III restriction enzyme, res subunit Function : - COG functional category : K : Transcription COG ID : COG1061 EC number : - Position : 3081848 - 3084751 bp Length : 2904 bp Strand : - Note : PFAM: helicase domain protein; type III restriction enzyme, res subunit; DEAD/DEAH box helicase domain protein; SMART: DEAD-like helicases-like; KEGG: vch:VC0812 helicase-related protein DNA sequence : GTGTCTGCCATCGCATTTAATAATGTATCACTTGCTTGTGATGCAAAAAAACTAACAACAGGTGGCGATGATCCCTTATT GCCTAAGCTTATTCATGCCATTAATCATGCCAGTGAAATTGAGATTGCCGTTTCATTTGTACAGTGCAGCGGTTTGAATT TATTATTTGAACCTTTAAAAGATGCCATTCTTAATGGCGCAATCTTAAAATTATTAACCTCTGATTATCTTGATATTACT GATCCCGTGGCATTAAGAGAATTAATGCCTTTGCTTGATCGTGGGGCTGATATTCGCATTTACCAAAGTGATAACAAGCA AGCCTTTCACATGAAGTCTTATATTTTTGTAAAAACTGTTGCAGAAAAAAAGGAAGAGGAGCTTATTGATGGCTGTGCTT TTATCGGCTCAAATAATATTAGTAAAAGTGCATTAACGACTGGGCATGAATGGTGTTTCAGACATGATTATCTACCACCA AGAACGTCACGTGAAGCGCTCGAATTTAACTATATACGCAGTGCTTTTAACGAAATCTTTGCCCATCCTTTAGTGCATAA ACTGGATCATGATTGGATTTCAGCTTATTTAAGACGGCGTAAAATGATGCAGTTTGTCAGCGTCGATCCCGGCTCACCCC CAGAATATATTGAGCCAGCAACCCCTAATCATATTCAAATTGAAGCATTAACGGCTTTAGTAAAAAGCCGGGAAATTGGC TTTAAACGAGGTTTAGTTGTTCTGGCCACAGGAATGGGTAAAACCTGGTTAGCCGCCTTTGATGTGTTGCAGTTAAAAGC TAAGCGGATTTTATTTGTCGCACATAGAGAAGAGATATTACTGCAGGCTCAACGCACATTTGCACAGTTAATGCCGGAAA AAAGCAGCGGTTTTTATAATGCACAAAATCGTCAAAAAGGGGCTGATGTATTGTTTGCTTCAGTGCAGACGATAGGCAGA GAAAATCATTTGCAACAGTTCTCAAAAGATCACTTCGATTATGTTGTGGTGGATGAATTTCATCACGCCAGTGCACCCGT TTACAGTAATTTATTAGCCTATTTTAATCCGGATTTTCTACTTGGTTTAACCGCAACGCCTGAACGAACAGATCAATCAG ATATTCTTTGTTTGTGTGATAATAATTTAGTTTATGAACGTAATTTAACACAGGGAATTGATGATAAAATTCTAGCGCCG TTTAAATATTACGGGATCTGGGATGAATCTGTTAACTATCAGGCAATCCCCTGGCGCAATGGACGTTTTGATCCGGAATC TATTGATAACCAGTTTGCTACCCAAAAACGGGCAAGTCATATATTAAAAAAATGGCATCAATTCAAACAACAAAAAACCT TAGCTTTTTGTATTTCTGTTAAGCATGCAGATTATATGGCAGAGAGTTTTAACAACGCGGGTATTAAGGCTGTGTCAGTG CATTCTAAGTCTGAAATCAGACGCAATGAGGCGCTTACTCAGTTACAAAATGGCACACTCGAGGTAATGTTTTCTGTCGA TCTGTTTAATGAGGGCACAGATCTTCCCGCTCTTGATACGATTTTAATGCTCCGACCCAGTAATTCTAAAATTTTATTTC TGCAGCAGTTGGGGCGGGGGCTACGCCTGCACAAGAACAAAACGCATCTTGTTGTACTGGATTTTATTGGCAATCACCAC TCATTTTTAAATAAGCCCTACGCGCTATTTGGTAGTTCCACTATCCCTGTATTAATAAAAAAAGTGAAAGAAGACAAGCT CGCCGATGGCTGTTTTGTTAATTATGATATTGAAATAACCCAATTTTGGAAGCAGTTGGCAAAACAGCAGCGCACCACGG CTATTGAAGACTACCAGAATCTATATGAACAACTTGGACATAGACCAACAGCAAGTGAGTTTTTAAATGCGTATGGTGAT TTAAATAAGGTTAATAAACAGCACAAAAGCTGGATGGCTCTAGTGGCTGCGCAACAGCAGGAGCCGGAATTTTCAGATCT AATTGAAAACTATGGGGATTTTTTGCTGGAGGCTGTTCAGGCAACTGCAATGGCAAAATCCTTTAAGGCGATTCTATTGG AAGCATTTTTACGTTTAGATGGTTTTTCTAATCCGCCAACATTAGAAAAGCTGGCCAAGGATAGCAAGTTGGTTTTTGAC CGTTACCCTCTTCTTAAACAAAGCGAACTATCCAAAAATCTGCAACATTGTCAGTCAGACTCTGTGCAATGGTTAGAGTA TTGGAAAAAAAATCCAATAAAATTTAGCTGTACAGTGAACAATAAAACGGGAAAGCAGTGGTTTAAAATCAAAGATAACA GATTAGTTGTCAACCTTGATGTGAGAGAGCAGGACAAACCAGCACTGCATGATGCCGTGCAGGAACTGTTAACATTACGG TTATTACAATATTCACAACGTCCAAATAAAGTTAGTAAGGCAGCTGTGAACCAACAGGAAAATAACAGTTTAATTAAAAG AGAAAAAGCCATTCAACTTGCGTTTTATCCCAACTTGAAAATTGCCTGCGGACACTTTAAAACAGGCGATGATTTAGAGT TTGAATATAAGAATGCACCAGTTGGGTTTGGTCATTTACAGGCAGATAAACATTTTCTTGCTAAAGCTTCCGGAAACTCA ATGGATGGTGGTAAAAATCCGGTTAGAGATGGAGACACGTTATTACTTGAGAAGATAACACCAACCAGTGCAGGATCTTT ACAAGGTTTAACCGTGGCGATTGAGAAGCAGGATGAAGCAGGTGACGGGCAATGCCTATTAAGAGTTGTCAAAAAAACTG CTGATGGTCGTTATAAATTAGTGGCTAAGAACCCTGACTATAAAACAATTTATGCTGATGAAGATATGCAAACCTTTGCC AGATTGAAAGGGGTTGTACGTTAA Protein sequence : MSAIAFNNVSLACDAKKLTTGGDDPLLPKLIHAINHASEIEIAVSFVQCSGLNLLFEPLKDAILNGAILKLLTSDYLDIT DPVALRELMPLLDRGADIRIYQSDNKQAFHMKSYIFVKTVAEKKEEELIDGCAFIGSNNISKSALTTGHEWCFRHDYLPP RTSREALEFNYIRSAFNEIFAHPLVHKLDHDWISAYLRRRKMMQFVSVDPGSPPEYIEPATPNHIQIEALTALVKSREIG FKRGLVVLATGMGKTWLAAFDVLQLKAKRILFVAHREEILLQAQRTFAQLMPEKSSGFYNAQNRQKGADVLFASVQTIGR ENHLQQFSKDHFDYVVVDEFHHASAPVYSNLLAYFNPDFLLGLTATPERTDQSDILCLCDNNLVYERNLTQGIDDKILAP FKYYGIWDESVNYQAIPWRNGRFDPESIDNQFATQKRASHILKKWHQFKQQKTLAFCISVKHADYMAESFNNAGIKAVSV HSKSEIRRNEALTQLQNGTLEVMFSVDLFNEGTDLPALDTILMLRPSNSKILFLQQLGRGLRLHKNKTHLVVLDFIGNHH SFLNKPYALFGSSTIPVLIKKVKEDKLADGCFVNYDIEITQFWKQLAKQQRTTAIEDYQNLYEQLGHRPTASEFLNAYGD LNKVNKQHKSWMALVAAQQQEPEFSDLIENYGDFLLEAVQATAMAKSFKAILLEAFLRLDGFSNPPTLEKLAKDSKLVFD RYPLLKQSELSKNLQHCQSDSVQWLEYWKKNPIKFSCTVNNKTGKQWFKIKDNRLVVNLDVREQDKPALHDAVQELLTLR LLQYSQRPNKVSKAAVNQQENNSLIKREKAIQLAFYPNLKIACGHFKTGDDLEFEYKNAPVGFGHLQADKHFLAKASGNS MDGGKNPVRDGDTLLLEKITPTSAGSLQGLTVAIEKQDEAGDGQCLLRVVKKTADGRYKLVAKNPDYKTIYADEDMQTFA RLKGVVR |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| VC0395_A0337 | YP_001216293.1 | DEAD/DEAH box helicase | Not tested | VPI-1 | Protein | 0.0 | 56 |
