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Name : Ping_1810 (Ping_1810) Accession : YP_943186.1 Strain : Psychromonas ingrahamii 37 Genome accession: NC_008709 Putative virulence/resistance : Unknown Product : RNA-binding S1 domain-containing protein Function : - COG functional category : K : Transcription COG ID : COG2183 EC number : - Position : 2196030 - 2198216 bp Length : 2187 bp Strand : + Note : PFAM: RNA binding S1 domain protein; SMART: Resolvase, RNase H domain protein fold; KEGG: vch:VC2716 hypothetical protein DNA sequence : ATGAAAACAACGACACCGCCAGTTAGTCAACAGCTTGCAAATGAAGTTAATCTTCCACTTATGCAAGTTAACGCCTTTAT TACACTCTATGACGATGGTAATACCGTGCCTTTTATTGCCCGTTATCGCAAAGAGGTAACCCAAGGCCTGGATGATATTC AACTGCGCCTGCTGGAGACGCGCTTAATTTATTTGCGTGAATTAGATATTCGTCGTCAGAGTATTCTGAAAGCCATTGTT GCATTGGGGAAATTAACCCCGGATTTAAACCTTAAAATTAAGCAGTGTAATAATAAAAGTACACTTGAAGATCTTTATCT GCCCTATAAGAGTAAACGCGTCAGTAAAGGCGAATTAGCGATTGAAGCGGGTCTTGAACCCCTTGCGGATAAATTGTGGA TGCAGGCTGATGGTGATGCAAATATTCTAGGCAAGCAGTATATTAACCCAAAAAAAGGGGTTTCTGATATTGAAAGCGTC TTAGAGGGTGCCCTCTCTATTTGCATGGAACGCATTGTTAACGATCCGCAATTGCTTGGAAAACTGCGTCATTATCTCTC GGCCAATGCCGCTTTTGAATGCAAAGTAGCGAAGGGTAAAGAAGAGCAAGCGGTTAAATATAAAGACTATTTTGATTATC AGGAACCTCTGCATAAAATTCCTGCACACCGATTTTTAGCCATCCTGCGTGGTAAAAAAGAGGGGCTGCTTAAACTTGAT CTAAATGCCGATCCCAAACAGGATAAAAAAACCAAATCATCCTATTGTGAAAGTTTAATCGCCCATCATTTAGGTTTTTC CTGGTTGCAGTTGCCGGCCAATAATTGGCGCAAAAAAGTGATTCAAAAAGCCTGGAAGGGCAAATTAGCCGGGCAGTTGG AAACGCAGTTAATCACACGCTTAAAAGATGATGCCCATGAAAATGCCATGGATAATTTTGCGTCTAATTTAAAAGCGCTG TTAATGGCCGCGCCCGCAGGGCCCAAAGTGACCTTAGGGTTAGATCCTGGCTTGCGCACAGGCTGCAAATTAGCCGTCGT TGATAGTACCGGTAAGCTACTGGCTTATCAGACTATCTACCCGCATCAACCGGTTAATAAAACCCAACAGGCAGCACAGG AAATGCTTAAATTAATTAAAGAATTTAAGGTAGAACTGATCGCCATTGGCAATGGTACGGCATCGCGGGAATCCGATGAT TTTATCCGCGATACCTTAGCGCAGCAGAATCTGGAGGTAAGCACGGTTATCGTCAGTGAAGCCGGCGCATCGGTTTATTC GGCCTCAGAGCTTGCATCTCTCGAGTTTCCTGATATCGATGTTTCGATTAGAGGAGCGGTTTCCATTGCCCGGCGATTGC AGGATCCTTTAGCTGAGCTGGTTAAAATAGATGCCAAAGCGATCGGTGTAGGCTTATATCAGCACGACGTTAACCAAAGC AGTTTAAGCCAGCGTTTGGGCAGTGTGGTCGAAGATTGTGTTAATTCCGTGGGAGTCGATTTAAACAGTGCCTCTGTCTC TTTACTTGCACGTGTGGCTGGATTGAATCAAACGATTGCTAAAAATATCGTCAGTTATCGTGACCTGAATGGTGCCTTTA AGTCGCGCCAAGCGCTGCAAAAAGTCTCGCGCTTAGGCGATAAAGCTTATCAGCAAAGTGCCGGGTTTTTACGGATAAAT AATGCGCTTAATCCCCTTGATAATTCTGCCGTTCATCCTGAAGCTTATAATCTGGTCAAACGTATTGCGGCGCAGGAAGG GGTTAAAGTGCAGCAGTTATTAAATAATTCAGATTTGTTAAATTCGCTTGATGCACAGAACTATGCCGATCAGACCTTTG GTGTTATCAGTGTCCGAGAAATTGTTAAAGAGCTTGCCAAGCCTAAACGCGATCCCAGACCGGATTTTCAGCGGGTCGAT TTTGCAAAAAACATTAATAAAATTTCGGATTTACAGGAAGGTATGCTGCTGCAGGGGGTTATTTCTAATGTGACCAATTT TGGCGCATTTGTTGATATAGGCGTCCATCAGGATGGACTCGTGCATATCTCCCAACTTGCCGATAATTTTGTCAGTGATC CCTTCGCCATTGTGAAAGTCGGGCAGTTGGTTAATGTCCGGGTTGTTGAGATTGACGTACAAAGAAAACGCATTGCACTG AGCATGCGCCTTGCAGTTAAAGCCTGA Protein sequence : MKTTTPPVSQQLANEVNLPLMQVNAFITLYDDGNTVPFIARYRKEVTQGLDDIQLRLLETRLIYLRELDIRRQSILKAIV ALGKLTPDLNLKIKQCNNKSTLEDLYLPYKSKRVSKGELAIEAGLEPLADKLWMQADGDANILGKQYINPKKGVSDIESV LEGALSICMERIVNDPQLLGKLRHYLSANAAFECKVAKGKEEQAVKYKDYFDYQEPLHKIPAHRFLAILRGKKEGLLKLD LNADPKQDKKTKSSYCESLIAHHLGFSWLQLPANNWRKKVIQKAWKGKLAGQLETQLITRLKDDAHENAMDNFASNLKAL LMAAPAGPKVTLGLDPGLRTGCKLAVVDSTGKLLAYQTIYPHQPVNKTQQAAQEMLKLIKEFKVELIAIGNGTASRESDD FIRDTLAQQNLEVSTVIVSEAGASVYSASELASLEFPDIDVSIRGAVSIARRLQDPLAELVKIDAKAIGVGLYQHDVNQS SLSQRLGSVVEDCVNSVGVDLNSASVSLLARVAGLNQTIAKNIVSYRDLNGAFKSRQALQKVSRLGDKAYQQSAGFLRIN NALNPLDNSAVHPEAYNLVKRIAAQEGVKVQQLLNNSDLLNSLDAQNYADQTFGVISVREIVKELAKPKRDPRPDFQRVD FAKNINKISDLQEGMLLQGVISNVTNFGAFVDIGVHQDGLVHISQLADNFVSDPFAIVKVGQLVNVRVVEIDVQRKRIAL SMRLAVKA |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| NMB0075 | NP_273139.1 | transcriptional accessory protein Tex | Not tested | IHT-A | Protein | 7e-176 | 53 |
