|
Name : Rmag_0769 (Rmag_0769) Accession : YP_903967.1 Strain : Candidatus Ruthia magnifica Cm Genome accession: NC_008610 Putative virulence/resistance : Unknown Product : homoserine dehydrogenase Function : - COG functional category : E : Amino acid transport and metabolism COG ID : COG0460 EC number : 1.1.1.3 Position : 815217 - 816494 bp Length : 1278 bp Strand : + Note : catalyzes the formation of L-aspartate 4-semialdehyde from L-homoserine DNA sequence : GTGAATATTGGAATTTTAGGGCTTGGTACTGTCGGTGGTGGCGTGGTGAATGTGTTAAACAAAAACCAAGCACAAATTAC ACGCCGATCTGGCGATAATATTAACATCACTCATGCAGCTGTAAGAGATACAACCCAAATACGTATTTGTCCTACTGAGG ATATTAAGTTAACTCAAGACCCATTTGAGATTATTAATAATAATGATATTGATGTCGTTTTAGAATTAATGGGTGGCACA GGTTTAGCTAAAGATTTGGTCGAACAAGCCATTGAAAATGGAAAACATGTTGTCACAGCCAACAAAGCTTTAATTGCTAT ACATGGCAATAAACTACTTGCCTTGGCAAAAGATAACAACACGCATCTTTTATTTGAAGCGGCCGTTGCTGGTGGTATTC CTATCTTAAAAATTTTAGAACAAGGTTTAAGTGCCAATCAAATTGAATTAGTTGCTGGTATTATCAATGGTACAAGTAAC TTTATTCTAACTGAAATGCGTAATAAAGGTAGAGACTTTGGAGATGTTCTAAAAGAGGCGCAAGCATTGGGTTACGCCGA AGATGACCCTACTTTTGATGTCGAAGGTATTGATGCGGCACATAAATTAGCCATCCTCGCTTCAATGGCGTTTGGCTGTG AGTTACAATTTAATCAAGTTTCAACTGAAGGTATTAGCAAAATTAGTGGTGAAGATATTACTTTTGCAACGGAATTGGGT TATACCATTAAACACCTGGGTATTGCTAAAAAACTAGATGGAAAATTACAAATGTATGTACACCCAACTTTAGTGCCTAA AACTCATTTACTATCTAATGTTGATGGCGTTATGAACAGTGTATTGGTCAAAGGTAATGCAGTTAGTGAAACGCTTTATT ATGGTGCTGGTGCTGGTGCTGAAGCAACAGCAAGTAGTGTTATTGCTAATTTGATTGATATTATCAAGGGCACTGTGAAT CATGATATTTTAGGCTGGAAATCATTAAAAAACATTCCAAATTGCAACACTGGAGATATTGAAAGTATTTTCTACTTGCG TTTATTGACCACTGATAAACTAGGGGTTTTGGCAGATATTACAGCAACTTTAGCCAATCATAACATTAGTGTAGAGTCTG TTATACAAAAACAAATTGACCAGAAAAATAACGCGCACATTGCTATCATTACCAATCTTACAAAAACTAGTGAACTGAAC AAGGCAGTGGCAGAAATTCAAACCCATGACTACATCCAAGAAGATGTTAAAATTATTTTTGTTAAAACACTTAATTAA Protein sequence : MNIGILGLGTVGGGVVNVLNKNQAQITRRSGDNINITHAAVRDTTQIRICPTEDIKLTQDPFEIINNNDIDVVLELMGGT GLAKDLVEQAIENGKHVVTANKALIAIHGNKLLALAKDNNTHLLFEAAVAGGIPILKILEQGLSANQIELVAGIINGTSN FILTEMRNKGRDFGDVLKEAQALGYAEDDPTFDVEGIDAAHKLAILASMAFGCELQFNQVSTEGISKISGEDITFATELG YTIKHLGIAKKLDGKLQMYVHPTLVPKTHLLSNVDGVMNSVLVKGNAVSETLYYGAGAGAEATASSVIANLIDIIKGTVN HDILGWKSLKNIPNCNTGDIESIFYLRLLTTDKLGVLADITATLANHNISVESVIQKQIDQKNNAHIAIITNLTKTSELN KAVAEIQTHDYIQEDVKIIFVKTLN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| BJAB07104_00305 | YP_008207770.1 | Homoserine dehydrogenase | Not tested | AbaR25 | Protein | 2e-85 | 51 |
| BJAB0868_00309 | YP_008211635.1 | Homoserine dehydrogenase | Not tested | AbaR26 | Protein | 2e-85 | 51 |
