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Name : Rmag_0062 (Rmag_0062) Accession : YP_903334.1 Strain : Candidatus Ruthia magnifica Cm Genome accession: NC_008610 Putative virulence/resistance : Unknown Product : transketolase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0021 EC number : 2.2.1.1 Position : 71651 - 73636 bp Length : 1986 bp Strand : + Note : KEGG: tcx:Tcr_0244 transketolase; TIGRFAM: transketolase; PFAM: Transketolase domain protein; Transketolase, central region DNA sequence : ATGCCATCACGCAGAGATTTAGCAAATGCCATTCGTGCTTTAAGCATGGATGCAGTTCAAAAGGCAAACTCAGGTCATCC AGGTGCGCCAATGGGTATGGCAGATATTGCTCAGGTACTTTGGAATGATCATTTGAAGTATAACCCAATACACGCTAAGT GGGCTGATCGTGACCGTTTTGTATTATCAAATGGACATGGATCGATGCTAATTTATTCATTGCTACATTTATCAGGTTAT GATCTTAGCATGAATGATATTAAAAACTTTCGTCAATTGCATGCTAAAACAGCAGGTCATCCTGAATATGGATATGCAGA TGGTATTGAGACAACAACAGGACCATTAGGACAAGGCGTTACCAATGCAGTTGGTATGGCAATTGCCGAGCGTACATTAG GGGCACAATTTAACAAGCCAGGTCATGATATTGTTGATCATAACACCTATGTATTTATGGGTGATGGTTGCTTAATGGAG GGCTTGTCTCATGAGTCTTGCGCTATGGCTGGTACGTTGGGGCTTGGCAAATTGATTGCGTTTTGGGACGATAATGATAT TTCTATTGATGGCCATATTTCTGACTGGATGGAAAAAGATGCAGCGGGTCGTTTTGAGTCTTATGGTTGGCATGTTGTTC GTGATGTTGATGGGCATGATGCTGATGCCATTAATGCAGCTATTAATGCAGCCAAAGCTGAAACTGCTAAACCTTCGCTT ATTTGTACACGAACAACCATTGGCTTTGGTTCGCCTAATTTATGCGGTACACATAATTGTCATGGCGCCCCATTGGGTGA TGATGAAATTGCTGCAACTCGTAAAGAGTTGGGCTGGGACTTTGCGCCATTTAAAATTCCTGCAGATATTTATAAAGGCT GGGATCATAAAGAAAAAGGTACTATTGATGAATCAGCTTGGGATGTTAAATTTGCAGCTTATAAGGCTGAGTTTCCAGCA GATGCTGCTGAGTTTGAGCGCCGTATGTCGGGTGATTTGCCTGATAATTTTGTAATTGAAATGGATAAATTCATTGCTAA AACGCAAGAAGAAATGCCAAGCATCGCTTCTCGTCAAGCCTCTCAACGTACGATTGAAACCATGGCTCCTTTATTGCCAG AAATGTTTGGAGGCTCTGCTGATTTGACCGGATCTAACCTAACTAATTGGTCAGGTACTGTTAAAGTGAATGCACAAAAC GCGAATGGTAATTATATTTCATGGGGTGTTCGTGAATTTGGTATGGCACACATGATGAATGGTATGGTGCTTCATGGTGC TTTTAAGGTTTATGGTGCAACATTTTTTATGTTTATGGAATTTATGCGTAATGCATTGCGTATGTCAGCACTGATGAAAA TTGGTACAATTTATGTTTATACTCATGATTCTATCGGTCTAGGCGAAGATGGTCCTACGCATCAGCCAATTGAGCAGTTA GCAACCATGCGCATGATTCCTAATTTCCAGTCTTGGAGAGGATGCGATGCAGTGGAATCAGCGGTATCTTGGAAAATGGC GATACTTAGAAATAATGCGCCAACAGGACTGGTTTTTTCACGCCAAACTTTAACGGCAATGGAGCGAACTTCTGAGCAAG TGGCAAATATTGAAAAAGGCGGTTATATTCTTAAAGATTGTGAAGGTACGGCTGATATTATCTTTATTGCAACGGGTTCT GAAGTGGGCTTAGCAGTTGAAGCAGCAGCAGCAATGGATGTCAAAGTGCGTGTTGTTTCAATGCCTTGTACAAATGCTTA TGATGATCAAGGCCAAGCTTATAAAGATTCAGTTTTAACACCTGGTGTAAAGCGCCTTGCAATTGAGGCAGGTGTTGGTG ATGGATGGTATAAATACGTAGGTCTAGATGGTGATGTGGTTTGTATGACAACCTTCGGTGAGTCTGCACCAGCGGATCAA TTATTTAAAGCATTTGGTTTTACAATAAATAACGTCATTGCAAAAGCAATAGCTGTTATTGGTTAA Protein sequence : MPSRRDLANAIRALSMDAVQKANSGHPGAPMGMADIAQVLWNDHLKYNPIHAKWADRDRFVLSNGHGSMLIYSLLHLSGY DLSMNDIKNFRQLHAKTAGHPEYGYADGIETTTGPLGQGVTNAVGMAIAERTLGAQFNKPGHDIVDHNTYVFMGDGCLME GLSHESCAMAGTLGLGKLIAFWDDNDISIDGHISDWMEKDAAGRFESYGWHVVRDVDGHDADAINAAINAAKAETAKPSL ICTRTTIGFGSPNLCGTHNCHGAPLGDDEIAATRKELGWDFAPFKIPADIYKGWDHKEKGTIDESAWDVKFAAYKAEFPA DAAEFERRMSGDLPDNFVIEMDKFIAKTQEEMPSIASRQASQRTIETMAPLLPEMFGGSADLTGSNLTNWSGTVKVNAQN ANGNYISWGVREFGMAHMMNGMVLHGAFKVYGATFFMFMEFMRNALRMSALMKIGTIYVYTHDSIGLGEDGPTHQPIEQL ATMRMIPNFQSWRGCDAVESAVSWKMAILRNNAPTGLVFSRQTLTAMERTSEQVANIEKGGYILKDCEGTADIIFIATGS EVGLAVEAAAAMDVKVRVVSMPCTNAYDDQGQAYKDSVLTPGVKRLAIEAGVGDGWYKYVGLDGDVVCMTTFGESAPADQ LFKAFGFTINNVIAKAIAVIG |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| tktA | AAO17218.1 | TktA | Not tested | tcd island | Protein | 0.0 | 65 |
| APECO1_2641 | YP_859417.1 | transketolase | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 61 |
