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Name : Rmag_0035 (Rmag_0035) Accession : YP_903309.1 Strain : Candidatus Ruthia magnifica Cm Genome accession: NC_008610 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome-c oxidase Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG0843 EC number : 1.9.3.1 Position : 40373 - 41989 bp Length : 1617 bp Strand : + Note : PFAM: cytochrome c oxidase, subunit I; KEGG: pae:PA0106 cytochrome c oxidase, subunit I DNA sequence : ATGACAACAGCAATAGCAACAGCAACAACTTACACTAACGACCATCACGGTCCTGAAAAAGGCTTAATGAGGTGGATTAA AACGACCAATCACAAGGATATTGGTTCACTATATTTATGGTTTGCATTTACTATGGTGCTTATTGGTGGTGCTATGGCAA TGGTCATTCGTATGGAGTTGTTCCAACCAGGCATGCAACTGATTGAGCCACAATTTTTTAATCAGATGACAACCATGCAT GGTTTGATTATGGTATTTGGTGCAATTATGCCAGCGTTTGTTGGTTTGGGTAATTGGCTCATTCCAATGATGATAGGCGC GCCTGATATGGCATTACCACGGATGAATAATTGGTCTTTTTGGATTCTACCATTTGCTGGTGGCATTTTATTAAGTACGT TTTTTATGGAAGGTGGCGCACCTGCATTTGGTTGGACGTTTTATGCACCATTATCAACAACGTTTGCACCAAATAGCACC GATTTCTTTATTTTTGCGGTGCATTTATTAGGCTTTTCATCTATTATGGGCGCGATTAATATTATTGCAACTGTGCTTAA TATGCGTGCACTAGAAATGAAACTCATGGACATGCCACTGTTTGTATGGACATGGTTAATTACCTCATTTTTGTTGATTG GTGCGATGCCAGTACTTGCGGGTGCAGTTACTATGATGTTGACAGATCGTAACTTTGGTACGGCATTTTTTGATGCAACA GGTGGTGGTGATCCAGTATTGTTTCAACATATCTTTTGGTTTTTTGGCCATCCTGAGGTTTATATTATGATTTTACCAGC GTTTGGTGTGATTTCACATATTGTTCCAGCCTTTGCGCGTAAGCCTTTATTTGGTTATTCATCGATGGTTTATGCTACTG CGTCGATTGCATTTTTATCCTATATTGTGTGGGCGCACCATATGTTTTTAACTGGTATGCCAGTTGCAGGTGAGTTGTAT TTTATGTACGCAACCATGTTGATTGCTGTACCAACGGGTGTTAAGATATTTAACTGGGTGTCAACTATGTGGCGTGGATC TATGACCTTTGAAGCACCAATGTTATGGGCGATTTCATTTGTATTCTTATTCACGATTGGCGGTTTTTCTGGTTTAATGC TGGGTATTGCACCGGCTGATATTCAGTATCACGATACTTATTTTGTGGTTGCGCATTTTCATTACGTATTGGTGACAGGT GCATTATGGTCTATTATTGCAGCAACATTCTATTGGTTGCCTAAATGGACAGGAAAAATGTACAATGAAACTTTAGCAAA GGTGCATTTTTGGTGGGCGGTTATTTCAGTGAATATATTGTTCTTCCCTCAGCATTTTTTAGGTTTGGCGGGCATGCCAA GGCGTATTCCTGATTATTCATTGCAGTTTGCTGATTTTAATATGATTTCTTCTATTGGTGGTTTTGCGTTTGGCACGTCA TTTATTCTATTCACTTATATTGTGATTGATTGTATTCGTAATGGTAAACCAGCAGATTCTCGCCCTTGGGAAGGCGCTAA AGGTTTAGAATGGACTTTAGAGCCTAAGGCACAGTATCATAGTTTTAATACGCCACCAACAAGAACATTAATTGAGCAAG AATCTCAGCACTCTTAA Protein sequence : MTTAIATATTYTNDHHGPEKGLMRWIKTTNHKDIGSLYLWFAFTMVLIGGAMAMVIRMELFQPGMQLIEPQFFNQMTTMH GLIMVFGAIMPAFVGLGNWLIPMMIGAPDMALPRMNNWSFWILPFAGGILLSTFFMEGGAPAFGWTFYAPLSTTFAPNST DFFIFAVHLLGFSSIMGAINIIATVLNMRALEMKLMDMPLFVWTWLITSFLLIGAMPVLAGAVTMMLTDRNFGTAFFDAT GGGDPVLFQHIFWFFGHPEVYIMILPAFGVISHIVPAFARKPLFGYSSMVYATASIAFLSYIVWAHHMFLTGMPVAGELY FMYATMLIAVPTGVKIFNWVSTMWRGSMTFEAPMLWAISFVFLFTIGGFSGLMLGIAPADIQYHDTYFVVAHFHYVLVTG ALWSIIAATFYWLPKWTGKMYNETLAKVHFWWAVISVNILFFPQHFLGLAGMPRRIPDYSLQFADFNMISSIGGFAFGTS FILFTYIVIDCIRNGKPADSRPWEGAKGLEWTLEPKAQYHSFNTPPTRTLIEQESQHS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1478 | YP_001800872.1 | cytochrome c oxidase subunit I | Not tested | Not named | Protein | 2e-85 | 44 |
