Gene Information

Name : Rmag_0277 (Rmag_0277)
Accession : YP_903530.1
Strain : Candidatus Ruthia magnifica Cm
Genome accession: NC_008610
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : ammonium transporter
Function : -
COG functional category : P : Inorganic ion transport and metabolism
COG ID : COG0004
EC number : -
Position : 301983 - 303221 bp
Length : 1239 bp
Strand : +
Note : TIGRFAM: ammonium transporter; PFAM: Rh family protein/ammonium transporter; KEGG: cps:CPS_3995 ammonium transporter

DNA sequence :
ATGGGCGTGTTTGCACAAGATATTAACGGCGCTGATACGGCTTGGATAATGACATCAACAGCCTTGGTGTTGTTTATGAC
ATTGCCAGGTTTGGCGTTATTTTATGGTGGGCTAGTTCGCACTAAGAATATCTTATCAATACTAATGCAGTGTTTTGCTA
TTGCGGGCATTATAAGTATTTTATGGTTTGTAGTGGGTTATTCTATTGCTTTTTCAGGTGATAATCCTTACTTTGGTGAT
TTTTCTAATGTGCTTTTGGTACAAATTAGTATAAATACAGTCAATGGTTCAATTCCAGAATCTTTGTTTGCCGTGTTTCA
AATGACATTTGCCATTATTACTCCAGCTTTGATTATTGGTAGCTATGCAGAAAGAATGAAATTTTCAGCGGTGCTATTAT
TTAGCTCTATTTGGTTATTAGTGGTTTATGCGCCTGTTACGCATTGGGTGTGGGGTGGTGGTTGGCTAGGAAATGTACTT
GACTATGCTGGTGGTACAGTTGTTCATATTACTGCAGGTATTGCAGCGTTAGTAGCGGCTATTGTTTTAGGTCCTAGAAA
AGATTTTTTTAAAAAACCTATGCCACCACACAACATGACCATGACTATTACGGGTGCGGCGATGTTGTGGGTCGGTTGGT
TTGGTTTTAATGGTGGTTCTGCTTTGGTAGCAGGCGGCGATGCGGCGATGGCTATTTTGGTGACGCACATCTCAGCAGCA
ACGGGTGCGATTACGTGGATGTTTTACGAGTGGATTAAATTTGGTAAACCAACTGCATTAGGTACAGTAACAGGCATGGT
TGCAGGCTTGGGAACAATCACATCAGCCTCAGGTTTTGTGGGCCCTACAGGCGCTTTAGTGATTGGTTTTATTTCGGGTA
TTGTGTGTTTTAATGCGGTGATTATCATCAAGCAAAAATTTAAAATTGATGATTCATTAGATGTATTTCCTGTGCATGGT
GTGGGTGGTATTATTGGCACCTTAATGACAGGATTTTTTGCCTCTAAAGAGTTGGGTATTTTTTCTGGACAAGGTGGCTG
GGATCGTAAGGCAATTGTGATTGCTGACCAATTACAAATTCAATTTATAGGTGTAGTGGCAACGGTTATTTATACGGCTG
TTGTCACTTATCTTATTCTTAAAGTGGTGGATGCTATAACGGGTTTAAGAGTGAGTGAAGAGGAGGAGCAACAGGGGTTG
GATATTGTTTCTCATGAAGAAAAAGGCTACGATTTGTAA

Protein sequence :
MGVFAQDINGADTAWIMTSTALVLFMTLPGLALFYGGLVRTKNILSILMQCFAIAGIISILWFVVGYSIAFSGDNPYFGD
FSNVLLVQISINTVNGSIPESLFAVFQMTFAIITPALIIGSYAERMKFSAVLLFSSIWLLVVYAPVTHWVWGGGWLGNVL
DYAGGTVVHITAGIAALVAAIVLGPRKDFFKKPMPPHNMTMTITGAAMLWVGWFGFNGGSALVAGGDAAMAILVTHISAA
TGAITWMFYEWIKFGKPTALGTVTGMVAGLGTITSASGFVGPTGALVIGFISGIVCFNAVIIIKQKFKIDDSLDVFPVHG
VGGIIGTLMTGFFASKELGIFSGQGGWDRKAIVIADQLQIQFIGVVATVIYTAVVTYLILKVVDAITGLRVSEEEEQQGL
DIVSHEEKGYDL

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
BJAB07104_00287 YP_008207752.1 Ammonia permease Not tested AbaR25 Protein 1e-82 52
BJAB0868_00291 YP_008211617.1 Ammonia permease Not tested AbaR26 Protein 1e-82 52