Gene Information

Name : cyoB (FTN_0196)
Accession : YP_897860.1
Strain : Francisella novicida U112
Genome accession: NC_008601
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : cytochrome bo terminal oxidase subunit I
Function : -
COG functional category : C : Energy production and conversion
COG ID : COG0843
EC number : -
Position : 217534 - 219564 bp
Length : 2031 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGCTAGAAGCATTAATTGGAAAATTAAGTAATCCGCATTTAGTGTTTCCATACCTATATGAACCAGTAAGTCAACAGTT
AATTATATTAACAATGTTTATTGGAATCGTAGTCGCAGGTGTGGCATTACTAGGCGGTATTACATATTTTAGAAAATGGG
GTTACTTATGGAATGAGTGGTTCACTACTATTGACCATAAGAAAATAGGTACTATGTATACTATCGTAGCATTAGTGATG
ATGTTCCGTGGTTTTGTTGATGCTGCGATGATGAGAACACAGCAAGCGTTAGCATCTGGAGATAGTACAGGATATCTAAT
CCCTGAGCATTTTGATCAAATCTTCACTGCTCATGGTGTAATTATGATTTTCTTTGTGGCGATGCCACTTATTTTTGCAC
TAATGAACTGGGTAGTTCCTTTACAGATTGGTGCTAGAGACGTTGCGTTCCCTTATATGAACTCTTTGAGCTTTTGGTTG
TTCGTAGTCGGTGCAATGTTGATAAATATTTCACTATTGGTTGGAGATTTTGCGCACGCTGGTTGGTTAGCTTATCCGCC
ATTCTCAGAAACAACCTATAGCCCTACAGTAGGTACAGACTATTATATTTGGGGTCTACAAATATCTGGTATTGGTTCAC
TAATGACAGGGATTAACTTCTTTGTAACTATTATCAAAATGCGTTGCAAAGGTATGACGTTAATGAAGATGCCTATCTTT
ACATGGGCTTCATTATGTTCAGTTATCCTTGTGGTTGCTGCTTTCCCAGTTTTAACTGTGACTTTAGGGTTATTGACTTT
AGATAGATACTTCGGAACTCACTTCTTCACTGTTTCAGGTGGTGGAGACCAAATGATGTATGTCAATCTAATCTGGATTT
GGGGACATCCTGAGGTTTATATTCTTGTATTACCTTTATTCGGTGTATTCTCAGAAGTTGCGGCGACATTCTCTAAGAAG
CCACTTTTTGGATATACAACAATGGTTTGGGCGAGTATAGTTATTACTATCTTGTCGTTTACTGTATGGTTACACCATTT
CTTCACAATGGGTGCGAGTGCAAATGTTAATGCCTTCTTTGGAATTATGACAATGATTATTGCAATTCCTACGGGCGTTA
AGATCTTTAACTGGCTATTTACAATGTATAAAGGTCGTATTACATTTGCAACGCCGATGATGTGGCTGATTGGTTTTATG
ATAGTTTTCTCTGTTGGTGGAATGACAGGGGTATTATTATCTGTACCAGGCGTTGACTTCCAAATGCATAATAGTGTGTT
CTTAATTGCACATTTCCATAATGTTATTATTGGAGGCGTTGTATTTGGTGCCTTTTCTGGTCTTACTTTTTGGTTTCCAA
AAATATTTGGTTTCAAATTAAATGAGCGTTTAGGCAAGTATTCATTCTGGTGCTGGTTTATTGGCTTCTTTGTAGCGTTT
ATGCCATTGTATATATTAGGTACTATGGGTATGACAAGAAGACTGTATCACTATGATGCTGCCACAGGATATCAACCACT
GCTTATAGTTGCTTGGGTTGGTGCAATGATTATTGGTTTAGGAATATTACTACAAATTATACAGATTTTTGTAAGTATTA
AGCAAAGAGACCAAAATCGTGTTGGCGCTGATGCTTGGGGTTATGGTCGCACATTAGAGTGGGGTATACCTTCTCCAGTG
CCTTTCTATAATTTCTCGCATGATCCAGTGGTTGAAGAGCGTGATGCATATTGGGATCATAAGCAAAAGGGTCTAAATGT
AGATAATACTCCTGTAGGTAGTGCTAAGAAATATGAAGATATTCATATGCCAAAAAATACAGCTGTGGGAGTTATAATCG
GAGCATTCAGCTTTGTATTTGGATTCGCTGCAGTATGGCATATTTGGTGGCTTGCTATCGTCGGTGTTGTTGGTATCATT
GGTACTGTATTGTACAGATCATTTGATTATGATATCGATTACTATGTCAAGGCTGATCAAGTTAAAGAAGTTGAGAGTAG
ATATAATCAACAAGGAGAGTTACAAGTATGA

Protein sequence :
MLEALIGKLSNPHLVFPYLYEPVSQQLIILTMFIGIVVAGVALLGGITYFRKWGYLWNEWFTTIDHKKIGTMYTIVALVM
MFRGFVDAAMMRTQQALASGDSTGYLIPEHFDQIFTAHGVIMIFFVAMPLIFALMNWVVPLQIGARDVAFPYMNSLSFWL
FVVGAMLINISLLVGDFAHAGWLAYPPFSETTYSPTVGTDYYIWGLQISGIGSLMTGINFFVTIIKMRCKGMTLMKMPIF
TWASLCSVILVVAAFPVLTVTLGLLTLDRYFGTHFFTVSGGGDQMMYVNLIWIWGHPEVYILVLPLFGVFSEVAATFSKK
PLFGYTTMVWASIVITILSFTVWLHHFFTMGASANVNAFFGIMTMIIAIPTGVKIFNWLFTMYKGRITFATPMMWLIGFM
IVFSVGGMTGVLLSVPGVDFQMHNSVFLIAHFHNVIIGGVVFGAFSGLTFWFPKIFGFKLNERLGKYSFWCWFIGFFVAF
MPLYILGTMGMTRRLYHYDAATGYQPLLIVAWVGAMIIGLGILLQIIQIFVSIKQRDQNRVGADAWGYGRTLEWGIPSPV
PFYNFSHDPVVEERDAYWDHKQKGLNVDNTPVGSAKKYEDIHMPKNTAVGVIIGAFSFVFGFAAVWHIWWLAIVGVVGII
GTVLYRSFDYDIDYYVKADQVKEVESRYNQQGELQV

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
cur_1478 YP_001800872.1 cytochrome c oxidase subunit I Not tested Not named Protein 2e-81 42