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Name : gabD (FTN_0127) Accession : YP_897792.1 Strain : Francisella novicida U112 Genome accession: NC_008601 Putative virulence/resistance : Unknown Product : succinate semialdehyde dehydrogenase Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1012 EC number : - Position : 137693 - 139126 bp Length : 1434 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGTCTAATAATCTTTTAAACAAAGTAATAAGTAAATATTCTTTTGCTGGTAATAGAAGCTTTACCGTAGTTAACCCTGC GACTAACCAAGTTATATGTAGCCTTGAGCAAAAATCAGCCGATTATGTTGAAGATAGTATTTTGGTTTCAAAACATGCTC AAAATGCCTTTAGGAATAAACTTGCTGCTGAAAAATCAAAGCTTTTGGCTAGGTGGTATGATTTAGTTATAAGTAATATT GATGACTTAGCAGAAATTATCACCTTAGAAAGTGGCAAGCCATTAGCTGAGGCAAAAGTCGAAGTTCAATATGGTGCAAA TTTTATTCAATGGTATGCTGAGAAAGCCAAAAGAATAGACTCACGCGTTTTTGATCCTAACATTAGTAATGCTGAGGGTA GGGTCGATTATTATCCTGTTGGTGTGGTTGCAGCAATTACTCCTTGGAACTTCCCATTTGCGATGATTACGCGTAAAGCT GCTCCAGCGTTAGCTGCCGGTTGTAGTGTCATACTTAAGCCATCAGAGCTAACTCCTCTCACAGCACTTGCAGCTAGAGA GCTTTTTATCGCTAGCGGAGCTGATGAGAATCTTTTGCAGGTAGTTTGTGGTGATTCAAGTGTTATTGGCATAGAACTAC AAAAGAGTAGCTTGGTCAGGAAAATAACTTTTACCGGCTCTACAAGAGTTGGTAAGATGTTAATGCAACAAGCAGCAGAT ACTGTCAAAAAGATTTCATTAGAGCTAGGCGGTAATGCGCCATTTATAGTCTTTGAGAGTGCTAATCTAGAAAAAGCTGT TGAGGGTCTTATTGCAGCTAAAATTAGAAATGCCGGTCAGGTATGCATAGCACCAAATCGAATCTTTGTGCATAACTCTA TCAATAAAGAATTTATCACTATATTAAAAGCCTCGCTTGTAAAACTTAAACAAGGCAATGGTTTAGAAACTGATGTAAAA ATAGGTCCTTTAATTAACAAAGCTGCAGTTGAGAAAGTCCAACAGCATGTAGATGATGCTTTAGCAAAAGGGGCTAAGTT AGTATGTGGTGGTAGAATAAACCCAGAACTAGGTGGAAACTTTTATGAAGCTACTATTTTAGCTAATATGCAAGATACTA TGATCGCAAGTTGTGAAGAAACTTTTGGTCCTATTATTGCTATTTTTAGCTTTGATTCTGAAGATGAGGTTATCCAGCGA GCAAATAATACTAAATATGGTTTAGCAAGTTATTTCTTCAGTAATGATATTAATCAAATCAGAAGAGTTAGAAATGCTCT AGCATATGGTATGGTTGGTATAAACACTGGATCAATATCAAATGAGAAAGCACCTTTTGGAGGTATCAAAGAGTCAGGGC TTGGTAGAGAGGGATCTGATGATGGTATCTATGAGTTTCTTGAAGCTAAGTATAGTTTGCAGGTTTTTGGTTAG Protein sequence : MSNNLLNKVISKYSFAGNRSFTVVNPATNQVICSLEQKSADYVEDSILVSKHAQNAFRNKLAAEKSKLLARWYDLVISNI DDLAEIITLESGKPLAEAKVEVQYGANFIQWYAEKAKRIDSRVFDPNISNAEGRVDYYPVGVVAAITPWNFPFAMITRKA APALAAGCSVILKPSELTPLTALAARELFIASGADENLLQVVCGDSSVIGIELQKSSLVRKITFTGSTRVGKMLMQQAAD TVKKISLELGGNAPFIVFESANLEKAVEGLIAAKIRNAGQVCIAPNRIFVHNSINKEFITILKASLVKLKQGNGLETDVK IGPLINKAAVEKVQQHVDDALAKGAKLVCGGRINPELGGNFYEATILANMQDTMIASCEETFGPIIAIFSFDSEDEVIQR ANNTKYGLASYFFSNDINQIRRVRNALAYGMVGINTGSISNEKAPFGGIKESGLGREGSDDGIYEFLEAKYSLQVFG |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| orf17 | AAO17183.1 | Orf17 | Not tested | tcd island | Protein | 8e-106 | 51 |
