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Name : lwe1429 (lwe1429) Accession : YP_849626.1 Strain : Listeria welshimeri SLCC5334 Genome accession: NC_008555 Putative virulence/resistance : Virulence Product : internalin-like protein Function : - COG functional category : S : Function unknown COG ID : COG4886 EC number : - Position : 1421402 - 1423183 bp Length : 1782 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAAAACAAAATGTATTTTACTGCTTAGGATAACTCAAAATCTTCTAGCTTTAATGTTAATTGCAGCTGTCAGTATGTG GATTATTATAGGTAATGAAACAGAAGTACAAGCAGATACCATCACACAACCTACAGCTATTAATGAGCTTTTTCCTGACT CTGATTTAGCTGAAGTTATGCGAGTCGAATTAGGAAAGACCAGTGTAAATGATATAATCTCTCAAAATGAGTTGGACACA TTAACAATCCTTAACGGGGGAAATAAGAATATCAAATCGATTGAAGGTATTCAATATTTAAACAATTTAGTGAAAATAGA CTTAAATGAGAATGACATAAGCAATATAAATAATTTAGCTGGATTAACTAACTTAAAAAATCTTAATTTAGGTGAGAATT TACAACTAAAGGATATTACCGCTCTTTCTGGATTAACTACTTTAACCAATTTCACTGTAGGTTCACTGGAGTTAAGTGAT ATCAGTGCTCTATCTAATTTAGCTAACTTAACTGATTTATGGATAGCTTCTCCAAAATTAAGCAATATCAGTGCCTTATC TAATTTAACCAATCTAGAAAGTTTGACAGTAAGAATTTCTCCAATAAGCGATTTTAGTCCAGTAGCCAATTTAATTAATT TAAGAAATTTAGTTTTAGATCAAGATGGGTTAAAAGATAGTGATTTAATTTATTTGAACAATTTAACGAAATTAACGGAA TTAAGTTTAATTGATAACAATATAAGTGATATTCGCTCACTAGTGAATCTCACTAGCTTAACATCTCTCTCGTTAGATGA TAACCAGATTAAGGATATAAGTTCTTTATCCGGTCTAGCCAATAATTTAAGCTACTTGAATATTAGTGGTCAAAATATTA ATAATCCTATTATACCTTTTCAAACTGATTTAAGTATTCCTAATAATGTGATAGGAATTGATGGCACTTTATTAGACCCA TTACCTGATTATATAAGTGATGAAGGAAAGTATAATAGTCCAAATATCACTTGGAATTTGCCTACTTATGTTCCTGAAGT TAATTATGTTTATTACCAAACCATTCCAATTAGCCAAGGAGAAACTGCTATCTTTCAAGGTATAGTATATCAACCCTTGC AAGAAGAAGCAGTATCTTATAAAGTAGTTTTTAATATAGAGGGAAAAGAAACTAATGAAATGGTTGAAGTGGATAGCTTT TTAGAAGAACCTGCTACTCCAACGAAAGAAGGGTACACTTTTACTGGATGGTATGACGCAAAAATTGGTGGAAACAAATG GGATTTTGCATCAGATACTATGCCTGCAAATGATATCACATTATACGCACAGTTTAGCATCAATAATTATACTGCAACTT TTAACATTGACGGGAAAGAAACCACCGAAAGTGTTGCATATCAAAATTTAGTAACAGAGCCAACCGCTCCAGTGAAAGAA GGATACACATTCACTGGGTGGTATGACGCAAAAACAGGTGGAAACAAATGGGATTTTGCATCAGATATTATGCCTGCAAA TAACATCACTTTATACGCCCGATTTGCAAAAAATACCAGTCCAAAAAATGATAAAGGAACACCTGCAAAAGGAAATAATG GATCAAATACGAATATGAAACTGACTGCAAGCCCCAATCCAATTGAAGGAAAAACCTCAAAACCTTCCAACAAACAGTTA CCTTCAACAGGCGATGAAAATAACTTTTTACCAATCTTTTTAGGTGTTTTATGCATAAGCTTAGCAAGTGTTCTAGTTTT TTGGAGAAAACAACTTAAATAA Protein sequence : MKTKCILLLRITQNLLALMLIAAVSMWIIIGNETEVQADTITQPTAINELFPDSDLAEVMRVELGKTSVNDIISQNELDT LTILNGGNKNIKSIEGIQYLNNLVKIDLNENDISNINNLAGLTNLKNLNLGENLQLKDITALSGLTTLTNFTVGSLELSD ISALSNLANLTDLWIASPKLSNISALSNLTNLESLTVRISPISDFSPVANLINLRNLVLDQDGLKDSDLIYLNNLTKLTE LSLIDNNISDIRSLVNLTSLTSLSLDDNQIKDISSLSGLANNLSYLNISGQNINNPIIPFQTDLSIPNNVIGIDGTLLDP LPDYISDEGKYNSPNITWNLPTYVPEVNYVYYQTIPISQGETAIFQGIVYQPLQEEAVSYKVVFNIEGKETNEMVEVDSF LEEPATPTKEGYTFTGWYDAKIGGNKWDFASDTMPANDITLYAQFSINNYTATFNIDGKETTESVAYQNLVTEPTAPVKE GYTFTGWYDAKTGGNKWDFASDIMPANNITLYARFAKNTSPKNDKGTPAKGNNGSNTNMKLTASPNPIEGKTSKPSNKQL PSTGDENNFLPIFLGVLCISLASVLVFWRKQLK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| inlD | AAB67970.1 | - | Virulence | Internalin | Protein | 7e-111 | 46 |
| inlD | CAC20635.1 | internalin D | Virulence | Internalin | Protein | 8e-112 | 43 |
| inlH | CAA07457.1 | internalin H | Virulence | Internalin | Protein | 2e-112 | 43 |
| inlC2 | AAB67969.1 | internalin | Virulence | Internalin | Protein | 3e-111 | 42 |
| inlG | CAA07456.1 | internalin G | Virulence | Internalin | Protein | 3e-79 | 41 |
| inlF | CAC20634.1 | internalin F | Virulence | Internalin | Protein | 2e-80 | 41 |
