Name : STER_0882 (STER_0882) Accession : YP_820314.1 Strain : Streptococcus thermophilus LMD-9 Genome accession: NC_008532 Putative virulence/resistance : Resistance Product : cation transport ATPase Function : - COG functional category : P : Inorganic ion transport and metabolism COG ID : COG2217 EC number : - Position : 812146 - 814344 bp Length : 2199 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGTCAAATAAAACTCATTTGTCTAATTACGAAGAAATGATGTCTGAGCATCATCACAATCATGAAATGGTGGATATGAA GCACGAAAATCATGAGATGCACAACATGCACAATATGGATAATATGCATGATATGGACAATATGCACAACATGCACAATA TGGATAATATGCATGATATGCATGATATGGATAATATGCATGATATGGATAATATGCATGATATGGACAATATGCATGAT ATGGACAATATGCATGATATGATGAATCATGGAGGACACATGATGCATATGGGTGATATGAGTAAAAAGCTCAAAGTGGC TATCATTCTAATGATTCCGCTTCTACTCATTTCACCAATCGCTGGCTTTACTATCCTTAAATTCCCCGGAAGTGAAATTT TGCAACTTATCCTTGGTACAATTATCTTCTTTTACTCTGGGACTCCTTTTTTTAGAGGAGCAAAAGGTGAATTAAAAAGC CGTAAGCCAGCCATGATGATGCTGATTACAATGGGAATTTCCGTTGCCTATGCTTATTCTGTTTATGCCACAATTATGAG TCTTTACGGACATATGGGCATGAACTTCTGGTTTGAACTGGCAACTTTAATTGTCATTATGTTGATTGGTCACCTGATTG AGATGAAAGCAATCATGGGTGCTGGCGATGCATTGAAAGATTTAGCAAGCCTTGTTCCCAAAAAAGCTCACTTAAAAAGT GGGAAGGATGTGGAGCTTTCAGAACTAAAAGTTGGCGATTTGCTTTTAGTGAAAGAAAATGAAAAAATTCCTGCAGATGG CCTTATATTAAGTGAAGCGCTCGTTGATGAGTCAATGATTACTGGTGAAAGCCGAGCAGTCAATAAAAAACCAAATGACC TTGTTTATGGTGGTTCCCTCAATCAAAACCAACCATTTGAGATGAAAGTCACAACCCTTGGAAAAGATTCATTTCTCAAT CAAGTGGCTGAATTAGTCAAGAAAGCCCAAGCTCAAAAATCTAATTTGGAAAATATGGCTGACAGAGTGGCTGGTTACCT TTTCTATGCTGCACTTATTGTCAGTATCTTCTCATTAATTTTTTGGACAATTAGTTCTAACTTTAGTTTTGCTCTACTTC TTGCGGTTTCTGTTTTTGTAATTGCATGTCCACACGCTTTAGGTCTTGCGGTTCCACTTGTTGTTTCTCGCTTAACCAGT ATTTCTGCTAAAAATGGTTTATTAATTCAAAACAGAACCTCTTTGGAAAAAATAAATACAATTAAATATGCCTTAATGGA TAAAACAGGAACATTAACTGACGGTAAGTTTATTGTCCGTGATGTTATTGATTTTACTGATGAAACAGACATTCTCCAAA TCATGGCAGCACTTGAAGGAAGTTCCACTCACCCGATTGCTCAATCAATCGTTTCAGCTGCTAAACCTCTTAAAAATCTA AAAGTTGAAGCGGTTGAAAATATTCCAGGAGTTGGAATTAAAGGGCAAGTTAATCAAAACTTTTATCAAATTGTTAACTA TAAATATCTTCGTGAAAATCAACTTTCTTATGATGAACAAAAGATTGCTCAATATTTAGATTTAGGTTTAACTTTATCTT TCCTAATCAATGAACAACAAGATGTTTTAGGATTTATTGCCTTAGGAGATTCTCCTAAAGCAGACGCGAAAGCCTTTATT AATGGTTTATTAGCCCAAGGAATTACCCCTGTTATGCTCACGGGTGATAATAAAGAAACTGCTCAAAAAATTGCTAGTGC ACTAAATATTCCCGAATTTAGAGCGGAATTAAAACCTGAAGATAAAGCAGAAATTGTGAAAGAATACCAAAAGAAAGCCG GCGTTCTTTTCATTGGTGATGGTGTCAATGATGCCCCAGCCCTTGCAACTGCTACAATTGGTTTTGCGATTGGAGCAGGA ACTTCGGTTGCTATCAGTACCGCTGATGTCGTCCTAGTTAACTCCAATCCAAGTGACGTCTTGGATATGATTAACATCTC CAAACGCATGCTTAGAAAAATGAAACAAAACCTCTGGTTTGGAGCAGGCTATAACATTATTGCTATTCCTGTTGCAGCGG GTATTCTTTATCCATTTACAGGATTTTATATTGACCCTCTCATTGCAGCAGTCCTGATGTCAATCTCAACCGTGATCGTC TCAATCAACGCGATGGGATTGAGGTATGATAAAAAATAG Protein sequence : MSNKTHLSNYEEMMSEHHHNHEMVDMKHENHEMHNMHNMDNMHDMDNMHNMHNMDNMHDMHDMDNMHDMDNMHDMDNMHD MDNMHDMMNHGGHMMHMGDMSKKLKVAIILMIPLLLISPIAGFTILKFPGSEILQLILGTIIFFYSGTPFFRGAKGELKS RKPAMMMLITMGISVAYAYSVYATIMSLYGHMGMNFWFELATLIVIMLIGHLIEMKAIMGAGDALKDLASLVPKKAHLKS GKDVELSELKVGDLLLVKENEKIPADGLILSEALVDESMITGESRAVNKKPNDLVYGGSLNQNQPFEMKVTTLGKDSFLN QVAELVKKAQAQKSNLENMADRVAGYLFYAALIVSIFSLIFWTISSNFSFALLLAVSVFVIACPHALGLAVPLVVSRLTS ISAKNGLLIQNRTSLEKINTIKYALMDKTGTLTDGKFIVRDVIDFTDETDILQIMAALEGSSTHPIAQSIVSAAKPLKNL KVEAVENIPGVGIKGQVNQNFYQIVNYKYLRENQLSYDEQKIAQYLDLGLTLSFLINEQQDVLGFIALGDSPKADAKAFI NGLLAQGITPVMLTGDNKETAQKIASALNIPEFRAELKPEDKAEIVKEYQKKAGVLFIGDGVNDAPALATATIGFAIGAG TSVAISTADVVLVNSNPSDVLDMINISKRMLRKMKQNLWFGAGYNIIAIPVAAGILYPFTGFYIDPLIAAVLMSISTVIV SINAMGLRYDKK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
SH0105 | YP_252020.1 | hypothetical protein | Not tested | SCCmec | Protein | 5e-101 | 48 |
Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
STER_0882 | YP_820314.1 | cation transport ATPase | BAC0079 | Protein | 3e-119 | 48 |
STER_0882 | YP_820314.1 | cation transport ATPase | BAC0629 | Protein | 3e-107 | 46 |
STER_0882 | YP_820314.1 | cation transport ATPase | BAC0383 | Protein | 2e-111 | 46 |