Gene Information

Name : STER_0882 (STER_0882)
Accession : YP_820314.1
Strain : Streptococcus thermophilus LMD-9
Genome accession: NC_008532
Putative virulence/resistance : Resistance
Product : cation transport ATPase
Function : -
COG functional category : P : Inorganic ion transport and metabolism
COG ID : COG2217
EC number : -
Position : 812146 - 814344 bp
Length : 2199 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGTCAAATAAAACTCATTTGTCTAATTACGAAGAAATGATGTCTGAGCATCATCACAATCATGAAATGGTGGATATGAA
GCACGAAAATCATGAGATGCACAACATGCACAATATGGATAATATGCATGATATGGACAATATGCACAACATGCACAATA
TGGATAATATGCATGATATGCATGATATGGATAATATGCATGATATGGATAATATGCATGATATGGACAATATGCATGAT
ATGGACAATATGCATGATATGATGAATCATGGAGGACACATGATGCATATGGGTGATATGAGTAAAAAGCTCAAAGTGGC
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GCGTTCTTTTCATTGGTGATGGTGTCAATGATGCCCCAGCCCTTGCAACTGCTACAATTGGTTTTGCGATTGGAGCAGGA
ACTTCGGTTGCTATCAGTACCGCTGATGTCGTCCTAGTTAACTCCAATCCAAGTGACGTCTTGGATATGATTAACATCTC
CAAACGCATGCTTAGAAAAATGAAACAAAACCTCTGGTTTGGAGCAGGCTATAACATTATTGCTATTCCTGTTGCAGCGG
GTATTCTTTATCCATTTACAGGATTTTATATTGACCCTCTCATTGCAGCAGTCCTGATGTCAATCTCAACCGTGATCGTC
TCAATCAACGCGATGGGATTGAGGTATGATAAAAAATAG

Protein sequence :
MSNKTHLSNYEEMMSEHHHNHEMVDMKHENHEMHNMHNMDNMHDMDNMHNMHNMDNMHDMHDMDNMHDMDNMHDMDNMHD
MDNMHDMMNHGGHMMHMGDMSKKLKVAIILMIPLLLISPIAGFTILKFPGSEILQLILGTIIFFYSGTPFFRGAKGELKS
RKPAMMMLITMGISVAYAYSVYATIMSLYGHMGMNFWFELATLIVIMLIGHLIEMKAIMGAGDALKDLASLVPKKAHLKS
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SINAMGLRYDKK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SH0105 YP_252020.1 hypothetical protein Not tested SCCmec Protein 5e-101 48

• Homologs from CARD and BacMet (resistance genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
STER_0882 YP_820314.1 cation transport ATPase BAC0079 Protein 3e-119 48
STER_0882 YP_820314.1 cation transport ATPase BAC0629 Protein 3e-107 46
STER_0882 YP_820314.1 cation transport ATPase BAC0383 Protein 2e-111 46