Name : LEUM_0358 (LEUM_0358) Accession : YP_817854.1 Strain : Leuconostoc mesenteroides ATCC 8293 Genome accession: NC_008531 Putative virulence/resistance : Unknown Product : proline/glycine betaine ABC transporter permease Function : - COG functional category : E : Amino acid transport and metabolism COG ID : COG4176 EC number : - Position : 312930 - 314645 bp Length : 1716 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAATAATTTAGTAAGTATTCCAAAAATTCCACTTGAAGATTGGGTCAGTTCAGCGGTTTCATGGTTAACTACTAATTT ATCCGGATTTTTTGATGCCATTCAATCTGGCGGTCAATACATAATGGATGCTTTAACAAATGGTTTAACTGCTGTACCCA TGGCACTAATGATTATTGGTATCACAGTAATTGCCATTGTTACGACACCGAAAAAGATTGGCTTTCCGTTATTCACACTT TTGGGACTTTTGTTAATTGCCAATCAAGGACTTTGGTCTGACTTAATGAATACCGTTACATTGGTAATCATGGCGTCTAT TGTTTCGTTGATTATTGGTATACCCCTTGGAATTTTAACAGCAAAGTCACAAAAGACTGCGGTAGTTGTTCAACCAATCT TAGACTTTATGCAGACTATGCCAGGATTTGTTTATTTAATTCCTGCTGTTGCCTTCTTTGGAATCGGTGTGGTTCCTGGT GTGTTTGCTTCGATAATCTTTGCCCTACCACCGATGGTTCGTATGACTAGTTTAGGTATTCGTCAAGTTCCAGTTGATTT GGTTGAAGCAGCTGATTCATTTGGATCAACTACTTGGCAAAAGTTGTTTAAATTAGAACTTCCTAGTGCAAAAAATACTA TTTTAGCAGGCGCTAACCAAACAATCATGTTGGCATTGTCGATGGTTGTCACAGCTTCTATGATTGGTGCACCAGGTCTT GGGCGTGGCGTCTTGTCTGCGGTTCAACACGCTGATGTTGGTTCTGGATTTGTTAACGGGCTTGGATTGGTGATCTTAGC TATTGTTATTGATCGTTTTACACAAAAGTTTAACACCCAACCCGGACAAAAAGCGGTGACAAAGCCATGGCGTCGTTGGA CAGTACTTGCGGCTTTGTTGGTTATGATTGGTGGAGGTGTTGTCAACACTTTGACTTCCGATAAAACAACAGGTCAAAAA GTTACTATTGGCTATGTTGAGTGGGATTCAGAAGTTGCCTCTTCGAATGTGCTGGCTGAATCATTACGTCAACATGGATA CGATGTCACGTTAACGCCATTAGATAATGCTGTTTTGTGGCAGTCGCTATCTAATAATCAAATTGATATTTCAGTTTCAG CATGGTTGCCAGATACACACAAAGCTTTGTATGATAAGTACAAAAATGATGTAACATTGCTTGGCCCTAACTTGAAAGGT GTTAAAACTGGATTAGTTGTTCCTGATTATATGGATGTAAATTCCATTAGTGATTTAACAACTCAAGCAAATAAGACAAT CACAGGTATTGAGCCGGGGGCCGGTGAAATGGCCACAGCTGCTAATGCTTTGAAGTCGTATTCAAACTTATCGGGTTGGA ACTTATCATCCTCATCTTCTGGTGCTATGGTATCAGCATTGGATAAAGCTTACAAAAATAAGCAAGATGTTGTGGTGACC GGTTGGTCACCACACTGGATGTTTAGTAAGTACCACTTGAAGTTCTTGTCTGATCCAAAAAACGTGTTTGGATCTGGAGA AACCATTAATACGATTGTGAATAAGAAGTTTAAAACTTCTAACCCCAAGGCCTATAAGGTTGCTGATAATTTTAATTGGA CGAAAGATGACATGGAATCAGTCATGCTCGATATTCAAAATGGTCAAACACCAAAGCAGGCTGCTGCTAAATGGATTAAG TCACATCAAAAGTTAGTTGATAGTTGGTATAAATAA Protein sequence : MNNLVSIPKIPLEDWVSSAVSWLTTNLSGFFDAIQSGGQYIMDALTNGLTAVPMALMIIGITVIAIVTTPKKIGFPLFTL LGLLLIANQGLWSDLMNTVTLVIMASIVSLIIGIPLGILTAKSQKTAVVVQPILDFMQTMPGFVYLIPAVAFFGIGVVPG VFASIIFALPPMVRMTSLGIRQVPVDLVEAADSFGSTTWQKLFKLELPSAKNTILAGANQTIMLALSMVVTASMIGAPGL GRGVLSAVQHADVGSGFVNGLGLVILAIVIDRFTQKFNTQPGQKAVTKPWRRWTVLAALLVMIGGGVVNTLTSDKTTGQK VTIGYVEWDSEVASSNVLAESLRQHGYDVTLTPLDNAVLWQSLSNNQIDISVSAWLPDTHKALYDKYKNDVTLLGPNLKG VKTGLVVPDYMDVNSISDLTTQANKTITGIEPGAGEMATAANALKSYSNLSGWNLSSSSSGAMVSALDKAYKNKQDVVVT GWSPHWMFSKYHLKFLSDPKNVFGSGETINTIVNKKFKTSNPKAYKVADNFNWTKDDMESVMLDIQNGQTPKQAAAKWIK SHQKLVDSWYK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
opuABC | YP_281522.1 | glycine betaine-binding protein/glycine betaine transporter permease | Not tested | Not named | Protein | 2e-142 | 59 |