|
Name : LEUM_0183 (LEUM_0183) Accession : YP_817687.1 Strain : Leuconostoc mesenteroides ATCC 8293 Genome accession: NC_008531 Putative virulence/resistance : Unknown Product : protein translocase subunit secA Function : - COG functional category : U : Intracellular trafficking, secretion and vesicular transport COG ID : COG0653 EC number : - Position : 156709 - 159120 bp Length : 2412 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGCCAATCCAATACGTAAATTAGTTGATAATTCAAAGCAACAACTAAAGAAATTAAATAAAATTGCCGATCAAGTCGA AAGTTATGCAGACACCATGGCTAGCATGTCAGATAGTGAGTTACAGGCTAAAACTGGAGAATTCAAGTCAAAAATTGCTG ATGCAATTGATGGTATTGAGGACAAGGATAAGCAAAATAAGGCTTTGGCAAAAGTTTTAGACGAGCTGTTACCAGAAGCT TTTGCTGTGGCGCGGGAGGGAGCTAAACGAGTTCTTGGTTTGTATCCTTTCCATGTTCAAATCATGGGATCCATCGTATT ACACGGTGGAAATTTAGCTGAAATGCGCACAGGTGAAGGTAAAACCTTGACAGCAACAATGGCTGTTTATTTAAATGCGT TATCAGGTCGCGGTGTGCATGTTGTTACAGTGAACGATTATTTATCCGCTCGAGATGCGGAACAAATGGGTCAATTATAC AATTGGCTTGGATTGACAGTCGGTGTCAATGTTGGTGATGCGCCAGCAGAAGAAAAGCGTGCTGCTTACAACGCTGATAT CACTTATTCTACCAACTTTAACATCGGGTTTGATTACCTACGTGATAACATGGTACGACGCGCAGACGAGCGTGTTATGC AACGAGGATTGAACTTTGCACTTATCGATGAAGCAGATTCAATTTTGATTGATACGGCACGTACACCTTTGATTATTTCT GGACCAGGTTCAGGAGTCTCCCAACTTTATGCTCGCGCTGACCGTTTCGTGAAAACTTTGCAACGTGATGAGGACTTTAA GGTTGATGAAGAAGCCAAGGCGACTTTGTTAACACCTGAAGGAATTCACAAAGGCGAGATATTCTTTAACTTGAATAACT TATATGATGCTGACGATACAGCCTTAACGCATCATATTGACCAAGCCTTGCGGGCTAATTTTAATTACATTAAAGATAAG GATTATGTCGTTCAAGATGGCGAGGTTAAGTTGATTGATCAGTCAACGGGCCGTATTTCTGAAGGAACACGTTTATCAGA CGGTTTGCACCAAGCTATTGAAGCTAAAGAAAACGTCGAGATTCAAGAAGAAAATAAATCAATGGCGCAAATTACTTATC AAAATTTGTTCCGTATGTATAAGAAACTTTCAGGTATGACTGGAACCGCTAAAACTGAGGAAGAAGAATTACGTGAAATT TACAATATGGAAGTAATCAGTATTCCTACGAACCGTCCTGTTAGACGTGTGGATAAACCTGATTTGCTTTATACGTCTAT TCGTGCCAAGTATAATGCGGTTGTTAAATTGATTGTTGAATTGCATGAAAAGGGACAACCTATCTTAATTGGTACGGGAT CTGTCGAAGATTCAGAATTATTATCAAAAATATTGATGACGAAAAATTTGCCTCACAATGTTTTAAATGCCAAAAACAAT GCCAAAGAAGCTGAGATTATTGCTAATGCCGGACAGCGTGGTGCAATAACTGTTGCAACCAACATGGCTGGTAGAGGGAC TGATATTAAACTTGGTCCTGGTGTTGCGGAACTCGGTGGGTTAGTTGTTATTGCCACAGAACGTCATGAATCACGACGTA TTGATAATCAGTTACGTGGTCGTGCAGGACGTCAGGGAGATGAAGGCTTTTCACAATTCTTTCTTTCATTGGAAGATGAT TTGATGATTCGTTTTGGTGCTGAACGTGTCCGCTTGATGATGCAGAGAATGAATTTGGATGAAGATACAGTGATTACCAA TCGGTTTATTACTCGTTCTGTCGAATCAGCCCAAAAACGTGTTGAAGGAAACAACTATGATACACGTAAAAATGTTTTGC AGTACGATGATGTTGTACGTGAACAACGTGAATTGATTTATCATGAACGTGATGTTGTCATTGATGAATCAGAGTCATTG GAATGGGTTTTGATGCCAATGGTTGAACGTACTATTAACCGTGTCGTGGATGCTCAAACGAAAGAGAAGAAGTCATCCGA TTGGAATCTGCCGCAAATTGTTGCTTTTGTTGGCAATGCCCTAGCACATGATGATGCCGTTACAGTGCAACAACTGCAGG GATTGACTCGTGATGAAATCAAAGCAAAATTATTAGAGCTAGCGAAGTTGAATTATAAAGAAAAGCAAAGCCAGCTTTAT GATCCAGAACAAATGTTGGAGTTCGAGAAAGTTGTTATTTTGAGAGCAGTTGATCAACACTGGACAGATCATATAGATTC TCTTGATCGGTTGCGTCAAGGTGTTGGTTTACGTGGATATGGACAATTAAATCCACTCATCGAATATCAAAGCGAAGCAT TTGCGAACTTTCAAAAAATGATTGCAGATGTTGAATATGACACAACACGCACATTTATGAAAGCTGAAATTCGTCAGAAT TTACGTTCTTAA Protein sequence : MANPIRKLVDNSKQQLKKLNKIADQVESYADTMASMSDSELQAKTGEFKSKIADAIDGIEDKDKQNKALAKVLDELLPEA FAVAREGAKRVLGLYPFHVQIMGSIVLHGGNLAEMRTGEGKTLTATMAVYLNALSGRGVHVVTVNDYLSARDAEQMGQLY NWLGLTVGVNVGDAPAEEKRAAYNADITYSTNFNIGFDYLRDNMVRRADERVMQRGLNFALIDEADSILIDTARTPLIIS GPGSGVSQLYARADRFVKTLQRDEDFKVDEEAKATLLTPEGIHKGEIFFNLNNLYDADDTALTHHIDQALRANFNYIKDK DYVVQDGEVKLIDQSTGRISEGTRLSDGLHQAIEAKENVEIQEENKSMAQITYQNLFRMYKKLSGMTGTAKTEEEELREI YNMEVISIPTNRPVRRVDKPDLLYTSIRAKYNAVVKLIVELHEKGQPILIGTGSVEDSELLSKILMTKNLPHNVLNAKNN AKEAEIIANAGQRGAITVATNMAGRGTDIKLGPGVAELGGLVVIATERHESRRIDNQLRGRAGRQGDEGFSQFFLSLEDD LMIRFGAERVRLMMQRMNLDEDTVITNRFITRSVESAQKRVEGNNYDTRKNVLQYDDVVREQRELIYHERDVVIDESESL EWVLMPMVERTINRVVDAQTKEKKSSDWNLPQIVAFVGNALAHDDAVTVQQLQGLTRDEIKAKLLELAKLNYKEKQSQLY DPEQMLEFEKVVILRAVDQHWTDHIDSLDRLRQGVGLRGYGQLNPLIEYQSEAFANFQKMIADVEYDTTRTFMKAEIRQN LRS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| secA2 | YP_006310687.1 | preprotein translocase subunit SecA2 | Not tested | FWisland_3 | Protein | 2e-142 | 42 |
