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Name : LGAS_0533 (LGAS_0533) Accession : YP_814368.1 Strain : Lactobacillus gasseri ATCC 33323 Genome accession: NC_008530 Putative virulence/resistance : Unknown Product : alpha, alpha-phosphotrehalase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0366 EC number : - Position : 561634 - 563292 bp Length : 1659 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAATAATTTAGGCAATAAAGTAATTTATCAAATTTACCCAAAATCTTTTTATGACTCAAATAATGATGGTATTGGCGA CTTACGTGGCATCATTGAAAAAATTGACTATATTAAGAAGCTAAATGTAGATTTCATTTGGTTTAACCCATTTTTTGTTT CTCCACAAAATGACAACGGCTATGACATTGCTGATTATAAAAAAATTGATCCTCGTTTTGGAACAATGGATGATTTCGAA GAATTGGTAACTAAATTAAAAAGTATTAACGTTAATGTGATGCTCGACATGGTTTTAAATCACTGCTCAACAGAACATGA ATGGTTTAAAAAAGCTCTAGCCGGAGATAAGAAGTATCAAAAATTCTTTTATCTTAGAAAAGGTAAGGACGGACAACTAC CTAATAACTGGCAATCAAAATTTGGTGGTCCAGCTTGGTCAAAATTTGGCGACACTGATTACTACTATCTCCACCTCTAC GACCCAACTCAAGCAGATCTTGACTGGCACAATCCTGAAGTTCGCGCTGCCTTAATAGATGTTGTAAACTTTTGGCGTAA TAAAGGAGTTCACGGCTTCCGCTTTGACGTAATCAACGTTACAGGGAAAGATACTACCTTAGTTAACTCAACAGATCCGG TGCAAGAAAAATCCCTTTATACTGATACACCAGTGGTGCAGCAATATCTAAAAGAATTAAATGCAAAATCCTTCGGTCAA GACCCGGAATCAGTTACTGTTGGAGAAATGTCATCAACTACGATTGAAAATTCAATTGCTTATACCCGTCCAGAAGATCA TGAGCTTTCAATGGTCTTTACCTTTCATCACCTCAAAGTTGACTATAAAAACGGTGAAAAATGGTCTAAGATGCCTTTTG ACTTTAAGAAATTAAAAGATATTATGCTTACCTGGAATAGTAAGATTGATCAAGGTGGCGGCTGGCAAGCTCTATTCTGG AATAATCACGACCAGCCTTGGGCATTAAATCGATTCGGTGATACTGGAAAATATCACAATAAATCTGCTGAGATGTTAGC TCTTGCTCTTCATCTACTACGCGGAACGCCTTACATTTATATGGGCGAAGAAATTGGTATGATGGATCCTCACTATACTT CCATGAAGGATTATGTTGATATCGAAGCTTTGAATGCCTATGACGCATTAATCAAAAAAGGTATTGATGAAAAAGAAGCT TTTGAAATTGTTCAGTCTAAAGCTCGCGATAATTCAAGGGTTCCAATGCACTGGGATAATTCTCAATATGCTGGTTTTAG TGACCACAAACCTTGGCTTATGCCAACAGACCAAGATAGAATTAACGTTGAAAAAGAACTACTGGATGGTGAAATTTTTA ATTTCTATCAAAAATTAATTAAACTCAGAAAATCAGAAAAATTGATCTCTGAAGGTCACATCAAACCATTTTTAATGGAA CACCCACAAGTTATGGCCTATGAACGTTATTTAGATGACTCTAATGAAAAACTTTTAGTATTTGCAAACTTCTATGGCAA AGAAACTGAAGTTAAAATACCTGCTGAATATTTAAATAAGGCGGGGCATATTTTAATTCAAAATTACGATAAAAATCTTG CTTCTCTTCCTTTAGCCTTGCAATTAAAGCCTTATGAAGCTTTAGCAATCAAACTTTAA Protein sequence : MNNLGNKVIYQIYPKSFYDSNNDGIGDLRGIIEKIDYIKKLNVDFIWFNPFFVSPQNDNGYDIADYKKIDPRFGTMDDFE ELVTKLKSINVNVMLDMVLNHCSTEHEWFKKALAGDKKYQKFFYLRKGKDGQLPNNWQSKFGGPAWSKFGDTDYYYLHLY DPTQADLDWHNPEVRAALIDVVNFWRNKGVHGFRFDVINVTGKDTTLVNSTDPVQEKSLYTDTPVVQQYLKELNAKSFGQ DPESVTVGEMSSTTIENSIAYTRPEDHELSMVFTFHHLKVDYKNGEKWSKMPFDFKKLKDIMLTWNSKIDQGGGWQALFW NNHDQPWALNRFGDTGKYHNKSAEMLALALHLLRGTPYIYMGEEIGMMDPHYTSMKDYVDIEALNAYDALIKKGIDEKEA FEIVQSKARDNSRVPMHWDNSQYAGFSDHKPWLMPTDQDRINVEKELLDGEIFNFYQKLIKLRKSEKLISEGHIKPFLME HPQVMAYERYLDDSNEKLLVFANFYGKETEVKIPAEYLNKAGHILIQNYDKNLASLPLALQLKPYEALAIKL |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 4e-105 | 43 |
