|
Name : LGAS_0215 (LGAS_0215) Accession : YP_814062.1 Strain : Lactobacillus gasseri ATCC 33323 Genome accession: NC_008530 Putative virulence/resistance : Unknown Product : neopullulanase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0366 EC number : - Position : 247138 - 248862 bp Length : 1725 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGCAACTAGCAGCTTTAAAACATAGAACTGAAAGTGAAGACTGTACAGTAATTGATCACTCACACGTAAAAATTAGACT TCATACTGCTAAAGACGATGTAAAAAAAGTCTTTGTTCACTATATTGATAACTATTTGCCACCCGTAGATGCGGCAACGC TCGAAATGAAAAAGGCAGGTAGCGGTCAAGTAAACGATTATTGGACAGCCACTTTAACAGCACCGTATCACCGAATCAAG TATACTTTTGAAGTTATTGGTAATGATGGTAGCCATATTATTTTTGGTGATCGTAGTATTGAAAAATTTAGTGATGAGAA ATTAAGAGAAGATGGCTTATATTTTAAAGTGCCATATTTTCATGATATTGATCGTATTAAAACTCCTGCTTGGCTCAAAG ATGTTGTCTGGTATCAAATCTTTCCAGAGCGCTTTGCTAATGGAGATAAAAGTAATGATCCAGTTAACGTTAAGCCCTGG AATCCAGAAGATCATCCCGGCAGAGAAGATTTTTACGGCGGAGACTTGCAAGGAGTATTGGATCATTTAGATGATTTACA AAGGTTAGGGATTACCGGCTTGTATTTCTGCCCTATTTTTAAAGCAAGCTCTAATCACAAATATGACACCATTGATTATT TACAAGTTGATCCAGCTTTTGGCGATAAAGATTTATTTGCAAAAGTAGTGAATGAAGCTCACAAGCGCGGGATGAAAGTA ATGTTAGATGCAGTTTTCAACCATCTTGGTGACCAATCAATGCAGTGGCAAGACGTGGTTAAAAATGGAGCCAAATCCCG CTTTAAAGATTGGTTTCATATTAATTCTTATCCTGTTGAACCTTATCGTGATCCAAGTAAGGGAGAAAAGAATCCGCCTT ATGAAACCTTTGCTTTTGAAAAGCATATGCCCAAATTAAATACTGCTAATCCAGAAGTACAGGATTTCTTATTGGAAATT GCAACTTATTGGGTAAAATATTTTGATATTGATGCTTGGCGCTTAGATGTAGCAAATGAAGTTGACCACCACTTTTGGAA GAGATTCCACGACGAATTAATTAAAATTAAGCCAGATTTCTATATTGTTGGAGAAATATGGCATTCAGCTCGTCCGTGGC TTCAAGGAGATCAATTTACAGGTGTAATGAACTATCCGTATACTTTGCAAATTGAGGATCATTTTTTTAAGCATAAGTTA GATGGCAAGGAACTTAGCGAACACTTAACTGATCAATTAATGATGTATCCAGATATTGTTAACCAAGCGATGATGAATAT GCTTGATTCGCATGATACAGCTCGAATTTTGACTTTAGCAAACGGTAATCAAGATTTAGCTTTACAAGCTATAGCTTATG AGTTCGTTCAACCTGGGATACCATGTATTTATTATGGAACAGAAATGGGGATGAGCGGCGATAACGATCCTGATTGTCGT AAGCCAATGGATTGGGGTAAGTTAAATGGCCCAGTCTGGAAGAGGGTTTATGAATTGGTTAAATTCCGTTTAGACCATCA GGATACTTTAAATCAAGGCGATGTGAAGTTAACGGTAACAGAAAATGATCTACTAAAAGTTGAACGAACAGGAAAAGAAA CAATAAATGCCTACTATAATACCAGTGATCATGATATCAAAATTGATAAAAAACCATCGCTTAGTCAAAATTATGAAGAT GGTATTTTGGCGCCAGATGGCTTTTTGGTAGAAGTAAAAGCTTAA Protein sequence : MQLAALKHRTESEDCTVIDHSHVKIRLHTAKDDVKKVFVHYIDNYLPPVDAATLEMKKAGSGQVNDYWTATLTAPYHRIK YTFEVIGNDGSHIIFGDRSIEKFSDEKLREDGLYFKVPYFHDIDRIKTPAWLKDVVWYQIFPERFANGDKSNDPVNVKPW NPEDHPGREDFYGGDLQGVLDHLDDLQRLGITGLYFCPIFKASSNHKYDTIDYLQVDPAFGDKDLFAKVVNEAHKRGMKV MLDAVFNHLGDQSMQWQDVVKNGAKSRFKDWFHINSYPVEPYRDPSKGEKNPPYETFAFEKHMPKLNTANPEVQDFLLEI ATYWVKYFDIDAWRLDVANEVDHHFWKRFHDELIKIKPDFYIVGEIWHSARPWLQGDQFTGVMNYPYTLQIEDHFFKHKL DGKELSEHLTDQLMMYPDIVNQAMMNMLDSHDTARILTLANGNQDLALQAIAYEFVQPGIPCIYYGTEMGMSGDNDPDCR KPMDWGKLNGPVWKRVYELVKFRLDHQDTLNQGDVKLTVTENDLLKVERTGKETINAYYNTSDHDIKIDKKPSLSQNYED GILAPDGFLVEVKA |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SPN23F_09660 | YP_002510949.1 | alpha-amylase | Not tested | PPI-1 | Protein | 8e-125 | 44 |
