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Name : LGAS_1421 (LGAS_1421) Accession : YP_815220.1 Strain : Lactobacillus gasseri ATCC 33323 Genome accession: NC_008530 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG0749 EC number : - Position : 1412802 - 1415492 bp Length : 2691 bp Strand : - Note : - DNA sequence : TTGACAGTTTTTTTATTTAAGGAGAAAAAGATGGCACAAAAGAAATTACTTTTAATTGACGGTAACTCTGTGGCCTTTCG TGCCTTTTATGCTTTATACCGTCAGCTTGATCGCTTTACTAGTCCAGATGGGTTACATACAAATGCAATTTTTACTTTTA AGAATATGCTTGATGCGATTATGAAGCAGACTGATCCAAGCAATGTATTAGTTGCGTTTGATGCAGGAAAAGTAACTTTT AGAACTAAGATGTATCAGGATTATAAAGGCGGTCGACAAAAAACTCCAAGTGAATTATCAGAACAATTGCCTGTAATTCG TGAAATGCTTAAAGATTTAGGAATAAAGAGCTATGAGCTAAAAAATTATGAAGCAGACGATATTATTGGCACACTTTCTA AAATGGGGGAAGAAGCAGGCTACACTGTTGATATTGTAACTGGGGATCGTGATTTAACTCAGCTTGCTTCTGATAAAACC ACGGTTTTAATAACTAAAAATGGAGTTGGTGATACTGAAGCATATACGCCAGAACATATGAAAGAAGTTAATGGCGTAAC GCCAACTGAATTTATTGATATGAAAGCGCTGATGGGAGACAATTCAGATAACTATCCAGGTGTAACTAAAGTTGGTCCGA AAACAGCTTCACGTTTAATTCAAAAATATGGCTCTGTTGAAAAACTTTATGAACATGTGGATGAAATGAAAAAATCCAAG TTAAAAGAGAACCTAATTAATGATAAAGATAAGGCAATTTTAGCTAAAAAGTTAGCAACAATTGATCGTGATTCTCCAGT AGAAGTGACACTTGCTGATACTAAGCTAGAAGAGCCTAATATTGAGGACTTACGTAATTTATATGAAAGATTAGGATTTA AAAAATTCTTAGCTGAGTTAGGTGCAAGTGGAGTGAGTGCCGGTAAGCAAGAAAGTGAGAAGTACGAGTATCTAGAATTA ACAAGAGAAAATATCGCTGACTTAGATAAAATTAATGAAAAAGAAGTGACATTTTATCTGGCAATGTTGGGTGATAACTA CCATCTAGCTCCGCTTGAAGGATTTTCACTAAAGGTTAGTGATAAAATCTATGTTTCTAAAGATGTAGTCTTACTGCAAG AAGCTCCACTTCGTCAAATGCTAGAAGATAAGAAGATTAAGAAAAATGTTTTCGACATTAAAAGAACCTATGTAGGTTTA CATCGACTAGATATTGATGCAGAAGGTCTAGATTATGACATGCTCCTGGCTTCTTATTTAGTTAATAATGAAAATAATTC GAATGATCTTGGCGAAGTAGCGCATTTGTATGATGATTATTCAGTAAAAACTGACTTGGAAGTTTATGGTAAAGGTAAAA AGCAAGCTGTACCTGAAGATGATGAGTTCTTTGAACATTTAGCAGCTAAAGTTGCTGTAATTGAGAAGTTAAAGCAGCCA CTTTTAGAGAAATTAAAAGATCACGAGCAAGATGACTTGTATGAAACAATTGAAATTCCAGTTGCTTTTGTCTTAGCTAA AATGGAAATTACTGGGATTAAGGTTGAAGCATCGGTTTTAAATCAATTAGGCAATGATTTTGCAGTTAAATTACAAGAAT TAGAACATAAGATTTATCAACAAGCCGGCGAAGAATTTAATTTAAATTCACCAAAACAGTTAGGACATATTCTTTTCGAA AAATTAAACTTACCGCCAATTAAAAAGACCAAAACTGGCTATTCAACTTCTGTTGAAGTATTAGAGCAATTGAAGATGAA GAGCCCGATTGTTTCAGAAATTTTGGATTATCGTCAAATTGCTAAAATTCAAAATACTTATGTTAAAGGATTACTTGAGT GTATTCAGCCTGATAGCAGAATCCATACCCGTTATTTACAAACATTAACTGCAACGGGGCGTCTTTCATCGGTTGATCCT AATTTACAAAATATTCCAACTAGAACTGATGAGGGAAAACAGATTAGAAAAGCTTTCGTGCCTTCAACTAAAGACGGCTA TATCTTTTCTTGTGACTACTCACAAGTTGAATTAAGAGTTTTGGCACACGTTTCTGGGGATGAACATATGCAGGAAGCAT TTAAGTCTGGTTATGATATTCACGCTCACACTGCAATGAAGATTTTCCATTTGGATTCACCTGATGAAGTAACGCCATTA ATGCGTCGGCATGCTAAGGCAGTCAACTTCGGAATAGTTTACGGTATTTCTGATTATGGTTTGTCTAAGAACTTAGGCAT TAGTCGTAAGCAAGCAAAGACATTTATTGATAATTACTTTGAGCAATATCCGCAAATTAAAGATTATATGGATAAGGCAA TTAAGAAAGCTCGAGAAAACGGCTATGCAGAAACTATTATGCATAGAAGACGCTACTTGCCAGATATTCATTCAAAGAAC TTTAATGTTAGAAGCTTTGCGGAAAGAACTGCAATTAATTCTCCTATTCAAGGTTCAGCTGCTGATATTATTAAGATTGC TATGATTAATATGCAAAAGAAACTTGATGAATTACATTTAAAGACTAAAATGGTTCTACAAGTACACGATGAACTTATTT TTGATGTACCAAAGGATGAATTAGATACAATTAAAAAGATTGTGCCAGAAGTTATGCAGTCAGCTGTAAAACTAGATGTT CCACTAATTGCTGACTCTAACTGGGGCCATAATTGGTATGATGCTAAGTAA Protein sequence : MTVFLFKEKKMAQKKLLLIDGNSVAFRAFYALYRQLDRFTSPDGLHTNAIFTFKNMLDAIMKQTDPSNVLVAFDAGKVTF RTKMYQDYKGGRQKTPSELSEQLPVIREMLKDLGIKSYELKNYEADDIIGTLSKMGEEAGYTVDIVTGDRDLTQLASDKT TVLITKNGVGDTEAYTPEHMKEVNGVTPTEFIDMKALMGDNSDNYPGVTKVGPKTASRLIQKYGSVEKLYEHVDEMKKSK LKENLINDKDKAILAKKLATIDRDSPVEVTLADTKLEEPNIEDLRNLYERLGFKKFLAELGASGVSAGKQESEKYEYLEL TRENIADLDKINEKEVTFYLAMLGDNYHLAPLEGFSLKVSDKIYVSKDVVLLQEAPLRQMLEDKKIKKNVFDIKRTYVGL HRLDIDAEGLDYDMLLASYLVNNENNSNDLGEVAHLYDDYSVKTDLEVYGKGKKQAVPEDDEFFEHLAAKVAVIEKLKQP LLEKLKDHEQDDLYETIEIPVAFVLAKMEITGIKVEASVLNQLGNDFAVKLQELEHKIYQQAGEEFNLNSPKQLGHILFE KLNLPPIKKTKTGYSTSVEVLEQLKMKSPIVSEILDYRQIAKIQNTYVKGLLECIQPDSRIHTRYLQTLTATGRLSSVDP NLQNIPTRTDEGKQIRKAFVPSTKDGYIFSCDYSQVELRVLAHVSGDEHMQEAFKSGYDIHAHTAMKIFHLDSPDEVTPL MRRHAKAVNFGIVYGISDYGLSKNLGISRKQAKTFIDNYFEQYPQIKDYMDKAIKKARENGYAETIMHRRRYLPDIHSKN FNVRSFAERTAINSPIQGSAADIIKIAMINMQKKLDELHLKTKMVLQVHDELIFDVPKDELDTIKKIVPEVMQSAVKLDV PLIADSNWGHNWYDAK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 55 |
