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Name : LACR_0319 (LACR_0319) Accession : YP_808349.1 Strain : Lactococcus lactis SK11 Genome accession: NC_008527 Putative virulence/resistance : Unknown Product : transcriptional accessory protein Function : - COG functional category : K : Transcription COG ID : COG2183 EC number : - Position : 289695 - 291836 bp Length : 2142 bp Strand : + Note : - DNA sequence : GTGGAAAATGTTAAAAAAATTGCTGAATTATTGAATATCAAAAATTCACAAGTTGAAAAAGTATTAGAATTGACGGCTGA GGGGAACACGGTTCCTTTTATTGCTCGTTATCGTAAGGAAGCAACAGGTTCACTTGACGAAGTTGAAATCAAAAAAATTA TTGATGAAGATAATTTACTGACCAAACTTTCAGAACGTAAAACAGCTGTTTTGTCAAAAATTGAGGAGCTTGGCAAGTTA ACTGATTCGCTTAAAACACAAATTTTGGCTGCTGAAAAACTGACAGAAGTTGAAGATTTATATTTGCCTTACAAAGAAAA ACGGCGCACAAAAGCAACGATTGCAAAGGAAAATGGTTTATTTCCTTTGGCACAATTAATTGTAAAAAACGCTGCTAATC TTGAAGAGGAAGCAGAAAAATTTGTAAATGAGAATTTTACGACTGCTCAAAAAGCATTAGAGGGGGCGGTTGATATCCTA TCAGAAGCCATTTCTGAAGATGCGCGGTTGCGTTCATGGCTGACTGGTGAAATCAAAAACAATAGTTTACTGACAAGTAG TTTGAAAAAAGATGCCGTTGATGAAAAGCAAGTTTTTCAAATGTATTATAAATTCTCAGAAAAAGTTTCAGAATTACCAA ATTATCGTGTATTGGCTTTAAACCGTGGTGAAAAATTGGGGATTCTGTCAGTAAAATTTGAAAATAACGAAGACAAAATT TTACGTTATTTTGCCGCCCGTTTTGCTGCTCAAAATAATCCAATGATGCAAGTGGCCATTAAAGATGCCGTCAAGAAAAA ATTGATTCCGGCTATGGAACGTAGTATTCGGACCGAACTGACAGAAAAAGCTGAAGCTTCTGCCATTGAAGTTTTTGGCA AAAATTTGAAAAATCTTTTATTGGTTGCACCGCTTAAAGGCCGTGTAGTCATGGGATTTGACCCTGCTTACCGTACTGGA GCAAAGCTTGCTATTGTTGATGAAACAGGTAAATTATTGATGACAACTGTCATTTATCCTGTCAAACCAGCAAATGCAGG ACAAATTGCTCAGGCGAAAAAAGATTTAGCAAAATTTATTCGTGAATATGGCGTAAATATGATTGCCATTGGGAATGGGA CTGCCAGTCGCGAATCTGAAAGTTTTGTTTCTGAAGTCCTCAAAGAAAATAATTTTTCTGATGTTTATTATGTGATTGTC AGTGAATCTGGGGCCTCTATTTATTCAGCAAGTGAATTGGCTCGTGAAGAATTTCCAGAATTGACTGTTGAAAAACGGTC AGCAATTTCAATTGCACGTCGTTTGCAAGATCCCTTAGCTGAACTTGTAAAAATTGAACCAAAAGCCATCGGTGTGGGTC AATATCAACATGATGTTTCTGAGAAAAAATTGACAGAAAACCTAGATTTTGTTGTTGAAACAGTCGTTAATCAGGTCGGT GTAAATGTCAATACAGCTAGTCCTAGCCTGCTTTCACACGTTGCGGGCCTTAATAAAAGTTTGGCCCAAAATGTGGTCAA ATATCGTGAAGAAAATGGGGCGCTTAAGACAAGAAACGAACTTAAAAAAGTCCCGCGTTGGGGAGCTAAGGCATTTGAAC AAGCGGCAGGTTTCCTAAGAATTCCAGAAGGAAAAAATTTCCTTGATAATACAGGGGTTCACCCAGAATCTTATAAAGTG ACTGAGCAACTTTTGACCGAAATTGCTGCTGGACCTGCTGTCAGTAATGAAGAATTACTGACCAAACTTTCGTCAGTAAA TATTCCTGAAATGGCTGAAAAACTTGGTCTTGGTCAGGAAACATTGACCGATATTATCAATGATTTGCAAAAACCTGGTC GTGATTTGCGTGAAAGCTTTGATGCACCAATTCTTCGTCAAGATGTCTTGTCGGCTGGAGATTTACAAATTGATCAGCAA CTTGAAGGCGTGGTCCGTAATGTTGTTGATTTTGGTGCCTTTATTGATATCGGAATTAAAAATGACGGCTTGGCACACGT TTCTGATTTGAGCAAATCATTTGTCAAAAATCCAAGTGATGTGGTCGCTGTTGGACAAATTGTAACGGTTTGGGTCAAAT CTCTTGATTTACAAAGAGGAAAAATTAATTTGACCCTAGTGAATCCTCGCGAAAAAGATTAA Protein sequence : MENVKKIAELLNIKNSQVEKVLELTAEGNTVPFIARYRKEATGSLDEVEIKKIIDEDNLLTKLSERKTAVLSKIEELGKL TDSLKTQILAAEKLTEVEDLYLPYKEKRRTKATIAKENGLFPLAQLIVKNAANLEEEAEKFVNENFTTAQKALEGAVDIL SEAISEDARLRSWLTGEIKNNSLLTSSLKKDAVDEKQVFQMYYKFSEKVSELPNYRVLALNRGEKLGILSVKFENNEDKI LRYFAARFAAQNNPMMQVAIKDAVKKKLIPAMERSIRTELTEKAEASAIEVFGKNLKNLLLVAPLKGRVVMGFDPAYRTG AKLAIVDETGKLLMTTVIYPVKPANAGQIAQAKKDLAKFIREYGVNMIAIGNGTASRESESFVSEVLKENNFSDVYYVIV SESGASIYSASELAREEFPELTVEKRSAISIARRLQDPLAELVKIEPKAIGVGQYQHDVSEKKLTENLDFVVETVVNQVG VNVNTASPSLLSHVAGLNKSLAQNVVKYREENGALKTRNELKKVPRWGAKAFEQAAGFLRIPEGKNFLDNTGVHPESYKV TEQLLTEIAAGPAVSNEELLTKLSSVNIPEMAEKLGLGQETLTDIINDLQKPGRDLRESFDAPILRQDVLSAGDLQIDQQ LEGVVRNVVDFGAFIDIGIKNDGLAHVSDLSKSFVKNPSDVVAVGQIVTVWVKSLDLQRGKINLTLVNPREKD |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| NMB0075 | NP_273139.1 | transcriptional accessory protein Tex | Not tested | IHT-A | Protein | 9e-135 | 46 |
