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Name : LACR_1541 (LACR_1541) Accession : YP_809470.1 Strain : Lactococcus lactis SK11 Genome accession: NC_008527 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ABC-type proline/glycine betaine transport system, permease component Function : - COG functional category : E : Amino acid transport and metabolism COG ID : COG4176 EC number : - Position : 1457897 - 1459618 bp Length : 1722 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGATTGATTTAGTGATTGGAAAAATACCATTAGCCAACTGGGTATCGTCAGCAACAGATTGGATTACAAGTACATTTAG TTCGGGTTTTGATGTGATTCAAAAATCAGGAACAGTGTTGATGAACGGAATAACAGGTGCTTTAACTGCAGTTCCATTCT GGCTGATGATTGCTGTTGTTACTATCCTAGCAATTTTGGTTTCAGGTAAAAAGTTTGCCTTCCCATTGTTTACTTTTATT GGTCTTTGTTTAATTGCCAATCAAGGCTTATGGTCAGATTTGATGAGTACGATTACCCTTGTCTTACTTTCAAGTTTGTT ATCAATTATCATAGGGGTCCCTCTAGGAATTTGGATGGCAAAATCTGAACTAGTAGCTAAGATTGTTCAACCTATATTGG ACTTCATGCAAACCATGCCTGGTTTTGTTTATTTGATTCCAGCAGTTGCCTTCTTTGGTATTGGGGTTGTTCCTGGGGTA TTTGCTTCAGTAATCTTTGCTTTGCCACCGACTGTCAGAATGACTAACTTAGGTATTCGCCAAGTTTCAACTGAATTAGT TGAAGCAGCAGATTCATTTGGTTCGACTGCCCGTCAGAAGTTATTTAAATTGGAATTTCCTTTAGCTAAAGGAACAATTA TGGCTGGTGTTAACCAAACAATTATGTTGGCTCTTTCTATGGTCGTTATTGCCTCTATGATTGGTGCACCTGGTTTAGGT CGTGGAGTACTAGCTGCTGTTCAATCAGCTGATATTGGTAAGGGATTTGTAAGTGGGATTTCATTAGTTATTTTGGCTAT TATTATTGACCGCTTTACGCAAAAACTTAATGTTTCTCCTTTAGAAAAACAAGGAAATCCTAAGCTCAAAAAATGGAAAC GTTGGATTGCTATCGTTTCATTGTTAGCCTTAATTGTTGGTGCTTTTTCGGGAATGTCTTTTGGGAAAAAATCTTCTGAT AAAAAAGTGGATTTAGTTTATATGAACTGGGACTCAGAAGTTGCGTCAATCAATGTTTTGACCCAAGCAATGGAAGAACA TAGTTTTGATGTTACAACGACTGCACTTGATAACGCAGTTGCTTGGCAAACTGTGGCTAATAGTCAAGCTGATGGAATGG TTTCTGCTTGGTTGCCAAACACTCATAAGACCCAATGGAAAAAATATGGTAAGTCTGTTGAGTTATTAGGTCCAAATCTT AAAGGCGCTAAAGTAGGATTTGTTGTGCCAAGTTATATGAATGTGAATTCAATTGAAGATTTGACTAATCAGGCCAATAA AACAATCACAGGAATTGAGCCTGGTGCAGGTGTCATGGCTGCCAGTGAAAATACACTTAAGAGCTATAGTAATCTTAAAG ATTGGAAGCTTGTTCCTTCATCATCTGGTGCAATGACTGTTGCTCTTGGTGAAGCCATTAAACAACATAAAGACATTGTA ATCACTGGTTGGTCTCCTCATTGGATGTTCAATAAATATGATTTGAAATACTTAGCTGATCCGAAAGGAACAATGGGGAC TTCAGAAAATATTAATACAATTGTGCGCAAAGGATTGAAAAAAGAAAATCCTGAAGCTTATAAGGTTTTGAATAATTTTA ATTGGACCACTAAAGATATGGAATCTGTTATGCTTGATATTCAAAATGGTAAGACACCAGAAGCAGCTGCAAAAGCTTGG ATTAAAGACCATCAAAAACAAGTTGATAAATGGTTTAAATAA Protein sequence : MIDLVIGKIPLANWVSSATDWITSTFSSGFDVIQKSGTVLMNGITGALTAVPFWLMIAVVTILAILVSGKKFAFPLFTFI GLCLIANQGLWSDLMSTITLVLLSSLLSIIIGVPLGIWMAKSELVAKIVQPILDFMQTMPGFVYLIPAVAFFGIGVVPGV FASVIFALPPTVRMTNLGIRQVSTELVEAADSFGSTARQKLFKLEFPLAKGTIMAGVNQTIMLALSMVVIASMIGAPGLG RGVLAAVQSADIGKGFVSGISLVILAIIIDRFTQKLNVSPLEKQGNPKLKKWKRWIAIVSLLALIVGAFSGMSFGKKSSD KKVDLVYMNWDSEVASINVLTQAMEEHSFDVTTTALDNAVAWQTVANSQADGMVSAWLPNTHKTQWKKYGKSVELLGPNL KGAKVGFVVPSYMNVNSIEDLTNQANKTITGIEPGAGVMAASENTLKSYSNLKDWKLVPSSSGAMTVALGEAIKQHKDIV ITGWSPHWMFNKYDLKYLADPKGTMGTSENINTIVRKGLKKENPEAYKVLNNFNWTTKDMESVMLDIQNGKTPEAAAKAW IKDHQKQVDKWFK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| opuABC | YP_281522.1 | glycine betaine-binding protein/glycine betaine transporter permease | Not tested | Not named | Protein | 1e-149 | 58 |
