Name : PEPE_0839 (PEPE_0839) Accession : YP_804341.1 Strain : Pediococcus pentosaceus ATCC 25745 Genome accession: NC_008525 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ATP-dependent DNA helicase RecG Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG1200 EC number : 3.6.1.- Position : 844280 - 846307 bp Length : 2028 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAAAAGCTTAACAGACTCAGTTCAAGTGCTTCCTGGAGTGGGACCTAAAAGAGTACAAGCGTTAGCCGAACTTGGTAT TTCGACCATAGAAGACTTGATTACTTATTATCCATTTCGATATGAAGATTTAGCCGCTAAGGAACCTCAAAATGTCGTTG ATCAACAAAAAGTGACATTTCAGGGAGTGGTTGCAACCCAGCCTACAGTAGCTCGTTTTGGGCGTCAAAAAGTCCGAGTT AACTTTCGTCTTCTAATCGGTAATGAGTCCGTTATGGTAACTTTTTTTAACCAGCCGTGGATTAAAAATCAAATTAATGC TGATGAAGAAATTGCGGTATATGGGAAATGGGATGCTAACCGACGGAGTTTAACAGGAATTAAAATTATTGATGAAGAAG CAAATCTTCAACCCGTTTATCCTGCTAACAAGCATATTCGACAAGCCACTATCCAACAATTAGCTACAGATGCAATTAAC CAATATCAGGAACAAATTCAGGATGTTATTCCAGAAGAACTGATTACTAAATATCGCTTACTACATCGATTGGCAATGGT CCAAGCGCTTCATTTCCCAGCAGATGATCAAAAAACACGGGACGCCCGTCGAACTGCGATGTTTGAAGAGTTTTTAACGT TTCAAATGGGATTACAGTTGGTTAAATCACGTGAACGAATTGAAAATGGAACGGCGATTAAATATCAAATTCAATTAGTG CGCGAATTTATTCAACAGTTACCTTTCGAATTAACCGATGCACAAAAAAGAGTAACAAATGAAATTTTGGCTAATCTTAA GTCGCCCACCCATATGAACCGCCTTTTACAAGGTGATGTGGGTAGTGGTAAAACCGTAGTGGCTGCCATTGCAATGTATG CAACCTTGACGGCTGGGATGCAAGCCACATTGATGGCTCCCACTGAAATTTTAGCTGAACAGCATGCTAATAATTTAAGT CGATTCTTTGAGAAATTAGATGTTAAGATTGCATTATTAGTCGGTGGTATTCGTAAAAAAATCAGAGATGAAATGCTAGC AGAAATCAAAAATGGTGAAATTGATATTGTAGTTGGTACCCATGCCATCATCCAAGAAGATGTCCAATTTAAAAATTTAG GGCTTGGTATTATAGATGAGCAACATCGTTTTGGGGTACACCAGAGACAGCTACTACGTGAGAAGGGGGCAGCTCCTGAT ATATTAGCCATGACAGCTACTCCAATCCCACGAACTTTAGCTATTACTACGTATGGAGATATGGACGTGTCAATTATTGA CCAAGCTCCCGCGGGTAGGAAGCCCATTATTACTAAATGGGTTAAGCGAGGGGAATGGGAAAAAGTTTTAGCCTTTATGA CTAAGGAATTTGCTAATGGTCGCCAAGCCTTTATTGTGACCCCACTAATTGAAGAATCTGAAGCCATGGATTTACAAAAT GCGATGGAACTTTATCAAGAATTATGTGAATTTTTTGGAGAAAAATATCCGATTGCAATTTTGCATGGTAAAATGGATGG TGCCCAAAAAGATCAGATTATGGCAGATTTCAAAGAAGGCAAATATATGGGATTAGTTTCTACCACCGTGATTGAAGTTG GGGTAGATGTTCCTAATGCTACTTTGATGGTAATTCAAGATGCAGATCGATTTGGATTAGCTCAATTACATCAGCTACGA GGGCGCGTTGGTCGTGGTCAATATCAGGCTTATTGTATTTTAGTTGCGGATCCCAAAAATGAAGTTGGAAAGCAACGTAT GCAAATTATGGTAGACACCAATGATGGTTTTGAAATTTCAGAAGCGGATTTGAAAATGCGTGGTCAAGGTGATTTGTTTG GAAAACAGCAATCGGGGGTCCCTGAATTTAAAGTGGGTGATCCGGTTGTTGATTTAGGCGCTTTGCAAACTGCCCAAATT GATGCGGCTAAAATTGTAAGCCAGCCAGCGTGGGACCAAGATCCCCGTTACCAAAATTTACGACTTTACTTAGAAAATAA AATACAAATAAATAAAAGTTTAGATTAA Protein sequence : MKSLTDSVQVLPGVGPKRVQALAELGISTIEDLITYYPFRYEDLAAKEPQNVVDQQKVTFQGVVATQPTVARFGRQKVRV NFRLLIGNESVMVTFFNQPWIKNQINADEEIAVYGKWDANRRSLTGIKIIDEEANLQPVYPANKHIRQATIQQLATDAIN QYQEQIQDVIPEELITKYRLLHRLAMVQALHFPADDQKTRDARRTAMFEEFLTFQMGLQLVKSRERIENGTAIKYQIQLV REFIQQLPFELTDAQKRVTNEILANLKSPTHMNRLLQGDVGSGKTVVAAIAMYATLTAGMQATLMAPTEILAEQHANNLS RFFEKLDVKIALLVGGIRKKIRDEMLAEIKNGEIDIVVGTHAIIQEDVQFKNLGLGIIDEQHRFGVHQRQLLREKGAAPD ILAMTATPIPRTLAITTYGDMDVSIIDQAPAGRKPIITKWVKRGEWEKVLAFMTKEFANGRQAFIVTPLIEESEAMDLQN AMELYQELCEFFGEKYPIAILHGKMDGAQKDQIMADFKEGKYMGLVSTTVIEVGVDVPNATLMVIQDADRFGLAQLHQLR GRVGRGQYQAYCILVADPKNEVGKQRMQIMVDTNDGFEISEADLKMRGQGDLFGKQQSGVPEFKVGDPVVDLGALQTAQI DAAKIVSQPAWDQDPRYQNLRLYLENKIQINKSLD |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
recG | CAJ77039.1 | ATP-dependent DNA helicase | Not tested | AbaR1 | Protein | 9e-101 | 42 |