|
Name : PEPE_0688 (PEPE_0688) Accession : YP_804191.1 Strain : Pediococcus pentosaceus ATCC 25745 Genome accession: NC_008525 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG0749 EC number : 2.7.7.7 Position : 728250 - 730913 bp Length : 2664 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGCAAAAGATAAACTTTTATTGATTGATGGAAATAGTATTGCTTTTCGGTCTTTTTTTGCGTTACATAATTCTTTAAG TAAATTTGTAAATAAAAATGGATTACATACTAATGCAATCTTTGGTTTCAACAAAATGTTAGATAGTATTTTAGAACAAT ACCAGCCGACAGCGGCCTTGGTGGCCTTCGATGCTGGTAAAACCACTTTTAGAAATGGAAAATTTGATAATTATAAAGGT GGTCGGTCTAAAACACCACCTGAACTATCAGAGCAAATGCCTTATTTACGTGAATTACTTACAGGATATGGAATAAAATC TTACGAGCTTCCTAATTATGAAGCTGATGACATTATTGGAACACTTGCTAAAGAAGCTGAAGCCCAAGATTATGCGGTAG TTGTGGTTACGGGAGATCGTGACTTAACCCAATTGAGTAGCGAAAAAACAATCGTCGCCGTTACGAAAAAAGGGGTAAGC GAAGTAGAAGAGTACACACCAGCGTATGTCGAAGAAAAATTAGGCGTAACACCTAAACAAATTATTGACATTAAAGGCTT AGCTGGAGACACATCGGATAATTATCCTGGAGTAACTAAAGTTGGTGAAAAGACGGCCATTAAGTTGTTAAAACAATTTG ATTCATTGGAGAATTTGTATGAGCATCTTGATGAATTAAAACCTAGCAAGATGAAGGAGCATTTGATTGAAGATCGAGAC AATGCTTTCATATCAAAAGATCTAGCAACTATTAGACGGGATGCACCGATAGAAATTAGTCTCGATGATGTGCAGTATGC CGGTATTAACGAAGAATATTTGAGAGAATTTTACCACCAAATGAACTTTAAGTCCTTTTTAAGTAAATTAGATCAAACGG CAACTCAAGATGGAGTTGAGGCCGTGAAAAAAGAGGTTGTTTTTAACGTTTTAAATAAGGACAACGTGGAACAACTCCAA TCATTAAAAGGTGAAATTGATTTTTATTTGGAAATGTTGGACAAAAACTATCATTTGTCTGATTTTACGGGATTTGTGAT CGGAAATGCCGATAACATTTGGGTTAGTGATGATGTAGAACTGTTGAACAATTCAAAAATCAAAGCTATTTTGGAAGATC CCAAAATTAAGATAAATGTATTTGATAGTAAGCGGACGTATGTTGGCTTACATCGACTAGGGATTAAGCTAACGGCGGTT AACTTTGATATATTGCTTCAATCGTATTTGTTAGATACTAATGATAATTCTAATGACCTAGGTCAACTTGCTCATGAGCA TGATTACGATGCGATTGATACAGACGATGATGTTTATGGCAAAGGCGCTAAGCGTGCGGTTCCAGAGCAAACAGAATTGT TTAACCACCTTGCACGTAAATTAGCAGCTATTAACTTTTTAGGTAAACAATTGGACCAAGAATTAGTAAAAAATGAACAA AATAATTTATATTGGGATATTGAATTACCACTCGCAATTGTATTAGCCAAGATGGAAATTAGCGGTATTAAAGTTGACCG CAACCGCTTAAATCAAATGCAAAGCGAGTTTACTGAACGCTTAAGTGAAATTGAAACCAATATCTACAACGAAGCGGGAG AGGAATTTAATCTTAATTCGCCCAAGCAACTCGGAGTAGTGCTGTTTGAAAAGTTAAAATTACCAATCATTAAGAAAACT AAAACAGGGTATTCAACTGCGGTAGACGTCTTAGAGAAATTACAAGGCGAGTCACCAATTATTGATAATATTTTGAACTA CCGTACGCTTTCAAAAATTAAATCAACTTATGTTGATGGGCTTTTAAAAGTAATTCATACGACTGATGAAAAAGTGCATA CAACCTATGTACAAACTTTGACCCAAACGGGCCGACTATCTTCCATTGACCCTAATTTACAAAATATTCCGGTGCGCATT GAAGAGGGTAGGAAGATTCGCCAAGCCTTTGTTCCAGCTCGTGAAGGGTGGCATATTTTATCATCGGATTACTCACAAAT TGAATTACGCGTATTAGCACATATTACAGGTGATCAGAATTTACAGGAAGCATTTAAAAATGGCGAAGATATTCATGCTA CAACTGCAGTTAAAATATTTGGATTAAAGGATGCTAGCGAGGTAACTCCTAATATCCGACGTCAAGCTAAAGCAGTTAAT TTTGGAATTGTGTATGGTATCAGTGACTATGGTTTGTCCCAAAACATTGGAATTTCTAGGAAAGATGCCAAGAAATTTAT CGAAACATACTTTAAGGAATTTCCTGGTGTAAAAAAATATATTGATGAATCAGTTCAGTTAGCTAAAGAACAAGGCTACG TAGAAACAATTGCGCACCGTCGACGTTACTTACCAGACATTAATTCGTCTAGCTTTAATTTACGTTCATTTGCGGAAAGA ACCGCTATGAATACGCCTATTCAAGGTAGTGCTGCTGATATTATTAAGATTGCGATGATCGATATGGAAAATGAATTAGA AAAGCGTAACTTGAAGAGTAGAATGTTACTCCAAGTGCACGATGAATTGATTTTTGAAGTTCCGGATGAAGAAATGACGT TAATGAAAGAATTAGTACCGAAGGTTATGGACTCAGCAGTTAAATTGGATGTTCCACTTAAAGTTGGAGCAGCTTGGGGA AATACGTGGTACGACGCTAAATAA Protein sequence : MAKDKLLLIDGNSIAFRSFFALHNSLSKFVNKNGLHTNAIFGFNKMLDSILEQYQPTAALVAFDAGKTTFRNGKFDNYKG GRSKTPPELSEQMPYLRELLTGYGIKSYELPNYEADDIIGTLAKEAEAQDYAVVVVTGDRDLTQLSSEKTIVAVTKKGVS EVEEYTPAYVEEKLGVTPKQIIDIKGLAGDTSDNYPGVTKVGEKTAIKLLKQFDSLENLYEHLDELKPSKMKEHLIEDRD NAFISKDLATIRRDAPIEISLDDVQYAGINEEYLREFYHQMNFKSFLSKLDQTATQDGVEAVKKEVVFNVLNKDNVEQLQ SLKGEIDFYLEMLDKNYHLSDFTGFVIGNADNIWVSDDVELLNNSKIKAILEDPKIKINVFDSKRTYVGLHRLGIKLTAV NFDILLQSYLLDTNDNSNDLGQLAHEHDYDAIDTDDDVYGKGAKRAVPEQTELFNHLARKLAAINFLGKQLDQELVKNEQ NNLYWDIELPLAIVLAKMEISGIKVDRNRLNQMQSEFTERLSEIETNIYNEAGEEFNLNSPKQLGVVLFEKLKLPIIKKT KTGYSTAVDVLEKLQGESPIIDNILNYRTLSKIKSTYVDGLLKVIHTTDEKVHTTYVQTLTQTGRLSSIDPNLQNIPVRI EEGRKIRQAFVPAREGWHILSSDYSQIELRVLAHITGDQNLQEAFKNGEDIHATTAVKIFGLKDASEVTPNIRRQAKAVN FGIVYGISDYGLSQNIGISRKDAKKFIETYFKEFPGVKKYIDESVQLAKEQGYVETIAHRRRYLPDINSSSFNLRSFAER TAMNTPIQGSAADIIKIAMIDMENELEKRNLKSRMLLQVHDELIFEVPDEEMTLMKELVPKVMDSAVKLDVPLKVGAAWG NTWYDAK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 54 |
