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Name : PEPE_0428 (PEPE_0428) Accession : YP_803966.1 Strain : Pediococcus pentosaceus ATCC 25745 Genome accession: NC_008525 Putative virulence/resistance : Unknown Product : protein translocase subunit secA Function : - COG functional category : U : Intracellular trafficking, secretion and vesicular transport COG ID : COG0653 EC number : - Position : 478431 - 480791 bp Length : 2361 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGCAAACATTTTAAAAAAATGGGTGGAAAGTGATGCGCGTGAGTTAAAAAGACTCGGTAAAAAAGCAGATAAGATTGA AGCCCTAAAAGAAGAAATGGAACAACTAAATGATGAAAAACTTAAGGCTAAAACTACAGAGTTTAAAGAGCGTCTACAAA ATGGCGAAACTTTAGATGATATTTTAGTTGAAGCTTTTGCAGTCGCACGTGAAGCAGCTAAGCGAGTATTAGGCTTATTC CCATTCCGCGTCCAATTAATTGGTGGAATGGTACTTCATGGTGGTAACATTGCTGAAATGAAAACTGGTGAAGGTAAGAC TTTAACGGCCACATTACCCGTGTATCTGAATGCCTTAGGTGGTAAAGGGGTTCACGTTGTTACTGTTAATGAATATTTGG CTGAACGTGACTCAAGTGAAATGGGTGAGCTTTATAAATGGCTTGGCCTAACAGTAGGGGTTAATTCTTCAGAAATGACT CCCGACCAAAAACGTGAAGCTTACAATTGTGATATCACTTATTCAACGAACAGTGAAATCGGTTTTGATTACTTAAGAGA TAACATGGTTGTGTATAAAGAGGATATGGTACAACGTCCTCTAAACTTCGCCTTGATTGATGAGGTTGATTCAATTTTAA TTGATGAAGCCAGGACACCTCTGATTATTTCTGGTCAGACTGAACCAACTGTTACGCTATATGAACGTGCTGACCGTTAC GTGAAGACTTTGGCTGATGGTGATTACACGATTGATTGGGAATCAAAATCCATCTCATTAACAGAAAATGGGATTCGTCG TGCGGAAAACTTCTTTAAAACCGACAACCTCTACGATGTTGAAAATAGTGCGTTGAACCATCATATTGATCAAGCTCTTC GAGCAAATTATATTATGACTAAAGACAAGGACTACGTGGTTTCAGATGGTGAAGTCTTAATCGTTGATTCTTTTACAGGT CGTGTAATGGAAGGCCGTCGTTTTTCTGATGGACTGCACCAAGCGATTGAAGCTAAGGAACACGTTGAAATTCAAGATGG GGCTAAAACTATGGCCAACATCACTTATCAAAACTTGTTTAGAATGTATCGTAAACTTTCAGGGATGACCGGTACAGCTC GGACTGAAGCAGAAGAATTCCGTGAAATTTACAATATGGAAGTTACAACCATTCCAACCAACCGTCCGGTGGCTCGTGAT GACCGTCCAGATTTACTTTATCCAACTTTGGAAAGTAAATTTAAGGCAGTGGTGAAGGAAATCCGTGATTTGCATATTAA AGGTCAACCAGTTCTAGTTGGTACGGTTGCGGTTGAAACTTCAGAATACCTCTCACGCTTGCTTGATCGAGAAGGTATTC CACATGTTGTTTTGAATGCTAAGAATCATGCCCGTGAAGCTGAAATTGTTACCAACGCCGGTCAAAAGGGTGCGGTAACA ATTGCTACTAATATGGCTGGTCGTGGTACTGATATTAAATTAGGACCTGGCGTAGTTGAACTAGGTGGTTTAGCTGTAAT TGGTACTGAACGACATGAATCACGACGGATCGATAATCAGCTTCGTGGTCGTTCGGGACGTCAAGGTGATGTCGGAATGT CCCAATTCTATCTTTCACTAGAAGATGACTTGATGATTCGTTTTGGTTCAGAACGAATCAAAGATTTGCTTTCTAGGATG AAAATTGCGGATGAAGATGCAGTTATTCGAAGTGGTTTAATTAGCCGTCAAGTTGAATCTGCTCAAAAACGAGTTGAAGG TAATAACTACGATGCTCGTAAGAACGTTCTTCAATACGATGATGTTATGCGTGCGCAACGTGAAGTGATTTACGCTGAAC GTCAACAAGTGATCATGGAAGAAACTAGTCTAAAAGATGTGCTAATGCCGATGGTTGATCGAACGATTGACCGCGTGGTT GATGCCCATACCCAAAAAACTCAAAAGAACTTTGATTTAGAAACCATTGTAGAATTTGCACGGACTGCCTTGGTTTCAGA TAAAGACATTCATCAAGCTGATGTGGAAGGGATGTCTGCTAAAGAAATTAAGGACTACTTGAAACAACTAGCTGATCAAA TGTACATTGAAAAAGAAAAAGCTTTGTACGACCCAGCTCAAATTCTAGAATTTGAAAAAGTTGTGATTCTCCGAGTGGTT GACCAACACTGGACCGATCATATTGATGCCATGGACCAGTTACGTCAATCGGTTGGACTTCGAGGCTATGGACAGTTAAA TCCATTAGTTGAATATCAACAAGAAGGTTACCGAATGTTCAACGAAATGATTACAGATATCGAATATGAAACTACTCGAT TATTTATGAAATCTGAAATTCGTCAAAATCTTCAACGGTAG Protein sequence : MANILKKWVESDARELKRLGKKADKIEALKEEMEQLNDEKLKAKTTEFKERLQNGETLDDILVEAFAVAREAAKRVLGLF PFRVQLIGGMVLHGGNIAEMKTGEGKTLTATLPVYLNALGGKGVHVVTVNEYLAERDSSEMGELYKWLGLTVGVNSSEMT PDQKREAYNCDITYSTNSEIGFDYLRDNMVVYKEDMVQRPLNFALIDEVDSILIDEARTPLIISGQTEPTVTLYERADRY VKTLADGDYTIDWESKSISLTENGIRRAENFFKTDNLYDVENSALNHHIDQALRANYIMTKDKDYVVSDGEVLIVDSFTG RVMEGRRFSDGLHQAIEAKEHVEIQDGAKTMANITYQNLFRMYRKLSGMTGTARTEAEEFREIYNMEVTTIPTNRPVARD DRPDLLYPTLESKFKAVVKEIRDLHIKGQPVLVGTVAVETSEYLSRLLDREGIPHVVLNAKNHAREAEIVTNAGQKGAVT IATNMAGRGTDIKLGPGVVELGGLAVIGTERHESRRIDNQLRGRSGRQGDVGMSQFYLSLEDDLMIRFGSERIKDLLSRM KIADEDAVIRSGLISRQVESAQKRVEGNNYDARKNVLQYDDVMRAQREVIYAERQQVIMEETSLKDVLMPMVDRTIDRVV DAHTQKTQKNFDLETIVEFARTALVSDKDIHQADVEGMSAKEIKDYLKQLADQMYIEKEKALYDPAQILEFEKVVILRVV DQHWTDHIDAMDQLRQSVGLRGYGQLNPLVEYQQEGYRMFNEMITDIEYETTRLFMKSEIRQNLQR |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| secA2 | YP_006310687.1 | preprotein translocase subunit SecA2 | Not tested | FWisland_3 | Protein | 9e-159 | 45 |
