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Name : PEPE_1770 (PEPE_1770) Accession : YP_805233.1 Strain : Pediococcus pentosaceus ATCC 25745 Genome accession: NC_008525 Putative virulence/resistance : Unknown Product : dihydrolipoamide dehydrogenase Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1249 EC number : 1.8.1.4 Position : 1743914 - 1745320 bp Length : 1407 bp Strand : - Note : E3 component of pyruvate complex; catalyzes the oxidation of dihydrolipoamide to lipoamide DNA sequence : ATGGTAGTTGGTACACAAGCAATTAACGTTGACACTTTAATTATTGGATCTGGTCCTGGTGGATACGTTGCTGCTATTCG AGCAGCTGAATTAGGACAAAAAGTTGTGATTGTTGAACGTGATTATATCGGAGGAGTTTGTTTGAATGTTGGATGTATTC CATCTAAAGCTTTGATTCAAGCTGGACACCTCTACTCAACTTTACAACATGGTAATCCATTTGGAGTTTCGGTATCAGAA TCTAAAATTGATTTCACTAAAACTCAAGAATGGAAACAAAATCAGGTTGTTAACAAACTAACTGGTGGAGTGGAACTCTT ACTTAAGAAACACAAAGTTGCAATTGTGCGAGGAGAAGCTTACTTCAATGATAACGAAACGGTTAACGTAATCAACGGAG ATGATTCCCATGTATATCGCTTTAAGAGAGCTTTGATTGCCACTGGTTCTCGTCCAGTTGAAATCCCACACTTTAAATTT AGTGGTCGAGTAATTGATTCCACTGGAGCCTTGAACTTAAAAGATGTTCCAGAACATCTCATCATTATTGGTGGTGGGGT GATTGGAGCGGAACTTGCTGGAGCTTACATGAACCTTGGTTCAAAGATTACCATCATTGAAGGTTTGGATCACATTTTAA ATGGATTTGATGGTGAATTGATTCAGCCAGTTTTGAATAACTTTAAGAAAAATGGAGTCGAAATTGTTACTGAAGCTACA GCGGTTGAGGCAAACCAAACTGACAAAGATGTTACAGTAACCTATGAAGCTGATGGAACAACCAAGACGGTTAACGGAGA CTACTGTTTAGTTTCAGTAGGCCGCCGTCCTAACACAGATCAGCTTGGTTTGAATAATACCAATATCAAGTTAAGTAAGC GTGGTTTAATTGAAGTTAATGATTCCATGCAAACATCAGTTAAACATATTTATGCTATCGGTGATGTGGTCGCTGGACCA GCTTTAGCGCATAAGGCTAGTTTTGAGGCTAAGGTGGCAGCAGCTGCTATGGGTGGCGAAGATGCTCATGATACACATTA TGTTTTGCCAGCCGTTGCTTACACAAACATTGAATTAGCAACTGTAGGTGAAACTCCGCAATCTATTGCTGAAAAGAAGT TGGATGCTAAATCAAGCAAGTTCCCATTTGCTGCTAGTGGACGTGCCATGACTATGGATCAAACAGAAGGCTTTATCCGT CTAATTACGGATAATCCTACTGGCGGTATTATTGGAGCGCAAATTGTGGGTCCGGAAGCTTCTAATTTGATTTCTGAGCT AACTTTAGCGATTGAAAATGGATTAACAATTAAAGATATTGAATTAACCATTCATCCACATCCAACGTTGGGTGAAGAAA TTATGGATGCAGCGGAATTAGCTGCAGGACTACCAATTCACGTTTAA Protein sequence : MVVGTQAINVDTLIIGSGPGGYVAAIRAAELGQKVVIVERDYIGGVCLNVGCIPSKALIQAGHLYSTLQHGNPFGVSVSE SKIDFTKTQEWKQNQVVNKLTGGVELLLKKHKVAIVRGEAYFNDNETVNVINGDDSHVYRFKRALIATGSRPVEIPHFKF SGRVIDSTGALNLKDVPEHLIIIGGGVIGAELAGAYMNLGSKITIIEGLDHILNGFDGELIQPVLNNFKKNGVEIVTEAT AVEANQTDKDVTVTYEADGTTKTVNGDYCLVSVGRRPNTDQLGLNNTNIKLSKRGLIEVNDSMQTSVKHIYAIGDVVAGP ALAHKASFEAKVAAAAMGGEDAHDTHYVLPAVAYTNIELATVGETPQSIAEKKLDAKSSKFPFAASGRAMTMDQTEGFIR LITDNPTGGIIGAQIVGPEASNLISELTLAIENGLTIKDIELTIHPHPTLGEEIMDAAELAAGLPIHV |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SE0077 | NP_763632.1 | dihydrolipoamide dehydrogenase component of pyruvate dehydrogenase E3 | Not tested | SCCpbp4 | Protein | 5e-88 | 44 |
