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Name : lysS (BCc_270) Accession : YP_802825.1 Strain : Buchnera aphidicola BCc Genome accession: NC_008513 Putative virulence/resistance : Virulence Product : hypothetical protein Function : - COG functional category : J : Translation, ribosomal structure and biogenesis COG ID : COG1190 EC number : 6.1.1.6 Position : 302882 - 304390 bp Length : 1509 bp Strand : + Note : COG_category J;COG_number COG1190 DNA sequence : ATGTCAAAAACTTTAAAAATAATTCAAAAAAAAAAATCCTTAGAAAAAGAATTATATACAAGAAAAAAAAAACTAAAAAA ATTAAAAAAATTAGGTTTTAATTTTCCAAATACTTTTCATTATATACATACAATTAAAGAAATAAAAAAATTATATAATA ATTATACAAAAAAAGAATTAGAAAAAATTAACTATAAAACGAAAATTTCAGGAAGAATAGTAAATAAAAGAACTTTTGGT AAAGCGTTATTCTTTGTTATACGAAATAATAATCATGACATTCAAATATATATTAAAAGTAATTATTTTCCAAAAAATTA TTATCAAAAAAATATTCTTGAATTAGATTTAGGTGATATTATTGGGGTAAAAGGAAAAATATTTAAAACAAATACATGCG AGTTATCAATTTTATGTAAAAAAATATATTTATTAACTAAATCTTTAAGATCTTTACCTGATAAATATTTTGGATTAAAA AATCAAGAAATTAAATATAGAAAAAGATATTTAGATTTAATATCTAATAATAAAATTATTAAAATTTTTCAAAAAAGATC ATTAATTATATCTAACATAAGATCTTTTATGAAACAAAAAAAATTCTTGGAAGTTGAAACTCCTATGTTACATCCTATCC CAGGTGGAGCTAATGCAAAACCATTCATCACTTATCATAATTCATTAAACGAAAAAATGTATTTAAGAATAGCACCTGAA TTATATCTTAAAAAATTAATTATTGGTGGTTTTAATAAAATATTTGAAATAAATAGAAATTTTAGAAATGAAGGTATATC AACAAAACATAATCCAGAATTTACAATGATGGAAATTTATATGTCTTATAGTAATTATATTGATATAATGAATTTATTAG AAGAATTATGTATTTTTTTAGTAAAAAAAATTTCTAAATCATTAATTATTATGTATAAATCAAAAAAAATAAATTTTAAA AAACCTATAAAAAAAATGACAATGATTGAATCTATTTTAAAATTTAATAAAAATATTGATATATCTAATTTTAAAAATAT AAAAAATATAAAAAAAACTGCAACAAATCTTAATATTAAAATTGATTCAAATGCATCTTTAGGAGAAATTACAAATTTAA TTTTTGAAAAAACAACAGAAAAAAAAATTATTCAACCAACATTTATTACTGAGTATCCAATTGAAATTTCTCCATTAGCA AAAGAAAAAAATAAATATTTTGCAGAAAGATTTGAATTTTTTATTGCAGGTTATGAAATAGCAAACGGTTTTTCTGAATT AAATGATCCAGAAGAACAAAAAAAACGATTTAAATTACAAATATCTAAAAAAAATTATACAGATAAATCAAAAAATTTTT CTTATGATAAAGATTATATTATTGCTTTAGAACACGGTTTACCTCCTACATCTGGATTAGGAGTAGGAATTGATAGATTG ATTATGATTTTAACTAATCAAAAAACTATAAAAGATATTATTTTTTTTCCTTTATTAAAAAAAATTTAA Protein sequence : MSKTLKIIQKKKSLEKELYTRKKKLKKLKKLGFNFPNTFHYIHTIKEIKKLYNNYTKKELEKINYKTKISGRIVNKRTFG KALFFVIRNNNHDIQIYIKSNYFPKNYYQKNILELDLGDIIGVKGKIFKTNTCELSILCKKIYLLTKSLRSLPDKYFGLK NQEIKYRKRYLDLISNNKIIKIFQKRSLIISNIRSFMKQKKFLEVETPMLHPIPGGANAKPFITYHNSLNEKMYLRIAPE LYLKKLIIGGFNKIFEINRNFRNEGISTKHNPEFTMMEIYMSYSNYIDIMNLLEELCIFLVKKISKSLIIMYKSKKINFK KPIKKMTMIESILKFNKNIDISNFKNIKNIKKTATNLNIKIDSNASLGEITNLIFEKTTEKKIIQPTFITEYPIEISPLA KEKNKYFAERFEFFIAGYEIANGFSELNDPEEQKKRFKLQISKKNYTDKSKNFSYDKDYIIALEHGLPPTSGLGVGIDRL IMILTNQKTIKDIIFFPLLKKI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| unnamed | CAD66193.1 | putative lysil-tRNA synthetase LysU | Not tested | PAI III 536 | Protein | 2e-103 | 49 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| lysS | YP_802825.1 | hypothetical protein | VFG1668 | Protein | 1e-103 | 49 |
