Name : serS (BCc_193) Accession : YP_802758.1 Strain : Buchnera aphidicola BCc Genome accession: NC_008513 Putative virulence/resistance : Unknown Product : hypothetical protein Function : - COG functional category : J : Translation, ribosomal structure and biogenesis COG ID : COG0172 EC number : 6.1.1.11 Position : 226809 - 228110 bp Length : 1302 bp Strand : - Note : COG_category J;COG_number COG0172 DNA sequence : ATGTTAAATTTCAAAGATATTAAAAATAACTATTCTTTTTTTAAAAAAAAACTAGAAAAAAAAAATTATTTCTTAAATAT AAAAAAATTTAAAAAATTAGATTATATACGTAAAAATTTACAAATTAATACTGAGATCAAAATTTCAGAACATAAAAAAT TATCTAAATATATGATTTTTTATAAAAAAATCTATACTAATACATATTTATTGAAAAATAAATTAATTAATTCTAGAAAT AAAATATTTTTATTAAAAAAAAAATTAGAAAAAATAAAAAAAAAAATACACAATATGTTAATATTAATTCCTAATATACC ATATGATGATGTACCTTTAGGTAATAAAGAAAAAAACAATAAAGAAATTTTTCGATGGGGAAAAATAAAAAAATATAATT TTCCTATTCTGAATCATATAGAAATTGGAAATAAATTACAAGGATTTGATTGGAAAGTTTCATCAAACATTTCTGGGTCA GGATTTTCTATAATGAAAGGTTCAATTGCATATTTACATCGTGCATTAGGTCAATTTATGTTAAATATTCATACTAAAAT TCATGGATATAAAGAAATTTATGTACCTTTTATTGTAAAAAAAAAATGTATGTATGGAACAGGACAATTACCAAAATTTA AAAACGATCTATTTCATATACAAAATATGCATCATTTAAATAAAAAAAACAATTATGATAATTTTTTTTTAATACCAACT TCAGAAGTATCTTTAATTAATTTAGTACAAAATAAAATATTATTATCTCATGAATTACCCTTAAAGTTTACAGCATTAAG TGCCTGTTTTAGAGCAGAACCTAATACTTATGGTAAAGATGCACAAGGTCTAATTCGAAATCATCAATTTGATAAAGTAG AAATTGTTCAAATTGTTCATCCTAAAGATTCTGAAAAAACTTTAGAAGAATTAACTAATCATGCTGAAAAAATTTTACAG CTATTAAAATTACCTTATAGAAAAATGTTATTATGTGAAGGAGAACTTGGTTTTTCATCTAAAAAAACATATGATTTAGA AGTATGGTTACCATCGCAAAAATTATATAGAGAAATATCATCATGTTCCATGATTGGAGATTTTCAATCTAGAAGGATAA ATGCTAAATATAAAGATAAGAAAAAAAATAAAAATTTTTTTTTACATACATTAAATGGTTCTGGATTAGCAGTAGGAAGA ACATTAGCAGCTATTTTAGAAAATTTTCAGTGTTCTAATGGAACAGTTAAAATACCCAAAGTATTACGAAATCCATATAT GAATGGAATGAAATTTTTATAA Protein sequence : MLNFKDIKNNYSFFKKKLEKKNYFLNIKKFKKLDYIRKNLQINTEIKISEHKKLSKYMIFYKKIYTNTYLLKNKLINSRN KIFLLKKKLEKIKKKIHNMLILIPNIPYDDVPLGNKEKNNKEIFRWGKIKKYNFPILNHIEIGNKLQGFDWKVSSNISGS GFSIMKGSIAYLHRALGQFMLNIHTKIHGYKEIYVPFIVKKKCMYGTGQLPKFKNDLFHIQNMHHLNKKNNYDNFFLIPT SEVSLINLVQNKILLSHELPLKFTALSACFRAEPNTYGKDAQGLIRNHQFDKVEIVQIVHPKDSEKTLEELTNHAEKILQ LLKLPYRKMLLCEGELGFSSKKTYDLEVWLPSQKLYREISSCSMIGDFQSRRINAKYKDKKKNKNFFLHTLNGSGLAVGR TLAAILENFQCSNGTVKIPKVLRNPYMNGMKFL |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
serS | YP_003446791.1 | seryl-tRNA synthetase | Not tested | The aminoglycoside resistance gene cluster | Protein | 2e-71 | 41 |