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Name : LVIS_0546 (LVIS_0546) Accession : YP_794726.1 Strain : Lactobacillus brevis ATCC 367 Genome accession: NC_008497 Putative virulence/resistance : Unknown Product : transcriptional accessory protein Function : - COG functional category : K : Transcription COG ID : COG2183 EC number : - Position : 579267 - 581462 bp Length : 2196 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGCAACGAAACAAGAAACAGCTTTAAGTGAATTAGCTCAGCCAATTCATCAAACGTTGAGTCAATATCGTGTGCGGCA GATTCAAGCCGTCTTGACCCTATTGGATGAAGGTAATACGGTGCCCTTTATCGCTCGGTACCGAAAAGAGCGGACGGGAT CACTAGATGAAGTCGCCATTCGCGATATTGAAGACGAAGCCCATCGGCTGACCAAATTGAATCAACGGCGCGACGATGTA TTAAAGCTGATTGCAGAGCAAGGTAAATTAACGCCGGCACTCAAAGAAAACTTGATGCACGCAACTGTGCTACAACAGGT GGAAGATCTTTATTTGCCATACAAGCAAAAGCGGCGCACCAAAGCAACGATTGCTCGGGAAGCCGGGTTGGCACCGCTAG CTAATTGGTTATTAACGTTCCCAACGGGTGGCTTAGATGAACGGGCAGCTGCTCTAGTGGCCGCAGATAAGGGATTGCCT GATGTGGCGAGTGTCTGGGCTGGTGTCCACGAAATCTTGGCAGAAACATTTAGTGAACAGGCCGCCTTTCGTGAATGGAT TCGACGTTATACGTGGCAGCATGGAGAGTTAACCAGTAAGCTTAAGCGCGGGGCCGCTACGGAGGATGAACAACAAGTTT ACGCGACGTACTATGAATTTACGCAGAGCTTAAAGCAGGTGCCGCCGTATCGGGTGTTAGCGATTAATCGGGGTGAACGA GAAAAGATCCTATCTGTGGGAATTAATGTTGATGCGACGTCCATTCTGCAATATGGTCACTTTCGGTTAGTGGGTCAGCA TCGTGGACCGGCTGTGGAAAAAGTCACAGCGGCATTTGCGGATGCTTATAAGCGCTTTTTAGGCCCGGCAATTGAACGGG AATTACGCCGACAATTAACGGATCAGGCCGATGAACATGCCATTCAAGTGTTTGGCAATAACCTGTATCACTTGTTGATG CAGGCACCCCTCAAAGGGAAAATTGTGATGGGGTTTGATCCGGCGTATCGAACCGGTTGTAAGCTAGCAATTATGGATGC TAATGGTCGCTTCTTAGCTAAACAAGTCATTTATCCACATAAGCCAGCCGATGCTAAGAAACGGGCGGCGGCAACACCAG CATTTAAAAAATTGCTTGAGGACTATCACGTTGAAATGATTGCCATTGGTAATGGGACTGCTAGTCGTGAATCCGAAGAA TTTGTGAGTCAAATACTGAAGACATTGAACCGACCAGTGTATTATGTGTTGGTCAATGAAGCCGGTGCCTCAGTATACTC GGCTAGTGCCAATGCGCGGGCTGAATTTGCTGATTTTCACGTTGAAGAGCGGTCAGCGGTCAGTATTGGTCGACGGTTGC AAGATCCTTTAGCTGAATTAATTAAGATTGATCCGAAAGCTGTCGGGGTCGGGCAGTACCAACACGACGTTCCCAAAAAA GCGTTGGATGAACAACTTGATCGAGTCGTTGAAACGGCGGTTAACCAAGTTGGGGTTAATGTTAATACGGCAAGTCCCGA ATTGCTCACCCATATTTCGGGCCTAACAACGACGACTGCTAAGAACATTGTCGCTTACCGTAACGATCATGGCGCCTTTA ACAGTCGGCAGGCCCTGCAACAGGTGCCGCGTTTAGGGCCGAAAGCTTACCAACAAGCGGTGGGCTTCTTACGAATTATT GAGGGCAGTGACCCGCTGGATAACACGGATATCCATCCGGAAAGTTATTCAGCCGCCCGTCAGCTATTAACCGGGTTGAA CCTCACAACCACGAGCGTTGGCACCCCGCAATTGCAACAGCAATTAGCCAAACTCAATCAGCAACAGTGGGCGAACCAGT TGGGGATTGGACCAGCAACCTTGGCGGATATTGTGACCGGGTTAAGCAAACCCGGTCGTGACTTACGGGATAGTATGCCA GCCCCGCTGTTACGGCAGGATGTGTTGACGATGGCCGACTTGCAACCGGGAATGGAATTGCAAGGCACCGTCCGGAACGT CGTTGATTTTGGTGCGTTTGTGGATATTGGGGTTAAGCAGGATGGCTTGGTCCACATTTCCCAGTTAGCTGATCACTACG TCAGTGATCCTAGCACGGTAGTCACAATTGGTGATGTGGTGACAGTTTGGGTGTTGAGTGTTGATGAGAATCGCCAACGC ATTCAGTTGACGATGAAGCAGGCTGCTCGTGACTGA Protein sequence : MATKQETALSELAQPIHQTLSQYRVRQIQAVLTLLDEGNTVPFIARYRKERTGSLDEVAIRDIEDEAHRLTKLNQRRDDV LKLIAEQGKLTPALKENLMHATVLQQVEDLYLPYKQKRRTKATIAREAGLAPLANWLLTFPTGGLDERAAALVAADKGLP DVASVWAGVHEILAETFSEQAAFREWIRRYTWQHGELTSKLKRGAATEDEQQVYATYYEFTQSLKQVPPYRVLAINRGER EKILSVGINVDATSILQYGHFRLVGQHRGPAVEKVTAAFADAYKRFLGPAIERELRRQLTDQADEHAIQVFGNNLYHLLM QAPLKGKIVMGFDPAYRTGCKLAIMDANGRFLAKQVIYPHKPADAKKRAAATPAFKKLLEDYHVEMIAIGNGTASRESEE FVSQILKTLNRPVYYVLVNEAGASVYSASANARAEFADFHVEERSAVSIGRRLQDPLAELIKIDPKAVGVGQYQHDVPKK ALDEQLDRVVETAVNQVGVNVNTASPELLTHISGLTTTTAKNIVAYRNDHGAFNSRQALQQVPRLGPKAYQQAVGFLRII EGSDPLDNTDIHPESYSAARQLLTGLNLTTTSVGTPQLQQQLAKLNQQQWANQLGIGPATLADIVTGLSKPGRDLRDSMP APLLRQDVLTMADLQPGMELQGTVRNVVDFGAFVDIGVKQDGLVHISQLADHYVSDPSTVVTIGDVVTVWVLSVDENRQR IQLTMKQAARD |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| NMB0075 | NP_273139.1 | transcriptional accessory protein Tex | Not tested | IHT-A | Protein | 1e-120 | 43 |
