Gene Information

Name : LVIS_2234 (LVIS_2234)
Accession : YP_796315.1
Strain : Lactobacillus brevis ATCC 367
Genome accession: NC_008497
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : purine-cytosine permease related protein
Function : -
COG functional category : F : Nucleotide transport and metabolism
COG ID : COG1457
EC number : -
Position : 2199791 - 2201164 bp
Length : 1374 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGAATAATGAGCTCGTCAAAATTTCGGATGCAGATAAAACATTAACGCCAGGGAAAATTTTCTACAATTGGTTTGCCGC
GAATATTGGGATTATGGGATTCGTCTTTGGTGCGATGATTGTTGCTTATCATCTGTCGTTTGCCCAAGCAATTCTCGCTG
CTTTTTGTGGCGCGTTGTCCTTTTTAGTGCCAGGATGGGTGGCGATGATTGGTCAACGAGAAGGTGTGACGACCTTTAAA
TTGAGTCGGGCGGCTTATGGTACTTGGGGGAATAAAATTCCCAATGCCATCGCTTGGATTAATATGGTGGGGTGGCTTTC
GGTTAACGTGATTACGGGGACCATGCTATTAATTTCCATGTACGGTGTTTTAGATATTCCTAAAAACACCGTCACCCGGG
TCATTGCTCTGGCTATTTTTGGTGGATTAGTGCTACTTTCAGGTTTATTAAAAGAAGCCACTTTAGCCAAGATTCAAACA
TGGTTAAGCTATGTCTTTGGCGCGTTAACGGTTGTTATTTTGATTCTCTTCTTGCTAAAGGCGGATTGGCAGGCCGCCTT
TAATCTTCCGAGCGGTCATTGGATTAGCGGTTTCTTACCAGCTGTCAGCATCGTTGCCGCCGGTTCAGGTATTTCTTGGT
CGATGGCAGCCGCCGATTGGGGCGCCTATGTCAAACCGAAAACGAAACCGCAGGCGACCTTTTGGGGAACAGCCTTGGGT
GGCGCAGTACCCTTGTTTGTCCTCATGGCCGGTGGTGTTTTGTTAAGTACGATTGAACCGGCTTTGGCGACAACGGGTGA
TCCGTTTGGCGTAATGTACTCAGCCTTACCAAGCTGGATCGGCGTCATCTATTTTCTGGTAGCCGCTGGGGGTCTAATCC
CGCAATGTATTGTATCTTTGCGGTCGGCCCGAATTAACTTGGGGACGATTGGAATTCGCGTGTCACAACGGACTTCTTTA
GTTATTCATGGTTTAATTGTGATTTTGATTCCAGTTTACGTTCTCTTTATCTCAGGAAATTTTCTAGCCAACTTCGAATT
GTTCTTAAACTTTTTGGGGATTTGTTTGGCTAGTTGGGTTGCCATCTTCCTATGCGATAGTGCGATGTTCAGAAAAAACG
GCTATGAGTTGGCGTTATTAGTGCCAGATTCTAAAAAGCACTATAACTGGGGTGGCATTATCTCTTGGGTCATTGCGACG
ATTACGGGTTTTCTGTTTACCAATAATGCGATTTGGAATGGCCCATTTGCTCACGGGATTTTTAGAAATAATAGTCTCGG
CGTTTTTATCTCGGCAATTGTTGCGATCATCTGTATGTTCATCGTTAAAATGGTAGCGTATTCAAACAATGAGGGGGTTA
GCCATCATGAGTAA

Protein sequence :
MNNELVKISDADKTLTPGKIFYNWFAANIGIMGFVFGAMIVAYHLSFAQAILAAFCGALSFLVPGWVAMIGQREGVTTFK
LSRAAYGTWGNKIPNAIAWINMVGWLSVNVITGTMLLISMYGVLDIPKNTVTRVIALAIFGGLVLLSGLLKEATLAKIQT
WLSYVFGALTVVILILFLLKADWQAAFNLPSGHWISGFLPAVSIVAAGSGISWSMAAADWGAYVKPKTKPQATFWGTALG
GAVPLFVLMAGGVLLSTIEPALATTGDPFGVMYSALPSWIGVIYFLVAAGGLIPQCIVSLRSARINLGTIGIRVSQRTSL
VIHGLIVILIPVYVLFISGNFLANFELFLNFLGICLASWVAIFLCDSAMFRKNGYELALLVPDSKKHYNWGGIISWVIAT
ITGFLFTNNAIWNGPFAHGIFRNNSLGVFISAIVAIICMFIVKMVAYSNNEGVSHHE

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SERP2217 YP_189773.1 cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin permease family protein Not tested vSe1 Protein 1e-68 45