Name : fucP (HS_0750) Accession : YP_718960.1 Strain : Haemophilus somnus 129PT Genome accession: NC_008309 Putative virulence/resistance : Unknown Product : fucose permease Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0738 EC number : - Position : 804726 - 806000 bp Length : 1275 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGCCCGATGGTTATCTCAATAAAACACCTATTTTCCAATTTATTTTGCTTTCTTGTTTATTCCCACTTTGGGGAGCAGC AGCCAGCTTAAATGATATTTTAATCACTCAGTTTAAAAGTGTATTTACGCTGAGTGATTTTGCCAGTGCTTTAGTACAAA GTGCATTTTATGGAGGATATTTTTTAATTGCGATACCTGCATCATTGGTGATCAAAAAAACCAGCTATAAAATTGCTATT TTAATTGGCTTAATGCTATATATCGGTGGTTGTTCGCTATTCTATCCAGCCTCGCATATGGCAACATACACAATGTTTTT AGTGGCTATTTTCTCTATTGCGATTGGGTTAAGTTTCTTGGAAACCTCTGCGAATACTTATAGTTCAATGATTGGACATA AAGATCATGCAACGTTGAGATTAAATATAAGCCAGACTTTCTATCCAGTTGGTGCTATTTCAGGTATTTTATTAGGTAAA TACCTCATTTTCCAAGAAGGTGCCAGTCTTGAAGAACGAATGGTAGGAATGACACCGGAACAGTTGCATTCATTTAAATT ATCAATGTTAGAACATACGTTGTCACCATATAAATACTTAATCTTCATATTGATTGCGGTGACTTTTTTATTCGTAATTA CCTCTTTTCCTAAATGTAAAGCAGTTACACAAACAGGTAAATCAGAAGTGAAATTTACCGATACGCTAAAATATCTAGCG AGTAATACAAAATTTAAAAAGGGAATTGTTGCTCAATTTCTCTACGTTGGTATGCAAGTTGCCGTATGGTCATTTACTAT TCGTTTGGCACTCAATTTAAGTGATATGAATGAACGTGAAGCCTCAAATTTTATGGTTTATAGCTTTATTGGATTCTTTA TTGGCAAATTTGTCGCTAATTTCTTAATGACTAAATTTAAGTCAGATCTCGTTTTACTTTGGTATTCCATTTTAGGTGTG ATCACTCTAGCTTATACCTCTTTTGTTCATGATTTTTCTGCTGTTTATGCGGCTATTTTCGCCAGTTTGTTGTTTGGTCC TTGCTGGGCAACAATCTATGCCTCAGTACTGGATACTGTTAATCAAGAGCATAGAGAAGTGGGTGGGGCTGTTGTCGTCA TGTCTATTATCGGTGCCGCTGTTGTTCCTGCAATTCACGGTTATGTCTCAGATACATTAGGATCTCTTCAACTTGCATTT ATTGTACCTTTATTCTGTTTTGCTTATGTTGGCTATTATTTTTATGGAAAATTAAAAGAAAACAAGGAGAAATAG Protein sequence : MPDGYLNKTPIFQFILLSCLFPLWGAAASLNDILITQFKSVFTLSDFASALVQSAFYGGYFLIAIPASLVIKKTSYKIAI LIGLMLYIGGCSLFYPASHMATYTMFLVAIFSIAIGLSFLETSANTYSSMIGHKDHATLRLNISQTFYPVGAISGILLGK YLIFQEGASLEERMVGMTPEQLHSFKLSMLEHTLSPYKYLIFILIAVTFLFVITSFPKCKAVTQTGKSEVKFTDTLKYLA SNTKFKKGIVAQFLYVGMQVAVWSFTIRLALNLSDMNEREASNFMVYSFIGFFIGKFVANFLMTKFKSDLVLLWYSILGV ITLAYTSFVHDFSAVYAAIFASLLFGPCWATIYASVLDTVNQEHREVGGAVVVMSIIGAAVVPAIHGYVSDTLGSLQLAF IVPLFCFAYVGYYFYGKLKENKEK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
deoP | ADD91723.1 | permease DeoP | Not tested | PAI-I AL862 | Protein | 1e-146 | 72 |
unnamed | CAE85172.1 | hypothetical protein | Not tested | PAI V 536 | Protein | 3e-146 | 71 |