Gene Information

Name : HS_0289 (HS_0289)
Accession : YP_718497.1
Strain : Haemophilus somnus 129PT
Genome accession: NC_008309
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : transport system permease
Function : -
COG functional category : F : Nucleotide transport and metabolism
COG ID : COG1972
EC number : -
Position : 289282 - 290541 bp
Length : 1260 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGAGTTCTCTGATTAGCATTATCGGTATCTTCGCTTTATTATTAATAGCCTTTCTTTTATCTAATAATCGTAAGGCGAT
TAATTATCGTACAGTGCTAGGTGCACTATTGATTCAATTTTTATTTGGTGCATTTATTCTTTATGTTCCCGTTGGTCGTC
AGGCACTACAAAGCGTTGCAGGAGCAGTACAATCGGTCATCAATTATGGTAATGAAGGGATCCGTTTTCTATTTAATGGG
TTAGCGCCACAAGCCGATGGTTCTATGGGCTCAGCCGGTTTTGTTTTCGTTATCAACGTCCTTCCAAATATTGTTTTCTT
CTCCGCATTAATCTCCCTACTTTACTATATCGGTGTAATGCAATGGCTGATTAAAATCATCGGCGGAGCATTACAAAAAG
CATTAGGTACATCAAAATCCGAGTCTATGTCGGCAGCTGCCAATATCTTCGTGGGACAAACAGAAGCCCCCTTAGTCATT
AAACCTTATATTAGCAAAATGACAGAATCAGAGCTGTTTGCAGTAATGTGCGGTGGTTTAGCATCTATCGCTGGTTCAGT
CATGGCTGGATATGCCGGAATGGGTGTACCTCTAACCTATCTAATCGCAGCTTCATTTATGGCTGCTCCAGCCGGATTGT
TATTTGCTAAAATTCTTATCCCACAAACTGAAAAATTTAATGATAATTTCGAACAAATACAACAAGAAAAACCAACAAAT
ATTCTTGATGCAGCCGCCGGAGGTGCATCATCTGGTATGCAACTTGCCTTAAATGTGGGTGCGATGTTGATCGCATTTGT
GGCTTTAATTGCATTACTTAACGGAATTCTTGGCACTATCGGAAACTGGATTGGCCAAGAAGGACTTTCTCTTGGCATGA
TCTTTGGTTGGGTTTTCAAGCCGTTAGCCTTCATTATTGGGGTTCCTTGGGAAGAAGCGGAAATTGCTGGTCGTATGATT
GGAACCAAATTAGCAATTAATGAATTTGTTGGTTATTTAGATTTTGTACCATACCTTGCAGCTGATGCAGCGGTGCAACT
AAGTGATAAAACTAAAGCAATTATTACTTTTGCCCTCTGTGGATTTGCAAACTTTAGCTCTATTGCAATTTTAATCGGTG
GCTTAGGGGCAATGGCACCAAATCGTCGTGGTGATATTGCTCGTTTAGGTATAAAAGCGGTAATTGCAGGCTCATTAGCA
AACTTAATGAGTGCAACTATTGCCGGTTTATTTATTGGATTAAGTGGTGCAGCACTGTAA

Protein sequence :
MSSLISIIGIFALLLIAFLLSNNRKAINYRTVLGALLIQFLFGAFILYVPVGRQALQSVAGAVQSVINYGNEGIRFLFNG
LAPQADGSMGSAGFVFVINVLPNIVFFSALISLLYYIGVMQWLIKIIGGALQKALGTSKSESMSAAANIFVGQTEAPLVI
KPYISKMTESELFAVMCGGLASIAGSVMAGYAGMGVPLTYLIAASFMAAPAGLLFAKILIPQTEKFNDNFEQIQQEKPTN
ILDAAAGGASSGMQLALNVGAMLIAFVALIALLNGILGTIGNWIGQEGLSLGMIFGWVFKPLAFIIGVPWEEAEIAGRMI
GTKLAINEFVGYLDFVPYLAADAAVQLSDKTKAIITFALCGFANFSSIAILIGGLGAMAPNRRGDIARLGIKAVIAGSLA
NLMSATIAGLFIGLSGAAL

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
yutK YP_005163383.1 putative sodium/nucleoside cotransporter Not tested Not named Protein 1e-76 49