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Name : lysS (HS_1008) Accession : YP_719219.1 Strain : Haemophilus somnus 129PT Genome accession: NC_008309 Putative virulence/resistance : Virulence Product : lysyl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : J : Translation, ribosomal structure and biogenesis COG ID : COG1190 EC number : 6.1.1.6 Position : 1110793 - 1112283 bp Length : 1491 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGCTGAACTGACTAACATTAACGAACATGAAGTACGTAGGAATAAACTGGCATATATTCGTGAAACAGAAAATTTCGC CTTTCCAAATGATTTTCGGCGCTCTCATTATGCTGTTGAATTACACAACAAATATGATCAAACCACAAAAATTGAATTGG AAATGTTGAAGGTGAATGTAGCTGTCACTGGACGAATTATGACAAAACGTTTTATGGGCAAAATCGCATTTATTACTTTA AAAGATGGTGACAGTTCTATTCAATTATATATTTCACAAGATATAGTTTCTAATGCAGAATTTGAAAAATTTAAGAAATG GGATATTGGTGACATTGTCGGTGTGGAAGGAGCGGTGTTTAAAACAAATACAGATGAGTTATCCATTAATACTAAAAAAG CTCGATTATTAACCAAAGCTTTAAGACCTCTACCAGATAAATTTCATGGTCTGTCAGATCAGGAAATGCGTTACCGCCAA AGATATGTGGATCTAATTGTAAATGAAAAATCCTATAATACTTTTAAATTGAGATCTAAAATACTTGCAGAGATTAGGAA TTATATGGTATCTAATGGATTCATGGAAGTTGAAACACCTATGATGCAAGTTATTCCAGGTGGAGCATCAGCGAGACCTT TCATTACTCATCATAATGCTTTAAATAGCGATTTATATTTGCGGATTTCACCAGAGCTGTTTTTAAAAAGATTAATTGTG GGTGGATTCGATAGGGTATTTGAAATTAATAGAAATTTCCGCAATGAAGGGATTTCTCCACGCCATAATCCTGAGTTTAC TATGATGGAATTATATATGGCTCATGCGGATTACAGAGATCTGATTAAGTTAACAGAAAATTTATTCAGAACAGTGGCGA TTAATACGCTAGGTTCTCCAATTGTAAAATATGGTAATATTGAGTTTGATTTTAGCAAACCTTTCGTTCAGATGACTATG AGAGAAGCTATTATACATTACGGCAATGATATTCAACTTGATGATATTATGTCCTACGAAAGTGCGGTTAAAATTGCACA AAAATTAGGTATTCAAGTAGAAAAAAGTTGGGGATTAGGAAGATTACAATCGGAGATTTTTGAAGAAGTAGCTGAAAAAC ATCTGATTCAACCAACATTTATCACTGAATATCCTGCGGAAATTTCGCCATTGGCAAGACGCAATGATATTGACCCAGAA TATACCGACAGATTTGAGTTTTTCATTGGTGCAAGAGAAATAGGTAATGGTTTCTCAGAATTAAATGATGCGGAAGATCA AGCGGAGCGTTTTAGAGATCAAGTTAAAGCTAAAGAAGCTGGTGACGATGAAGCAATGTTCTATGACGATGATTATGTTA TTGCTTTAGAATACGGTATGCCTCCAACGGCTGGTTTAGGAATTGGGATAGATAGAATGGTGATGCTATTAACTGATAGC CATACCATCCGAGACGTTATTTTATTTCCAACCTTAAAGCCAACGGAATAA Protein sequence : MAELTNINEHEVRRNKLAYIRETENFAFPNDFRRSHYAVELHNKYDQTTKIELEMLKVNVAVTGRIMTKRFMGKIAFITL KDGDSSIQLYISQDIVSNAEFEKFKKWDIGDIVGVEGAVFKTNTDELSINTKKARLLTKALRPLPDKFHGLSDQEMRYRQ RYVDLIVNEKSYNTFKLRSKILAEIRNYMVSNGFMEVETPMMQVIPGGASARPFITHHNALNSDLYLRISPELFLKRLIV GGFDRVFEINRNFRNEGISPRHNPEFTMMELYMAHADYRDLIKLTENLFRTVAINTLGSPIVKYGNIEFDFSKPFVQMTM REAIIHYGNDIQLDDIMSYESAVKIAQKLGIQVEKSWGLGRLQSEIFEEVAEKHLIQPTFITEYPAEISPLARRNDIDPE YTDRFEFFIGAREIGNGFSELNDAEDQAERFRDQVKAKEAGDDEAMFYDDDYVIALEYGMPPTAGLGIGIDRMVMLLTDS HTIRDVILFPTLKPTE |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| unnamed | CAD66193.1 | putative lysil-tRNA synthetase LysU | Not tested | PAI III 536 | Protein | 6e-170 | 69 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| lysS | YP_719219.1 | lysyl-tRNA synthetase | VFG1668 | Protein | 3e-170 | 69 |
